; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg020028 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg020028
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionDNA-dependent metalloprotease WSS1-like isoform X1
Genome locationscaffold1:28213703..28220046
RNA-Seq ExpressionSpg020028
SyntenySpg020028
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0008237 - metallopeptidase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001876 - Zinc finger, RanBP2-type
IPR013536 - WLM domain
IPR036443 - Zinc finger, RanBP2-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022151616.1 DNA-dependent metalloprotease WSS1-like isoform X1 [Momordica charantia]4.5e-17089.12Show/hide
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XP_022967821.1 DNA-dependent metalloprotease WSS1-like isoform X1 [Cucurbita maxima]1.4e-17689.47Show/hide
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XP_022967822.1 DNA-dependent metalloprotease WSS1-like isoform X2 [Cucurbita maxima]8.0e-17591.52Show/hide
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XP_023543567.1 DNA-dependent metalloprotease WSS1-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-17290.61Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DV14 LOW QUALITY PROTEIN: DNA-dependent metalloprotease WSS1-like2.8e-16588.15Show/hide
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        S+DAE+CLACGEWRYSYGP IST  P IG
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A0A6J1DF71 DNA-dependent metalloprotease WSS1-like isoform X12.2e-17089.12Show/hide
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A0A6J1EKF1 DNA-dependent metalloprotease WSS1-like isoform X12.5e-17491.21Show/hide
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A0A6J1HRV8 DNA-dependent metalloprotease WSS1-like isoform X23.8e-17591.52Show/hide
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A0A6J1HT53 DNA-dependent metalloprotease WSS1-like isoform X17.0e-17789.47Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O94580 DNA-dependent metalloprotease WSS1 homolog 21.6e-0828.21Show/hide
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        ++ A + LE++     ++ IM   RW V  LSE  P      +   +G+N   G  I+LR+R    +  F  Y+ +  T++HEL H VHG H++ F+ L 
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         +L KE +     G  G+                +   +  R   L+AAE R + G
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P38838 DNA-dependent metalloprotease WSS15.2e-2837.85Show/hide
Query:  KIGEEDARKVLEKIAKQVQPIMRKRRWKVETLSEFYPDNPGLMGVNIGGGQEIKLRIRRPNNEWDFFPYEQILDTMLHELCHIVHGPHNADFYSLLDELR
        K  +EDA  ++++IA +V  +M++  +KV  L EFYP +  L+G+N+  G +I LR+R   +E+ F P E I+ TMLHEL H + GPH+  FY+ LDEL 
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Query:  KECEELMCKGITGTGQGFDLRGRRLGG----ISQQPPLSSLRQTTLSAAENRARGGPSGPKRLGGDSNMKAVLSPIQAAAMAAERRLQDDLWCGSKSLEN
             +  +G+  T  G    G+RLGG     S + P++ +  T       R +G   G     G S++    SP + AA AAERR +DD WCG    +N
Subjt:  KECEELMCKGITGTGQGFDLRGRRLGG----ISQQPPLSSLRQTTLSAAENRARGGPSGPKRLGGDSNMKAVLSPIQAAAMAAERRLQDDLWCGSKSLEN

Query:  NSDR--AKNMSSSI
        N D+  + N+SSS+
Subjt:  NSDR--AKNMSSSI

Q9P7B5 DNA-dependent metalloprotease WSS1 homolog5.2e-1232.65Show/hide
Query:  VRLEDSDHDEPLFSAMDLNDLNKVWEIKPLKKIGEEDARKVLEKIAKQVQPIMRKRRWKVETLSEFYPDNPGLMGVNIGGGQEIKLRIRRPNNEWDFFPY
        +R+ D DH              K+  I  +K    + +   L++IA    PIM++  + V +L E    N    G N   G+ I+L +R  +N W   P+
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Query:  EQILDTMLHELCHIVHGPHNADFYSLLDELRKECEELMCKGITGTGQ
        E ++D  LHELCHI  GPH+  F+S L  LR     L  KG  G G+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55915.1 zinc ion binding4.0e-10049.88Show/hide
Query:  SAMDLNDLNKVWEIKPLK-KIGEEDARKVLEKIAKQVQPIMRKRRWKVETLSEFYPDNPGLMGVNIGGGQEIKLRIRRPNNEWDFFPYEQILDTMLHELC
        S+ +L DLNKVWEIK LK K  E++ARK+LEK+A QVQPIM +R+W+V+ LSEF P NP L+GVN+  G ++KLR+RR N++ DF  Y +ILDTMLHELC
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Query:  HIVHGPHNADFYSLLDELRKECEELMCKGITGTGQGFDLRGRRLGGISQQPPLSSLRQTTLSAAENRARGG---PSGPKRLGGDSNMKAVLSPIQAAAMA
        H  HGPHNA FY L DELRKECEELM KGITGTGQGFD+ G+RLGG+S+QP LS LR T  +AAE R R G   PSGP+RLGGDS++ + LSPIQAAAMA
Subjt:  HIVHGPHNADFYSLLDELRKECEELMCKGITGTGQGFDLRGRRLGGISQQPPLSSLRQTTLSAAENRARGG---PSGPKRLGGDSNMKAVLSPIQAAAMA

Query:  AERRLQDDLWCGSKSL------ENNSDRAKNMSS-----------------------SIGPS-------------------------RTSNVFTPSVISQ
        AERRL DD+WCGS+S       EN+SD  K   S                       S  PS                         R+     PS    
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        T  G  F              +   +RLGG +Q   L + R+++++AA  R
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Sequences Show/hide sequences
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DAERCLACGEWRYSYGPPISTPGPYIGT