; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg017287 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg017287
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionGDSL esterase/lipase
Genome locationscaffold4:34970034..34971735
RNA-Seq ExpressionSpg017287
SyntenySpg017287
Gene Ontology termsGO:0009751 - response to salicylic acid (biological process)
GO:0010226 - response to lithium ion (biological process)
GO:0016042 - lipid catabolic process (biological process)
GO:0042538 - hyperosmotic salinity response (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
GO:0016788 - hydrolase activity, acting on ester bonds (molecular function)
InterPro domainsIPR001087 - GDSL lipase/esterase
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7021007.1 GDSL esterase/lipase [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.8e-6288.65Show/hide
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XP_022144404.1 GDSL esterase/lipase At5g33370-like [Momordica charantia]5.9e-6385.82Show/hide
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XP_022937718.1 GDSL esterase/lipase At5g33370-like [Cucurbita moschata]8.5e-6287.94Show/hide
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XP_022965808.1 GDSL esterase/lipase At5g33370-like [Cucurbita maxima]4.5e-6389.36Show/hide
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XP_023536783.1 GDSL esterase/lipase At5g33370-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.2e-6288.65Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMW3 Zinc finger protein2.0e-6184.4Show/hide
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        ME PSP  +L P LG IL  + S V QAQ RAFFVFGDSLVDNGNN+YLLTTARADNYPYGIDYPTRRPTGRFSNG NIPDLIS+A+G+PSTLPYLSP+L
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A0A5A7UZR5 GDSL esterase/lipase2.7e-6183.69Show/hide
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        ME PSP     P LGL+L  +GS V QAQ RAFFVFGDSLVDNGNN++LLTTARADNYPYGIDYPTRRPTGRFSNG NIPDLIS+A+G+PSTLPYLSP+L
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        RG+NLLVGANFASAGIGILNDTGIQFLNIIRI QQLEYFRQ
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A0A6J1CS78 GDSL esterase/lipase At5g33370-like2.9e-6385.82Show/hide
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A0A6J1FGR1 GDSL esterase/lipase At5g33370-like4.1e-6287.94Show/hide
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A0A6J1HQ21 GDSL esterase/lipase At5g33370-like2.2e-6389.36Show/hide
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        ME PS       TLGLILLL+GSLV QAQ RAFFVFGDSLVDNGNNDYLLTTARADNYPYGIDYPTRRPTGRFSNG+NIPDLISQA+G+PSTLPYLSP+L
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5PNZ0 GDSL esterase/lipase At5g184308.0e-4773.23Show/hide
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        L+ ++ G +V   +GRAFFVFGDSLVD+GNN+YL+TTARAD+ PYGID+PTRRPTGRFSNG NIPDLIS+A+G     LPYLSPELRG++LL GANFASA
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        GIGILNDTG QF+NIIR+ QQL+YF+Q
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Q8LB81 GDSL esterase/lipase At5g333702.3e-4977.52Show/hide
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        LG  +L V S LV QA  RAF VFGDSLVDNGNND+L TTARADNYPYGID+PT RPTGRFSNG NIPDLIS+ LG  S +PYLSP L+   LL GANFA
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        SAGIGILNDTGIQFLNIIRIT+QLEYF Q
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Q9M2R9 GDSL esterase/lipase At3g504002.1e-2350.82Show/hide
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        V S   Q    A FVFGDSLVD GNN+YL T +RA++ P GID+ P+R  PTGRF+NG  I D++ + LG  S  +PYL+P   G+ LL G N+AS G G
