; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg020518 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg020518
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptiondynamin-related protein 3A-like
Genome locationscaffold1:36310604..36317895
RNA-Seq ExpressionSpg020518
SyntenySpg020518
Gene Ontology termsGO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003130 - Dynamin GTPase effector
IPR020850 - GTPase effector domain
IPR022812 - Dynamin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588740.1 Dynamin-related protein 3A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.4e-4087.5Show/hide
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KAG7022524.1 Dynamin-related protein 3A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.4e-4087.5Show/hide
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XP_022927872.1 dynamin-related protein 3A-like [Cucurbita moschata]2.4e-4087.5Show/hide
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XP_022988688.1 dynamin-related protein 3A-like [Cucurbita maxima]8.9e-4086.54Show/hide
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XP_023531620.1 dynamin-related protein 3A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-4087.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1EIE6 dynamin-related protein 3A-like1.1e-4087.5Show/hide
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A0A6J1GKC0 dynamin-related protein 3A-like isoform X17.6e-3775.63Show/hide
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        +FL+   +R+L +V  K L
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A0A6J1I4H7 dynamin-related protein 3B-like isoform X22.2e-3676.07Show/hide
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        GG GSSSWGISSIFGSN SD+ + VKENS KKSFGEP H+VEQSFSMI LREPP VLRPSES TEQEAIEIAITKLLLRSYYDIVRK+ ED+VPK IM+F
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        L+   +R+L +V  K L
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A0A6J1I716 dynamin-related protein 3A-like isoform X17.6e-3775.63Show/hide
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        +FL+   +R+L +V  K L
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A0A6J1JN11 dynamin-related protein 3A-like4.3e-4086.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P21576 Vacuolar protein sorting-associated protein 11.3e-0431.82Show/hide
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        S S+  V E   K  F     + +    +  L  PP VL+ +   TE+E +E  + KLL+ SY+ IV+++  D +PK +M  LI++ +
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Q8LFT2 Dynamin-related protein 3B7.1e-2456.14Show/hide
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        P   GS+SW G SSIF   GSD + + K N   K F E    V Q+ S I L+EPPT+L+ SE+H+EQE++EI ITKLLL+SYYDIVRK+ ED VPK IM
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        HFL+   +REL +V
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Q8S944 Dynamin-related protein 3A7.1e-2457.27Show/hide
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        WGI SIF   G D+R   K++   K F E   ++  + SMI L+EPP VLRP+E+H+EQEA+EI ITKLLLRSYYDIVRK+ ED VPK IMHFL+   +R
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        EL +V  K L
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Q94464 Dynamin-A1.1e-0531.25Show/hide
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        N  GG  SSS     +  S+ S  +TS   N+   S    ++  +  F     +L + P++++  +  T +E  E  + + LL SY++IV+K+ +D VPK
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         IMHFL+ + +E
