; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg021649 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg021649
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionABC transporter G family member 12 like
Genome locationscaffold2:16437595..16441788
RNA-Seq ExpressionSpg021649
SyntenySpg021649
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008443648.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487195 [Cucumis melo]3.7e-14283.53Show/hide
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XP_022933922.1 uncharacterized protein LOC111441188 [Cucurbita moschata]6.3e-14283.23Show/hide
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XP_022973871.1 uncharacterized protein LOC111472460 [Cucurbita maxima]3.7e-14283.53Show/hide
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XP_023520646.1 uncharacterized protein LOC111784055 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.5e-14383.83Show/hide
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XP_038879445.1 uncharacterized protein LOC120071318 [Benincasa hispida]3.0e-14485.63Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B999 uncharacterized protein LOC1034871951.8e-14283.53Show/hide
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A0A5D3CX50 Uncharacterized protein3.4e-10987.87Show/hide
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        FTGREKYKRQLWATSAL+NPTTSVQEMVM+STS+LNIKWTI+GKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLF
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        AS EAGKDLADSVSSL GRVSTEKQNLEMFPDPSGDP+K
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A0A6J1DTK7 uncharacterized protein LOC1110238782.1e-13882.99Show/hide
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        MSTCVSSP SLAA SA AA AIFR   RRGAA   +V PPPHCRHAF L             RAAANDSNSTDQLT ES VERSEADKIVDGMDFGELCN
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Query:  EFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRSIGNFAVFVKYKMKFREKVIEIEFKREMQDPVRKFTGREKYKRQLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNI
        EFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRS+GNFAVFVKYK                 DPVRKFTGREKYKRQ+W  SALENPTTSVQEMVMVST ILNI
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        +KFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFL ATL
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A0A6J1F169 uncharacterized protein LOC1114411883.1e-14283.23Show/hide
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A0A6J1I9U0 uncharacterized protein LOC1114724601.8e-14283.53Show/hide
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        FEC+SSPLVESTARQLA+DILQLRQGDRS+GNFAVFVKYK                 DP+RKFTGREKYKR+LWATSALENPTTSVQEMVMVSTS+LNIK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G65230.1 Uncharacterized conserved protein (DUF2358)1.5e-8559.32Show/hide
Query:  DQLTVESAVERSEADKIVDGMDFGELCNEFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRSIGNFAVFVKYKMKFREKVIEIEFKREMQDPVRKFTGREKYKR
        D    E ++++SE DK+VD +DFGELCN+FEC SSP VESTARQL RDIL++R+G+R+   +AV VKYK                 DPVR FTGREKYKR
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Query:  QLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASTEAGKDL
         +W TS LENPT +VQEMVM+STS+L IKWT+KGKPKS++AA+ GDLI+KV S+FTLNQISGQV EHEE WD+SSSS I+QA+FW SR LFA++E+ KD+
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Query:  ADSVSSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL
        AD    L   ++T K++ +++ DP+ DP+KFFQ +++F+RD YQ AL LAI+YFVVQFL+ T+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTACCTGCGTTTCCTCTCCTTCTCTCGCCGCTCCCTCTGCAGCAGCGGCCGCCGCAATCTTCCGCCGCAAGAGCCGCCGTGGTGCCGCCACACCTCTCGCCGTTCA
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TGACGGTGGAATCCGCCGTCGAAAGATCGGAGGCCGATAAGATCGTCGACGGCATGGATTTCGGCGAGCTCTGCAACGAATTCGAGTGCATAAGCAGTCCCTTGGTTGAA
TCCACCGCCAGGCAACTTGCTAGAGACATTCTTCAACTTCGCCAAGGCGATCGATCTATTGGAAATTTCGCCGTCTTCGTCAAGTATAAGATGAAATTTAGAGAGAAGGT
GATTGAAATTGAGTTCAAACGTGAAATGCAGGATCCGGTTAGGAAATTCACGGGGCGAGAGAAGTACAAAAGACAACTCTGGGCAACCAGTGCGCTCGAGAATCCAACTA
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ACCCTTCTGGTGATCCTAGCAAGTTCTTTCAAGGTGAGGACAACTTTCAAAGAGATGCATACCAGTTTGCACTACTGCTGGCAATCCTCTATTTTGTTGTACAGTTTTTG
AGGGCCACACTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTACCTGCGTTTCCTCTCCTTCTCTCGCCGCTCCCTCTGCAGCAGCGGCCGCCGCAATCTTCCGCCGCAAGAGCCGCCGTGGTGCCGCCACACCTCTCGCCGTTCA
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AGGGCCACACTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSTCVSSPSLAAPSAAAAAAIFRRKSRRGAATPLAVHPPPHCRHAFPLRGLNFFFQSLSYNRAAANDSNSTDQLTVESAVERSEADKIVDGMDFGELCNEFECISSPLVE
STARQLARDILQLRQGDRSIGNFAVFVKYKMKFREKVIEIEFKREMQDPVRKFTGREKYKRQLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLII
KVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASTEAGKDLADSVSSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFL
RATL