; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg017558 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg017558
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionBEST Arabidopsis thaliana protein match is: s in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink).
Genome locationscaffold4:41556738..41557486
RNA-Seq ExpressionSpg017558
SyntenySpg017558
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586081.1 Transcription initiation factor TFIID subunit 4b, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-6078.79Show/hide
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KAG7020905.1 hypothetical protein SDJN02_17593, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.6e-6179.39Show/hide
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KAG7029810.1 hypothetical protein SDJN02_08153, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.0e-6079.75Show/hide
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XP_022997465.1 uncharacterized protein LOC111492375 [Cucurbita maxima]2.1e-6180.37Show/hide
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         R AQATTIDYSNG       KLET SFLSS+CEFMASPR+SM  SSSSSSSSSPSSL+ESLT
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XP_023546389.1 uncharacterized protein LOC111805512 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.0e-6079.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3BQA0 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B3.1e-5072.46Show/hide
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        M+G+ FHWDMKNKVISRTSS+G SS SIYY GT  +GVPFKWETQPGTPKDPPPQ+LLPPLSPPPAVLSLG+PKP CI+QPK R  PRMRLRFW++  KS
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        R+  R AQ T ID+ N       DKLET SFLSS+CEFMA  SPR+SMSSS  SSSSSSPSS ++SL
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A0A6J1DGF8 uncharacterized protein LOC1110208307.7e-5777.78Show/hide
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                    NGD FGH DKLETSSF+SS+ EFMASPR+S+S  SSSSSSS PSSLLESL
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A0A6J1ENL5 uncharacterized protein LOC1114361412.5e-6079.5Show/hide
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         R AQATTIDYSN       DKLET SFLSS+CEFMASPR+SM SSSSSSSSPSSL+ESLT
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A0A6J1FCU1 Uncharacterized protein5.7e-6078.18Show/hide
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        +R A+A TIDYSN D FG+ DKLET SFLSS+CEFM S RNSM SS     SSSSSPSS  ESLT
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A0A6J1K9Q8 uncharacterized protein LOC1114923751.0e-6180.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40475.1 unknown protein9.7e-0433.55Show/hide
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        + +K+I + SS   SS  IYY G    VPF WET+PGTPK     E   LPPL+PPP+                             S  S    ++++A
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         TI  +       + K   S  +S    F  S  +S SSSS SSSSP S +E
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AT4G25845.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B (TAIR:AT4G25850.2)2.7e-1451.61Show/hide
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        ISR SSVGY    +      EGVPF+WE QPGTP +  P+E++PPLSPPPA+LSLGLPKP   IE+PK    P +++LR W+     R   R+
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AT4G25850.2 OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B2.7e-1451.61Show/hide
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        ISR SSVGY    +      EGVPF+WE QPGTP +  P+E++PPLSPPPA+LSLGLPKP   IE+PK    P +++LR W+     R   R+
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AT5G01790.1 unknown protein2.6e-0433.13Show/hide
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        S  S+   S R  YY G    VPF+WE+ PGTPK P  +   LPPL+PPP+  S           +IR          RRSKKS +       T + + +
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        GD  G   KL  SS        L  E E+      + RN M   SS  SS+  P    +S + F +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGGAAAATTTCATTGGGATATGAAGAACAAAGTCATATCAAGAACCTCTTCAGTTGGTTATTCTTCTCGCAGTATTTACTATTGTGGAACAGTTGAAGGAGTTCC
TTTCAAATGGGAAACACAACCAGGAACTCCCAAAGATCCACCCCCTCAGGAGTTGCTTCCACCTCTCAGCCCTCCGCCGGCAGTTCTCAGCCTCGGGTTACCGAAACCGT
GCATCGAACAACCGAAAATCCGACCTCGACCCCGGATGAGGCTTAGGTTTTGGAGGAGAAGCAAGAAGAGTAGGGAGAGTGAGAGAGTTGCCCAAGCAACAACTATTGAC
TATAGCAATGGAGATCCTTTTGGTCACTATGATAAGTTGGAAACTTCTTCATTTCTTAGCTCTGAATGCGAGTTCATGGCGTCTCCTCGAAATTCAATGTCGTCGTCGTC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YSNGDPFGHYDKLETSSFLSSECEFMASPRNSMSSSSSSSSSPSSLLESLTDFALWVGVA