; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg017360 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg017360
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionADP-ribosylation factor 1
Genome locationscaffold4:42307529..42313299
RNA-Seq ExpressionSpg017360
SyntenySpg017360
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0016192 - vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006689 - Small GTPase superfamily, ARF/SAR type
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG8367692.1 hypothetical protein BUALT_Bualt16G0099500 [Buddleja alternifolia]3.4e-6065.85Show/hide
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XP_004149069.1 ADP-ribosylation factor 1 [Cucumis sativus]7.5e-6067.8Show/hide
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XP_022153337.1 ADP-ribosylation factor 1 [Momordica charantia]3.4e-6068.29Show/hide
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XP_022929741.1 ADP-ribosylation factor 1-like [Cucurbita moschata]9.8e-6067.8Show/hide
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XP_022997467.1 ADP-ribosylation factor 1-like [Cucurbita maxima]3.4e-6068.29Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LH74 Uncharacterized protein3.6e-6067.8Show/hide
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A0A1S3BT35 ADP-ribosylation factor 13.6e-6067.8Show/hide
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A0A6J1DIL7 ADP-ribosylation factor 11.6e-6068.29Show/hide
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A0A6J1EP05 ADP-ribosylation factor 1-like4.8e-6067.8Show/hide
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A0A6J1KDZ9 ADP-ribosylation factor 1-like1.6e-6068.29Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23778 ADP-ribosylation factor 11.3e-3341.95Show/hide
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P40940 ADP-ribosylation factor 31.5e-5862.44Show/hide
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P51823 ADP-ribosylation factor 29.6e-3441.95Show/hide
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Q06396 ADP-ribosylation factor 19.6e-3441.95Show/hide
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Q96361 ADP-ribosylation factor 16.6e-5962.93Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23490.1 ADP-ribosylation factor 11.2e-3441.95Show/hide
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AT1G70490.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.2e-3441.95Show/hide
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AT2G24765.1 ADP-ribosylation factor 31.0e-5962.44Show/hide
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AT2G24765.2 ADP-ribosylation factor 31.8e-3555Show/hide
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        MGILFTRMFSS+FGNKEARILVLGLDNAGKTTIL  +      + I  P  G  ++      + Y     Q+ DL            ++ I         
Subjt:  MGILFTRMFSSLFGNKEARILVLGLDNAGKTTILCTISCFSACNLISAPDGGGCLDNPKLYVINYVLFVMQLLDLMLKLCSTITSNSRSGILEDKLVSAN

Query:  SACLLRRPYWRCYFPNTQAIIYVVDSSDTDRLVVAKEEFHAILEEEELRGAVALVFANKQ
              RPYWRCYFPNTQA+IYVVDSSDTDR+ VAKEEFHAILEE+EL+GAV L+FANKQ
Subjt:  SACLLRRPYWRCYFPNTQAIIYVVDSSDTDRLVVAKEEFHAILEEEELRGAVALVFANKQ

AT5G14670.1 ADP-ribosylation factor A1B2.4e-3541.67Show/hide
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        MG+ FT++FS LF  KE RIL++GLD AGKTTIL  +        I  P  G  ++  +   I++ ++ +                   G  +DK+    
Subjt:  MGILFTRMFSSLFGNKEARILVLGLDNAGKTTILCTISCFSACNLISAPDGGGCLDNPKLYVINYVLFVMQLLDLMLKLCSTITSNSRSGILEDKLVSAN

Query:  SACLLRRPYWRCYFPNTQAIIYVVDSSDTDRLVVAKEEFHAILEEEELRGAVALVFANKQDLPGALDDAAVTEALELHKIKNRQWAIFKASAIKGEGLFE
              RP WR YF NTQ +I+VVDS+D DR+V A++E H +L E+ELR AV LVFANKQDLP A++ A +T+ L LH ++ R W I    A  GEGL+E
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Query:  GLDCLEVANSYQPKKN
        GLD L  +N+   K N
Subjt:  GLDCLEVANSYQPKKN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGATTTTGTTTACTCGAATGTTTTCTTCGCTCTTCGGGAATAAGGAAGCTCGGATCCTTGTTCTTGGCCTCGATAATGCTGGGAAAACTACCATTCTCTGT
ACGATTTCTTGTTTTTCTGCTTGCAATTTGATATCGGCTCCAGATGGGGGAGGTTGTCTCGACAATCCCAAGTTGTATGTTATAAACTATGTCCTTTTTGTGATG
CAGCTATTGGATTTAATGTTGAAACTGTGCAGTACAATAACATCAAATTCCAGGTCTGGGATCTTGGAGGACAAACTAGTATCAGCTAATTCTGCTTGCCTTCTG
CGTAGACCATACTGGAGATGCTATTTTCCAAATACGCAAGCTATAATCTATGTGGTTGATTCAAGTGATACTGATAGGCTGGTGGTAGCAAAAGAGGAGTTTCAT
GCGATACTTGAGGAAGAAGAGTTGCGAGGTGCAGTTGCCTTAGTTTTTGCAAATAAGCAGGATCTTCCGGGTGCACTTGATGATGCTGCAGTCACAGAGGCTTTA
GAGTTGCACAAGATTAAGAACCGCCAATGGGCTATATTTAAAGCCTCTGCTATAAAAGGAGAAGGTCTTTTCGAGGGATTGGATTGTCTGGAGGTGGCTAACTCT
TACCAGCCGAAGAAGAACATTTGTGGCACCCAGTTGGAGAATACGGTGTTTAAGCGTTACGACTTGCAGAAGAGAACTCATTTGTCCAAGCGATTTCGC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YQPKKNICGTQLENTVFKRYDLQKRTHLSKRFR