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        ILN TG  F+N + +  Q++YF
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Q9M8Y5 GDSL esterase/lipase LTL18.0e-5576.87Show/hide
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        C  LG ++    +V  L  Q + RAFFVFGDSLVDNGNNDYL+TTARADNYPYGIDYPTRRPTGRFSNG NIPD+IS+A+G PSTLPYLSP L G+NLLV
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        GANFASAGIGILNDTGIQF+NIIRI++Q+EYF Q
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Q9SVU5 GDSL esterase/lipase At4g287803.7e-4474.77Show/hide
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        RAFFVFGDSLVD+GNN+YL+TTARAD+ PYGIDYPT RPTGRFSNG N+PD+IS+ +G+  TLP LSPEL G+ LL+GANFASAGIGILNDTG+QFLNI+
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        RI +Q E F++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G04290.1 Li-tolerant lipase 15.7e-5676.87Show/hide
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        C  LG ++    +V  L  Q + RAFFVFGDSLVDNGNNDYL+TTARADNYPYGIDYPTRRPTGRFSNG NIPD+IS+A+G PSTLPYLSP L G+NLLV
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AT4G28780.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein2.7e-4574.77Show/hide
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        RI +Q E F++
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AT5G18430.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein5.7e-4873.23Show/hide
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        L+ ++ G +V   +GRAFFVFGDSLVD+GNN+YL+TTARAD+ PYGID+PTRRPTGRFSNG NIPDLIS+A+G     LPYLSPELRG++LL GANFASA
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        GIGILNDTG QF+NIIR+ QQL+YF+Q
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AT5G33370.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.6e-5077.52Show/hide
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        LG  +L V S LV QA  RAF VFGDSLVDNGNND+L TTARADNYPYGID+PT RPTGRFSNG NIPDLIS+ LG  S +PYLSP L+   LL GANFA
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        SAGIGILNDTGIQFLNIIRIT+QLEYF Q
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AT5G33370.2 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.6e-5077.52Show/hide
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        LG  +L V S LV QA  RAF VFGDSLVDNGNND+L TTARADNYPYGID+PT RPTGRFSNG NIPDLIS+ LG  S +PYLSP L+   LL GANFA
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        SAGIGILNDTGIQFLNIIRIT+QLEYF Q
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAAGCCTTCTCCTAGATCTGCCTTATGCCCAACTTTAGGTCTCATTTTGTTGCTTGTTGGTAGCTTGGTTTCTCAAGCACAAGGTAGAGCATTCTTCGTTTTCGG
AGACTCTCTCGTCGACAACGGAAACAATGACTACTTGCTCACCACTGCTCGAGCCGATAACTACCCGTACGGCATCGACTATCCGACTCGTAGGCCCACCGGACGTTTCT
CCAATGGCTTCAACATACCTGATCTCATCAGTCAAGCACTTGGGGCTCCCTCTACATTGCCTTATTTGAGCCCTGAACTGAGGGGACAAAACCTTTTGGTTGGGGCCAAC
TTTGCCTCTGCTGGAATTGGGATTCTCAATGACACTGGAATTCAGTTTTTGAACATAATAAGAATCACGCAGCAGTTGGAGTATTTCAGGCAGGGGTTTTATTCTTCTGA
GTACTTCAATTTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAAGCCTTCTCCTAGATCTGCCTTATGCCCAACTTTAGGTCTCATTTTGTTGCTTGTTGGTAGCTTGGTTTCTCAAGCACAAGGTAGAGCATTCTTCGTTTTCGG
AGACTCTCTCGTCGACAACGGAAACAATGACTACTTGCTCACCACTGCTCGAGCCGATAACTACCCGTACGGCATCGACTATCCGACTCGTAGGCCCACCGGACGTTTCT
CCAATGGCTTCAACATACCTGATCTCATCAGTCAAGCACTTGGGGCTCCCTCTACATTGCCTTATTTGAGCCCTGAACTGAGGGGACAAAACCTTTTGGTTGGGGCCAAC
TTTGCCTCTGCTGGAATTGGGATTCTCAATGACACTGGAATTCAGTTTTTGAACATAATAAGAATCACGCAGCAGTTGGAGTATTTCAGGCAGGGGTTTTATTCTTCTGA
GTACTTCAATTTATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEKPSPRSALCPTLGLILLLVGSLVSQAQGRAFFVFGDSLVDNGNNDYLLTTARADNYPYGIDYPTRRPTGRFSNGFNIPDLISQALGAPSTLPYLSPELRGQNLLVGAN
FASAGIGILNDTGIQFLNIIRITQQLEYFRQGFYSSEYFNL