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G14120.1 dynamin related protein5.1e-2556.14Show/hide
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        P   GS+SW G SSIF   GSD + + K N   K F E    V Q+ S I L+EPPT+L+ SE+H+EQE++EI ITKLLL+SYYDIVRK+ ED VPK IM
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        HFL+   +REL +V
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AT2G14120.2 dynamin related protein5.1e-2556.14Show/hide
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AT2G14120.3 dynamin related protein5.1e-2556.14Show/hide
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        P   GS+SW G SSIF   GSD + + K N   K F E    V Q+ S I L+EPPT+L+ SE+H+EQE++EI ITKLLL+SYYDIVRK+ ED VPK IM
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AT4G33650.1 dynamin-related protein 3A5.1e-2557.27Show/hide
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Query:  ELGSVNAKGL
        EL +V  K L
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AT4G33650.2 dynamin-related protein 3A5.1e-2557.27Show/hide
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        WGI SIF   G D+R   K++   K F E   ++  + SMI L+EPP VLRP+E+H+EQEA+EI ITKLLLRSYYDIVRK+ ED VPK IMHFL+   +R
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        EL +V  K L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAATCCTCTGAGATTTCTTCTTTTTGGGTTAAGAAAGAGAGAGACGTGGTGGATTTGAACTTCAATTCCTTTTTGGTGGTTTCTAGGTTGTTTGCTCATTACTTCTG
GAAGGACGTTCAAATTACTTTGGAAAATTATTTCCAATCTAGAATTTCACTTAATCCATTTATGTATGACAAGACTTTTGTAAAGACTGATGAAGATTTTTCTAATTTGA
ATTTTGATGCGGATGTAATAAAAGTTGAGGAAAGCAATTGTGGTTTCATCCCAACAGAGATTGATGTCAAGGATGGGAACATTAGAATTTTTTCTCTCCGTTTTGGCGAT
ATAGCCTCTGTTGACCTTCCAAATGTTAATATGAGTAGTGCAGAATCAGTTTTTCCTATTCCAGAAACAGAGTTGGCTGATCAGTTCGGAGAAGATTCTTTTGCAGAAGC
TTTTGAAAATCTATATGACGAGAATGAACAAGGAGACATGAGGACTTGGAGCATTTACTGTGGAAGTACTAGTTTGCTAACTACCTTTGGTTCTGTTGGAGGACTTCGTT
TGGGGTTAGCAAGTATGTACGAGTTTTCCTCATTAATATCCTTCTGTAACTTGCCAGGAGGTACAGGTAGTTCTAGTTGGGGGATTTCATCTATTTTTGGTAGTAATGGC
AGTGATAGCCGTACTTCTGTTAAAGAAAATTCACCAAAAAAATCATTTGGTGAGCCTCATCATAATGTGGAGCAATCTTTCTCAATGATCCAGTTGAGAGAGCCACCAAC
TGTCTTGAGGCCCTCAGAAAGCCATACGGAGCAGGAGGCTATTGAAATTGCTATAACTAAACTGCTATTGAGATCCTACTATGACATTGTTAGGAAGAGTACAGAAGACT
TTGTACCTAAAGTCATAATGCATTTCCTGATCCTAAGAAGGAGAGAGTTGGGAAGTGTAAACGCTAAAGGTTTGAGAGAATCTGAATCATCTATTCCATTCACGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAATCCTCTGAGATTTCTTCTTTTTGGGTTAAGAAAGAGAGAGACGTGGTGGATTTGAACTTCAATTCCTTTTTGGTGGTTTCTAGGTTGTTTGCTCATTACTTCTG
GAAGGACGTTCAAATTACTTTGGAAAATTATTTCCAATCTAGAATTTCACTTAATCCATTTATGTATGACAAGACTTTTGTAAAGACTGATGAAGATTTTTCTAATTTGA
ATTTTGATGCGGATGTAATAAAAGTTGAGGAAAGCAATTGTGGTTTCATCCCAACAGAGATTGATGTCAAGGATGGGAACATTAGAATTTTTTCTCTCCGTTTTGGCGAT
ATAGCCTCTGTTGACCTTCCAAATGTTAATATGAGTAGTGCAGAATCAGTTTTTCCTATTCCAGAAACAGAGTTGGCTGATCAGTTCGGAGAAGATTCTTTTGCAGAAGC
TTTTGAAAATCTATATGACGAGAATGAACAAGGAGACATGAGGACTTGGAGCATTTACTGTGGAAGTACTAGTTTGCTAACTACCTTTGGTTCTGTTGGAGGACTTCGTT
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AGTGATAGCCGTACTTCTGTTAAAGAAAATTCACCAAAAAAATCATTTGGTGAGCCTCATCATAATGTGGAGCAATCTTTCTCAATGATCCAGTTGAGAGAGCCACCAAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKSSEISSFWVKKERDVVDLNFNSFLVVSRLFAHYFWKDVQITLENYFQSRISLNPFMYDKTFVKTDEDFSNLNFDADVIKVEESNCGFIPTEIDVKDGNIRIFSLRFGD
IASVDLPNVNMSSAESVFPIPETELADQFGEDSFAEAFENLYDENEQGDMRTWSIYCGSTSLLTTFGSVGGLRLGLASMYEFSSLISFCNLPGGTGSSSWGISSIFGSNG
SDSRTSVKENSPKKSFGEPHHNVEQSFSMIQLREPPTVLRPSESHTEQEAIEIAITKLLLRSYYDIVRKSTEDFVPKVIMHFLILRRRELGSVNAKGLRESESSIPFT