CuGenDBv2

Gene ID	Spg017568
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	scaffold4:38533159..38538684
RNA-Seq Expression	Spg017568
Synteny	Spg017568
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022149823.1 uncharacterized protein LOC111018164 [Momordica charantia]

8.1e-34

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XP_022929662.1 uncharacterized protein LOC111436176 isoform X1 [Cucurbita moschata]

3.4e-32

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XP_023538020.1 uncharacterized protein LOC111798904 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_023546800.1 uncharacterized protein LOC111805799 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038889680.1 uncharacterized protein LOC120079539 isoform X1 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A6J1D7T0 uncharacterized protein LOC111018164

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A0A6J1ENC3 uncharacterized protein LOC111436176 isoform X1

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A0A6J1FBT5 uncharacterized protein LOC111443988

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A0A6J1HLS7 uncharacterized protein LOC111465369

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A0A6J1K649 uncharacterized protein LOC111492025

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT5G16520.1 unknown protein

1.9e-09

43.53

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        G  +  K+S+T P           SH ED+ IPPPP ++F D    S++D  DI    + LY+YNV LREKLL TQS +  LA K
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Sequences

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CDS sequence

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ATGCCCGAAAGAGCGACACAGAACCAGATATCCCCTCCCACGATTAGCAGACTCTTCGAACTCGACCAAGAACAAGAGCCTCTTATTGAAGATCCTATCCCCCTGCAAAT
TGAAGAGCCTCAATCTGTTCAACAGAGTATGGGGTTGAACGATACAGTACTCATTGATGTAGATGTGGAAGATGAATTCACAGAAGCCATATATGCAGAGGACAACAAAA
TTGACCCAGCTGTTTATCTCCCCATGATCTTTCCGTGGTTGACTGAGCATGGAACTCTCACAAAACATTTGGCTTCCTCCTCACAGCACAACAGAACTAATCTCTATGGA
CAGTTGTGGAAGGGCCCTATGCTGAAAAAAGTTAAACCTCTTCACCATCAAGTACTTGGTTCTACCTATGAGGGGAAGCAAAGCTTAACAGTTCCATTCAAGGGAGATTC
TTCACAACTTGGAGATTTTTCTCATCTGGAAGATATTATTCCACCTCCACCGTCGATAGACTTTAAAGATAGTTCTGATATCGACATGTCCGATATCTTGAAGAATATTG
AAAGTTTGTACGAGTATAATGTATTTCTTAGAGAAAAGCTATTGTCCACTCAATCTGAGGTTCGTGCTTTGGCAACCAAGTCCTCGCCATAA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MPERATQNQISPPTISRLFELDQEQEPLIEDPIPLQIEEPQSVQQSMGLNDTVLIDVDVEDEFTEAIYAEDNKIDPAVYLPMIFPWLTEHGTLTKHLASSSQHNRTNLYG
QLWKGPMLKKVKPLHHQVLGSTYEGKQSLTVPFKGDSSQLGDFSHLEDIIPPPPSIDFKDSSDIDMSDILKNIESLYEYNVFLREKLLSTQSEVRALATKSSP

Spg017568 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome