; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg017925 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg017925
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationscaffold9:33108776..33112234
RNA-Seq ExpressionSpg017925
SyntenySpg017925
Gene Ontology termsGO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0026217.1 hypothetical protein E6C27_scaffold19G001920 [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-2464.17Show/hide
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        SK+  +  +T  +SSKG +  SSS++ PSPMSADQYAMDLGFT VTRSR+R  G   G   ESST PPRPSANL+RP  R+VQM+PP SP S   SSTP 
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        P++YSQAVTP+KRFVPRP+I
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KAA0043136.1 putative Retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-2568.75Show/hide
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        +T  +SSKG + PSSS++ PSP+SADQYAMDLGFT VTR  +RS G   GS  ESST PPRPS NL+RPSS +VQMRPP SP S   SSTP P++YSQAV
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        TP+KRFVPRPEI
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KAA0056175.1 hypothetical protein E6C27_scaffold697G00720 [Cucumis melo var. makuwa]7.4e-2462.5Show/hide
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        S++  +  +T  +SSKG  PSSSS +  SPM++DQYAMDL FT VTRSR+RS   + GS  ESST PPRP ANL+RPS  +VQMRPP SP S   SSTP 
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        P++YSQAVTP+KRFVPRP+I
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KAA0066384.1 hypothetical protein E6C27_scaffold21G004590 [Cucumis melo var. makuwa]9.7e-2462.5Show/hide
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        SK+  +  +T  +SSKG   SSSS + PSP  ADQYAM++GFT VTRSR+RS   + GS  ES+T PPRPS NL+ PSS +VQMRPP SP S   SSTPS
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         ++YSQAVTP+KRFVPRPEI
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TYK11076.1 hypothetical protein E5676_scaffold73G00620 [Cucumis melo var. makuwa]6.7e-2564.75Show/hide
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        +S E+ S   +T  +SSKG  PSSSS + PSPMSADQY MDLGFT V RSR+RS   +  S  ESST PPRP ANL+RPS R+VQMRPP SP S   SST
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        P P++YSQAVTP+KRFVPRP+I
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TM80 Putative Retrotransposon protein5.0e-2668.75Show/hide
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        +T  +SSKG + PSSS++ PSP+SADQYAMDLGFT VTR  +RS G   GS  ESST PPRPS NL+RPSS +VQMRPP SP S   SSTP P++YSQAV
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        TP+KRFVPRPEI
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A0A5A7URC1 Uncharacterized protein3.6e-2462.5Show/hide
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        S++  +  +T  +SSKG  PSSSS +  SPM++DQYAMDL FT VTRSR+RS   + GS  ESST PPRP ANL+RPS  +VQMRPP SP S   SSTP 
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        P++YSQAVTP+KRFVPRP+I
