; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg022115 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg022115
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationscaffold2:5838694..5839523
RNA-Seq ExpressionSpg022115
SyntenySpg022115
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7021750.1 hypothetical protein SDJN02_15477, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.9e-8093.44Show/hide
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XP_022135541.1 uncharacterized protein DDB_G0271670-like [Momordica charantia]1.9e-7986.21Show/hide
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          R
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XP_022933728.1 uncharacterized protein LOC111441057 [Cucurbita moschata]4.9e-8093.44Show/hide
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XP_022966156.1 uncharacterized protein LOC111465917 [Cucurbita maxima]4.9e-8093.44Show/hide
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XP_023530348.1 uncharacterized protein LOC111792947 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-7992.9Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LW36 Uncharacterized protein8.4e-7890.81Show/hide
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        VVK+QS QKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGV SQPSTPYSSNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGD+++RALASLIRPSSHSQRRRV
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A0A5A7U461 Putative serine-rich protein-like protein7.1e-7790.27Show/hide
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        VVK+QS+QKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGV S PSTPYSSNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGD+++RALASLIRPSSHSQRRRV
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A0A6J1C124 uncharacterized protein DDB_G0271670-like9.0e-8086.21Show/hide
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        G+QVVKRQ NQKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKG PSQPSTPYSSNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALASLIRPSSHSQRRR         FRP+
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Query:  VRR
          R
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A0A6J1F5M8 uncharacterized protein LOC1114410572.4e-8093.44Show/hide
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A0A6J1HNK6 uncharacterized protein LOC1114659172.4e-8093.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein4.2e-0550Show/hide
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        G++ + RQ++  +T C+CSPTTHPGSFRC +H+ +  Q
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related7.6e-3957.07Show/hide
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        S  KS+GPVLRS SPSGRF G YS +  SSSSSAFASSTS+  +   S+FF             RS SP+RVNL  ++ P + S R+SLD RSISP N+ 
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        ISV      NQ         R CMCSPTTHPGSFRCSLHK V +   Q +  Y++N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL +LIRPSSH  +RR
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related8.2e-0935.11Show/hide
Query:  SSSSSSAFASSTSTFSTKNPSSFFRRSVSPSRVNLQGSSSPSASSVRFSLDRSISPNRPISVLTRSGGNQVVKRQSNQKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKG
        SS S     SS+      +     +RS SP   NL         ++R       S  +P SV+T S  +Q        KR C+CSPTTHPGSFRCS H+ 
