; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg022263 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg022263
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionPre T-cell antigen receptor alpha
Genome locationscaffold2:2917801..2918443
RNA-Seq ExpressionSpg022263
SyntenySpg022263
Gene Ontology termsGO:0005747 - mitochondrial respiratory chain complex I (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7023344.1 hypothetical protein SDJN02_14369, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.0e-2379.1Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREFAWNSHVYTAGD
        MGGGMEAHKN+FIEDW +ARENLEHNFRWTRRNFALVG+FGIA+PLLVYKGIVREF  +   +  GD
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREFAWNSHVYTAGD

KZV34329.1 Pre T-cell antigen receptor alpha [Dorcoceras hygrometricum]6.9e-2392.98Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREFA
        MGGGMEAHKNR+IEDW TARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALP+LVYKGIVREF+
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREFA

XP_022930869.1 uncharacterized protein LOC111437222 [Cucurbita moschata]9.0e-2394.64Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF
        MGGGMEA KNRFIEDWG+ARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIA+PLLVYKGIVREF
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF

XP_022988537.1 uncharacterized protein LOC111485748 [Cucurbita maxima]1.2e-2292.86Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF
        MGGGMEAHKNRFIEDW +ARENLEHNFRWTRRNFALVG+FGIA+PLLVYKGIVREF
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF

XP_039161924.1 uncharacterized protein LOC120290205 [Eucalyptus grandis]1.5e-2291.07Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF
        MGGGMEAHKN+FIEDWG+ARE LEHNFRWTRRNFALVGIFG+A+PLLVYKGIVREF
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A059CK03 Uncharacterized protein7.4e-2391.07Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF
        MGGGMEAHKN+FIEDWG+ARE LEHNFRWTRRNFALVGIFG+A+PLLVYKGIVREF
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF

A0A2Z7BLR4 Pre T-cell antigen receptor alpha3.3e-2392.98Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREFA
        MGGGMEAHKNR+IEDW TARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALP+LVYKGIVREF+
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREFA

A0A6J1ESQ6 uncharacterized protein LOC1114372224.3e-2394.64Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF
        MGGGMEA KNRFIEDWG+ARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIA+PLLVYKGIVREF
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF

A0A6J1I518 uncharacterized protein LOC1114692784.3e-2394.64Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF
        MGGGMEA KNRFIEDWG+ARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIA+PLLVYKGIVREF
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF

A0A6J1JDA5 uncharacterized protein LOC1114857485.7e-2392.86Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF
        MGGGMEAHKNRFIEDW +ARENLEHNFRWTRRNFALVG+FGIA+PLLVYKGIVREF
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G31490.1 unknown protein4.6e-2583.93Show/hide
Query:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF
        MGGGME +KN+FIEDWG+ARENLEHNFRWTRRNFAL+GIFGIALP++VYKGIV++F
Subjt:  MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCGGAGGAATGGAAGCTCACAAGAACAGATTTATCGAGGATTGGGGTACTGCTAGAGAAAATCTTGAGCATAACTTCCGTTGGACTCGCCGCAACTTTGCTCTTGT
GGGAATTTTCGGCATCGCCCTTCCCCTCCTCGTTTACAAGGGCATCGTCAGGGAATTCGCTTGGAATTCACATGTTTATACTGCTGGTGATGATTTGATTACCGGGTCGG
AGAATACAAGTTTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGCGGAGGAATGGAAGCTCACAAGAACAGATTTATCGAGGATTGGGGTACTGCTAGAGAAAATCTTGAGCATAACTTCCGTTGGACTCGCCGCAACTTTGCTCTTGT
GGGAATTTTCGGCATCGCCCTTCCCCTCCTCGTTTACAAGGGCATCGTCAGGGAATTCGCTTGGAATTCACATGTTTATACTGCTGGTGATGATTTGATTACCGGGTCGG
AGAATACAAGTTTATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGGGMEAHKNRFIEDWGTARENLEHNFRWTRRNFALVGIFGIALPLLVYKGIVREFAWNSHVYTAGDDLITGSENTSL