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A0A5D3BPD3 Uncharacterized protein4.7e-2462.5Show/hide
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        SK+  +  +T  +SSKG   SSSS + PSP  ADQYAM++GFT VTRSR+RS   + GS  ES+T PPRPS NL+ PSS +VQMRPP SP S   SSTPS
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         ++YSQAVTP+KRFVPRPEI
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A0A5D3CKX1 Uncharacterized protein3.2e-2564.75Show/hide
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        +S E+ S   +T  +SSKG  PSSSS + PSPMSADQY MDLGFT V RSR+RS   +  S  ESST PPRP ANL+RPS R+VQMRPP SP S   SST
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Query:  PSPSSYSQAVTPEKRFVPRPEI
        P P++YSQAVTP+KRFVPRP+I
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A0A5D3E4J4 Uncharacterized protein7.2e-2564.17Show/hide
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Query:  PSSYSQAVTPEKRFVPRPEI
        P++YSQAVTP+KRFVPRP+I
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGTTTTTGGCCGAAGTCCAGTCTGCACCGTCTCTCTCTCTCCCTCGGCGTTTTTCGGTCGAAACCCAGCTTTCATCGCGTCGTTGTCGTCGTCTGCAACGAAAGTGT
CGTGGCAGCCCTTTTGCACGCCCCTCTTTGGTCAATTCTTGCTGGAAATCAAAACTTAATCGAAAATTTGCGCGATTCAGATCTCGCTTGCCTAGCAGTTCAGAGCCCCT
TCGATCTCGTTTCAGTCAATTCCGCCTCTGTCCAGCAGCATTTTTTGGCATTTTCAGCATCACTTAACGATTATGCGTCGTCTAAGTGTTCGATTGAGTTCGAATCACTT
AAGTTTGATCACCCACTACCCAAGGAGCATTCTAACATGCTGTTCGAGCGACTGAAAAGCCTTGAATATGGTCATTCAGCGAATACCCATTGCCTGTTGTGCCTTAGACA
TGGTTGTCCATTGTCTAAAGAAAGAATGAGTGATAATAAGACAAAAGTCTCATCTTCAAAGGGCAAAAGCCCGTCTTCTTCAAGTACAACACCTTCTCCAATGAGTGCTG
ATCAATACGCTATGGATCTAGGGTTTACTCCGGTAACCCGTTCCAGAGCAAGGTCCATCGGTACACAACCCGGATCGACCATGGAGTCATCTACTCCACCTCCAAGGCCT
TCAGCCAATTTAGTCCGTCCTTCTAGCAGAATCGTCCAAATGAGACCTCCTGTCTCACCTGATTCAAGGATAGGGTCATCAACCCCATCACCCTCTTCATATTCTCAAGC
AGTTACTCCTGAAAAGAGGTTTGTACCTCGTCCTGAAATCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGTTTTTGGCCGAAGTCCAGTCTGCACCGTCTCTCTCTCTCCCTCGGCGTTTTTCGGTCGAAACCCAGCTTTCATCGCGTCGTTGTCGTCGTCTGCAACGAAAGTGT
CGTGGCAGCCCTTTTGCACGCCCCTCTTTGGTCAATTCTTGCTGGAAATCAAAACTTAATCGAAAATTTGCGCGATTCAGATCTCGCTTGCCTAGCAGTTCAGAGCCCCT
TCGATCTCGTTTCAGTCAATTCCGCCTCTGTCCAGCAGCATTTTTTGGCATTTTCAGCATCACTTAACGATTATGCGTCGTCTAAGTGTTCGATTGAGTTCGAATCACTT
AAGTTTGATCACCCACTACCCAAGGAGCATTCTAACATGCTGTTCGAGCGACTGAAAAGCCTTGAATATGGTCATTCAGCGAATACCCATTGCCTGTTGTGCCTTAGACA
TGGTTGTCCATTGTCTAAAGAAAGAATGAGTGATAATAAGACAAAAGTCTCATCTTCAAAGGGCAAAAGCCCGTCTTCTTCAAGTACAACACCTTCTCCAATGAGTGCTG
ATCAATACGCTATGGATCTAGGGTTTACTCCGGTAACCCGTTCCAGAGCAAGGTCCATCGGTACACAACCCGGATCGACCATGGAGTCATCTACTCCACCTCCAAGGCCT
TCAGCCAATTTAGTCCGTCCTTCTAGCAGAATCGTCCAAATGAGACCTCCTGTCTCACCTGATTCAAGGATAGGGTCATCAACCCCATCACCCTCTTCATATTCTCAAGC
AGTTACTCCTGAAAAGAGGTTTGTACCTCGTCCTGAAATCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRFWPKSSLHRLSLSLGVFRSKPSFHRVVVVVCNESVVAALLHAPLWSILAGNQNLIENLRDSDLACLAVQSPFDLVSVNSASVQQHFLAFSASLNDYASSKCSIEFESL
KFDHPLPKEHSNMLFERLKSLEYGHSANTHCLLCLRHGCPLSKERMSDNKTKVSSSKGKSPSSSSTTPSPMSADQYAMDLGFTPVTRSRARSIGTQPGSTMESSTPPPRP
SANLVRPSSRIVQMRPPVSPDSRIGSSTPSPSSYSQAVTPEKRFVPRPEI