Subjt:  SSSSSSAFASSTSTFSTKNPSSFFRRSVSPSRVNLQGSSSPSASSVRFSLDRSISPNRPISVLTRSGGNQVVKRQSNQKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKG

Query:  VPSQPSTPYSS------NR----------LNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRAL-ASLIRPSS-HSQRRRVVSDDEDGGFRPQVRR
        +  + S   +S      NR          LN R+ A+ NSL +IG VE +  +R+L A+L +PSS HS RR          FRP++ R
Subjt:  VPSQPSTPYSS------NR----------LNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRAL-ASLIRPSS-HSQRRRVVSDDEDGGFRPQVRR

AT5G25280.1 serine-rich protein-related4.2e-3754.31Show/hide
Query:  SSRKSSGPVLRSLSPSGRFYGSYSS--PSSS-SSSAFASSTSTFSTKNPSSFF----------RRSVSPSRVNLQGSSSPSASSVRFSLD-RSISPNRPI
        ++R +    LRS SPSGRF G YS+  PSSS SSS FASSTS+  +   ++FF           RS SP+RVNL  +S+P   S R+S+D RSISPNR I
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Query:  SVLTRSGGNQVVKRQSNQKRTCMCSPTTHPGSFRCSLHKGVPS---QPSTPYSSNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALASLIRPSSHSQRRR
        +V +    N    +  + +R CMCSPTTHPGSFRCSLHK V +   Q +  Y++N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL +LIRPSSH  +RR
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related4.2e-3754.31Show/hide
Query:  SSRKSSGPVLRSLSPSGRFYGSYSS--PSSS-SSSAFASSTSTFSTKNPSSFF----------RRSVSPSRVNLQGSSSPSASSVRFSLD-RSISPNRPI
        ++R +    LRS SPSGRF G YS+  PSSS SSS FASSTS+  +   ++FF           RS SP+RVNL  +S+P   S R+S+D RSISPNR I
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        +V +    N    +  + +R CMCSPTTHPGSFRCSLHK V +   Q +  Y++N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL +LIRPSSH  +RR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGTTTCTTCTAGAAAATCGAGCGGGCCGGTTCTGAGGTCTCTCTCACCATCTGGTAGATTCTATGGCTCCTATTCTTCTCCTTCGTCTTCTTCCTCATCGGCCTT
TGCGTCCTCTACATCGACCTTTTCCACCAAAAACCCTTCTTCGTTTTTCCGTAGATCTGTGTCTCCTTCTCGCGTTAATCTGCAAGGTTCTTCTTCTCCGTCGGCGTCTT
CCGTGAGGTTTTCTCTGGACCGGTCTATTTCTCCGAATCGGCCTATCTCTGTTTTGACTCGTAGCGGCGGGAATCAAGTAGTGAAGAGGCAGAGCAACCAGAAGAGGACC
TGCATGTGCTCTCCGACCACGCATCCTGGTTCGTTTCGGTGTAGTCTCCACAAAGGTGTTCCGTCGCAGCCTTCGACTCCTTACTCGTCTAATCGGCTTAATGCGCGGAG
ATCGGCGATGACGAATTCTCTGGTCAGAATCGGAGGAGTTGAAGGCGATTTAGTGAAGCGAGCCTTGGCGTCTCTCATCCGGCCTTCGTCTCATAGTCAGAGGCGCCGAG
TGGTTTCCGACGACGAAGACGGCGGATTCCGACCACAGGTTCGACGGCAGCGACGGATCTTAGCGCATGGAGATGGAGTTGGAGGCGAAGCATGGGAATCGGATCTGGTT
GCCTCTTCATTATACCTCGCTGCCCGGAGTTGGACTAGAGAACCTATATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGTTTCTTCTAGAAAATCGAGCGGGCCGGTTCTGAGGTCTCTCTCACCATCTGGTAGATTCTATGGCTCCTATTCTTCTCCTTCGTCTTCTTCCTCATCGGCCTT
TGCGTCCTCTACATCGACCTTTTCCACCAAAAACCCTTCTTCGTTTTTCCGTAGATCTGTGTCTCCTTCTCGCGTTAATCTGCAAGGTTCTTCTTCTCCGTCGGCGTCTT
CCGTGAGGTTTTCTCTGGACCGGTCTATTTCTCCGAATCGGCCTATCTCTGTTTTGACTCGTAGCGGCGGGAATCAAGTAGTGAAGAGGCAGAGCAACCAGAAGAGGACC
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ATCGGCGATGACGAATTCTCTGGTCAGAATCGGAGGAGTTGAAGGCGATTTAGTGAAGCGAGCCTTGGCGTCTCTCATCCGGCCTTCGTCTCATAGTCAGAGGCGCCGAG
TGGTTTCCGACGACGAAGACGGCGGATTCCGACCACAGGTTCGACGGCAGCGACGGATCTTAGCGCATGGAGATGGAGTTGGAGGCGAAGCATGGGAATCGGATCTGGTT
GCCTCTTCATTATACCTCGCTGCCCGGAGTTGGACTAGAGAACCTATATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAVSSRKSSGPVLRSLSPSGRFYGSYSSPSSSSSSAFASSTSTFSTKNPSSFFRRSVSPSRVNLQGSSSPSASSVRFSLDRSISPNRPISVLTRSGGNQVVKRQSNQKRT
CMCSPTTHPGSFRCSLHKGVPSQPSTPYSSNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALASLIRPSSHSQRRRVVSDDEDGGFRPQVRRQRRILAHGDGVGGEAWESDLV
ASSLYLAARSWTREPI