; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg018337 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg018337
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionReverse transcriptase domain-containing protein
Genome locationscaffold3:13153741..13159013
RNA-Seq ExpressionSpg018337
SyntenySpg018337
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR036691 - Endonuclease/exonuclease/phosphatase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ADN34145.1 hypothetical protein [Cucumis melo subsp. melo]6.2e-2967.89Show/hide
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        +PIIEPE+Q
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KAA0053156.1 hypothetical protein E6C27_scaffold1248G00100 [Cucumis melo var. makuwa]6.2e-2954.97Show/hide
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        +PIIEP +Q               S +     E+ +P+YDLDD +L+SQPM
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KAA0066384.1 hypothetical protein E6C27_scaffold21G004590 [Cucumis melo var. makuwa]3.2e-3359.18Show/hide
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        DQYAM++GFT VTRSR+R+  IR  S  ES+TPPRPS NL+ PS GVVQ+RP  SP S   SSTPS ++YS AVTP KRFV RPEIK+YFQK +V+ +PI
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Query:  IEPEFQDFQRILQMAASTTSESPASSAQGEEN--EPDYDLDDPYLNS
        IE E+       Q+ AS++S+SP+SS Q +E   +P+YDLDDP+L+S
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KAA0066421.1 hypothetical protein E6C27_scaffold21G005030 [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-2968.81Show/hide
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        MS DQYAMDLGFT VTRSR+R+  IR  S  ESSTPPRPSANL+RP GG VQ+RP  SP S   SSTP P++YS  VTP KRFV RPEIK+YFQKS+V+ 
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        + IIEPE+Q
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TYJ98361.1 hypothetical protein E5676_scaffold232G00950 [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-2948.4Show/hide
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        MS DQYAMDLG+T V +SR+++ GI   SPMESSTPPRPS NL+ P G V+Q+R   SP S   SST  P++YS AVTP K+FV R EIK+YFQK +VI 
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Query:  EPIIEPEFQ----------------------------------DFQRILQMAASTTSES-PASSAQGEENEP---DYDLDDPYLNSQP
        +PIIE E+Q                                  DFQR+L  A +T+S S PA S   E+ E    +YDLDDP+L+SQP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UFZ9 Uncharacterized protein3.0e-2954.97Show/hide
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        MS DQYAM LGFT +T+S++R+ GIR  SP ES TPPRP ANL+RPSG VVQ+R   SP S   SSTP P++YS AVTP KRFV R EIK+YFQK  V+ 
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        +PIIEP +Q               S +     E+ +P+YDLDD +L+SQPM
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A0A5D3BI61 Uncharacterized protein1.4e-2948.4Show/hide
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        MS DQYAMDLG+T V +SR+++ GI   SPMESSTPPRPS NL+ P G V+Q+R   SP S   SST  P++YS AVTP K+FV R EIK+YFQK +VI 
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Query:  EPIIEPEFQ----------------------------------DFQRILQMAASTTSES-PASSAQGEENEP---DYDLDDPYLNSQP
        +PIIE E+Q                                  DFQR+L  A +T+S S PA S   E+ E    +YDLDDP+L+SQP
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A0A5D3BM67 Uncharacterized protein1.0e-2968.81Show/hide
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        MS DQYAMDLGFT VTRSR+R+  IR  S  ESSTPPRPSANL+RP GG VQ+RP  SP S   SSTP P++YS  VTP KRFV RPEIK+YFQKS+V+ 
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Query:  EPIIEPEFQ
        + IIEPE+Q
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A0A5D3BPD3 Uncharacterized protein1.5e-3359.18Show/hide
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        DQYAM++GFT VTRSR+R+  IR  S  ES+TPPRPS NL+ PS GVVQ+RP  SP S   SSTPS ++YS AVTP KRFV RPEIK+YFQK +V+ +PI
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        IE E+       Q+ AS++S+SP+SS Q +E   +P+YDLDDP+L+S
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E5GCE6 Uncharacterized protein3.0e-2967.89Show/hide
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Query:  EPIIEPEFQ
        +PIIEPE+Q
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTGATGATCAATACGCTATGGATTTAGGGTTTACTCTGGTAACCCGATCTAGAGCAAGAACGGGCGGCATACGTCCAATGTCTCCAATGGAGTCATCCACTCCACC
AAGGCCTTCGGCCAACCTAGTCCGTCCTTCTGGCGGAGTTGTTCAATTGAGACCTCTAGTCTCACCAGATTCAAGGATAGGGTCATCAACCCCGTCACCTTCTTCTTATT
CTCACGCTGTTACACCAAAAAAGAGGTTTGTACTTCGCCCTGAGATCAAAACTTATTTTCAAAAATCTCTGGTTATCACTGAACCCATCATTGAACCAGAATTTCAAGAC
TTCCAGAGGATTCTACAAATGGCAGCCTCCACCACAAGCGAGTCACCTGCTTCTTCTGCACAAGGAGAAGAGAACGAACCAGACTACGATCTGGATGATCCATACCTCAA
CTCACAACCCATGAAATTGAGTCTTGAATTGGAATGGGATGATTTGGAGATTCTCTGGAATATACAGATACTCAGAATCGAGTCAAAAAAGTTAACTTGGGATCTTCTAA
GAAATCTTAAAAGGATTGATAATCAACCATGGCTCCTAGGTGGTGATTTTAATGAGATTTTGAGAAATGATGAAAAAGTTGGTGGTCCTCAAAGGGACAGTAGATGTTTG
AAAGCTTTCAGACAAGCCCTAGATGATTGTAACCTTAAAAGCATAGAACCTTCAGGAGATCCTCTAACTTGGCATGGGAAAAGAGGTGGTATTCACATCTGGAAAAACTT
GGATCGGTTTCTTTGTGATCCAAAATTTGAAGATTTGTTTGGCAACTATAGAGTGAACAATCTTGACTGGCAATTCAGATTCGAGAAAGTTTGGACAAGACACGAGGAGT
GCAAGGATTTGGTTGAGAAAAATGGCTTTTGGAGTGAAGGTATGACATCTTTGTCCTCTCTTTCATATGACCTAAATAATGTTTCTAATGCATTGTCTAAATGGGGAAAG
AATATTAACCAACAGAGGAAGAATAGAATAAAAGAATGTAAGAATGCTCTAAAAGATGCTTATAATAGTATTCCTTTTGTTGATAAAGATGTCATCCATGGGATTGAATT
TTGGCTTGATAGACTCTTAGAAGAAGAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTGATGATCAATACGCTATGGATTTAGGGTTTACTCTGGTAACCCGATCTAGAGCAAGAACGGGCGGCATACGTCCAATGTCTCCAATGGAGTCATCCACTCCACC
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AATATTAACCAACAGAGGAAGAATAGAATAAAAGAATGTAAGAATGCTCTAAAAGATGCTTATAATAGTATTCCTTTTGTTGATAAAGATGTCATCCATGGGATTGAATT
TTGGCTTGATAGACTCTTAGAAGAAGAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSDDQYAMDLGFTLVTRSRARTGGIRPMSPMESSTPPRPSANLVRPSGGVVQLRPLVSPDSRIGSSTPSPSSYSHAVTPKKRFVLRPEIKTYFQKSLVITEPIIEPEFQD
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