; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg021329 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg021329
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationscaffold6:45329992..45334507
RNA-Seq ExpressionSpg021329
SyntenySpg021329
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AFK39207.1 unknown [Lotus japonicus]1.7e-9283.18Show/hide
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RYR78225.1 hypothetical protein Ahy_A01g002959 isoform A [Arachis hypogaea]2.6e-9383.18Show/hide
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XP_004147230.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucumis sativus]1.2e-9086.34Show/hide
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XP_016187794.1 GTP-binding protein YPTM2 isoform X3 [Arachis ipaensis]1.2e-9081.98Show/hide
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XP_022965188.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucurbita maxima]3.5e-9085.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5E9 Uncharacterized protein5.8e-9186.34Show/hide
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A0A1S3BJX6 GTP-binding protein YPTM2-like5.8e-9186.34Show/hide
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A0A445ERW6 Uncharacterized protein1.2e-9383.18Show/hide
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A0A6J1HN53 GTP-binding protein YPTM2-like1.7e-9085.85Show/hide
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I3SG15 Uncharacterized protein8.1e-9383.18Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P31584 GTP-binding protein yptV14.1e-8690.29Show/hide
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P40392 Ras-related protein RIC11.6e-8589.71Show/hide
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Q05737 GTP-binding protein YPTM25.8e-8892Show/hide
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Q39571 GTP-binding protein YPTC16.4e-8790.86Show/hide
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Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b1.2e-8579.51Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 51.9e-8688Show/hide
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.2e-7777.53Show/hide
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        QWL+EIDRYA+E+V KLL+GNK+D+  +KVVS ET +A ADE+GIPF+ETSAK + NVEQAF+ +A EIK ++GS  N
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C1.5e-8679.51Show/hide
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AT5G03520.1 RAB GTPase homolog 8C5.1e-6367.25Show/hide
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        +YDYL KLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DD++  S+I+TIG+DFKIRTVELDGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDVTD+ SFNN++ W+
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          I+++AS+NVNK+LVGNK+D+  +K  V     +A ADE GI F ETSAK+  NVE  FM++A +IK RL
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A8.6e-8779.51Show/hide
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         C +S
Subjt:  NCANS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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