; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg022560 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg022560
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionzinc finger CCCH domain-containing protein 14-like
Genome locationscaffold2:11572506..11575987
RNA-Seq ExpressionSpg022560
SyntenySpg022560
Gene Ontology termsGO:0010468 - regulation of gene expression (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000571 - Zinc finger, CCCH-type
IPR004087 - K Homology domain
IPR004088 - K Homology domain, type 1
IPR036612 - K Homology domain, type 1 superfamily
IPR036855 - Zinc finger, CCCH-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6590234.1 Non-structural maintenance of chromosomes element 4-like A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-15686.54Show/hide
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KAG7023875.1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 14, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.7e-15586.46Show/hide
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XP_022988178.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 14-like [Cucurbita maxima]2.0e-15686.54Show/hide
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XP_038880603.1 zinc finger CCCH domain-containing protein 14-like [Benincasa hispida]4.1e-15483.83Show/hide
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A0A0A0M2L9 Uncharacterized protein1.3e-15384.08Show/hide
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A0A5A7TFZ9 Zinc finger CCCH domain-containing protein 14-like1.3e-15384.04Show/hide
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A0A5D3CR11 Zinc finger CCCH domain-containing protein 14-like2.2e-15383.53Show/hide
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A0A6J1HDK7 zinc finger CCCH domain-containing protein 14-like1.1e-15586.54Show/hide
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A0A6J1JLI2 zinc finger CCCH domain-containing protein 14-like9.6e-15786.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q69XQ3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 449.5e-7756.54Show/hide
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Q7F8R0 Zinc finger CCCH domain-containing protein 149.5e-8560.43Show/hide
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Q7XPK1 Zinc finger CCCH domain-containing protein 318.8e-8352.58Show/hide
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Subjt:  RKRERTETALNGNGAFKKSKPVCQTSHCLLSFNRVACSLFEYMDVEMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQMI---SPAI

Query:  PPGARNPVGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAHGEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKIS
        P  AR P+   +  +   + + KTR+C K+N+AEGC+FGDKCHFAHGE ELG+P        M PP+   R GG    PPP     PA +FGASATAKIS
Subjt:  PPGARNPVGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAHGEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKIS

Query:  VDASLAGPIIGKNGVNSKNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEGTFDQINLASSMVRELIANVG--------AASANNAMNQHHPAMQQSSGSANNFK
        VDASLAG IIGK GVN+K ICR+TG +LSI++HESDSNLKNIELEG FDQI  AS+MV ELIA +         A SA  A     PA +   G  +N+K
Subjt:  VDASLAGPIIGKNGVNSKNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEGTFDQINLASSMVRELIANVG--------AASANNAMNQHHPAMQQSSGSANNFK

Query:  TKLCANFAKGTCTFRERCHFAHGESELRK
        TKLC NF KGTCTF +RCHFAHGE+E RK
Subjt:  TKLCANFAKGTCTFRERCHFAHGESELRK

Q9C7C3 Zinc finger CCCH domain-containing protein 367.8e-5545.17Show/hide
Query:  EMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQM--ISPAIPPGARNPVGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAH
        EM+S STGLGSKS+PCTKFFSTSGCPFGE CHF HYVPGG+ A+SQM  + P IP  +RN  G                      S  G RF  +     
Subjt:  EMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQM--ISPAIPPGARNPVGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAH

Query:  GEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKISVDASLAGPIIGKNGVNSKNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEG
                      G  GP                    G  ++FG SATA+ SVDASLAG IIGK GV+SK ICR TG +LSI++HE D NLKNI LEG
Subjt:  GEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKISVDASLAGPIIGKNGVNSKNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEG

Query:  TFDQINLASSMVRELIANVGAASAN------------NAMNQHHPAMQQSSGSANNFKTKLCANFAKGTCTFRERCHFAHGESELRKPGM
        T +QI+ AS+MV++LI  + +A+               +  + HP         +NFKTK+C  F+KG CTF +RCHFAHGE+ELRK G+
Subjt:  TFDQINLASSMVRELIANVGAASAN------------NAMNQHHPAMQQSSGSANNFKTKLCANFAKGTCTFRERCHFAHGESELRKPGM

Q9FG30 Zinc finger CCCH domain-containing protein 528.3e-5744.31Show/hide
Query:  RKRERTETAL--NGNGAFKKSKPVCQTSHCLLSFNRVACSLFEYMDVEMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQM--ISPA
        RKR R E A   N NG FK+SK                         EM+S+STGLGSKS+PCTKFFSTSGCPFG+ CHF HYVPGG+ A +QM  + P 
Subjt:  RKRERTETAL--NGNGAFKKSKPVCQTSHCLLSFNRVACSLFEYMDVEMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQM--ISPA

Query:  IPPGARNPVGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAHGEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKI
        +   +RN  G                     +   G RF                       G G                  P  GP + FGAS T+KI
Subjt:  IPPGARNPVGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAHGEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKI

Query:  SVDASLAGPIIGKNGVNSKNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEGTFDQINLASSMVRELIANVGAASANNAMNQHHPAMQQSSGSANNFKTKLCANF
        SVDASLAG IIGK G++SK ICR TGA+LSIK+HE D NLK IELEGTF+QIN+AS MVRELI  +G+      +    P  +   GS  N+KTK+C  +
Subjt:  SVDASLAGPIIGKNGVNSKNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEGTFDQINLASSMVRELIANVGAASANNAMNQHHPAMQQSSGSANNFKTKLCANF

Query:  AKGTCTFRERCHFAHGESELRKPGM
        +KG CT+ +RCHFAHGESELR+ G+
Subjt:  AKGTCTFRERCHFAHGESELRKPGM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein1.3e-0930.88Show/hide
Query:  FEYMDVEMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAH-YVPGGFKAISQMISP-AIPPGARNPVGPPSFPDGVSSPAV------------------
        F+   +   +  +G   K R C KF++  GCP+GE C F H       ++++  + P     G     G  S   G SS  V                  
Subjt:  FEYMDVEMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAH-YVPGGFKAISQMISP-AIPPGARNPVGPPSFPDGVSSPAV------------------

Query:  -----KTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAHGEWELGR
             KTR+CNK+     C FG KCHFAHG  EL R
Subjt:  -----KTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAHGEWELGR

AT2G35430.1 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein4.8e-0735.19Show/hide
Query:  KSRPCTKFFSTSGCPF-GEGCHFAHYVPGGFKAISQMISPAIPP--------GARN------PVGP-PSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCH
        K++ C K F    CP+    CHFAH       A    + P  PP         +RN       +GP  +    + SP  KTR+CNK+ +   C FG  CH
Subjt:  KSRPCTKFFSTSGCPF-GEGCHFAHYVPGGFKAISQMISPAIPP--------GARN------PVGP-PSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCH

Query:  FAHGEWEL
        FAHG  EL
Subjt:  FAHGEWEL

AT3G12130.1 KH domain-containing protein / zinc finger (CCCH type) family protein5.5e-5645.17Show/hide
Query:  EMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQM--ISPAIPPGARNPVGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAH
        EM+S STGLGSKS+PCTKFFSTSGCPFGE CHF HYVPGG+ A+SQM  + P IP  +RN  G                      S  G RF  +     
Subjt:  EMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQM--ISPAIPPGARNPVGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAH

Query:  GEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKISVDASLAGPIIGKNGVNSKNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEG
                      G  GP                    G  ++FG SATA+ SVDASLAG IIGK GV+SK ICR TG +LSI++HE D NLKNI LEG
Subjt:  GEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKISVDASLAGPIIGKNGVNSKNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEG

Query:  TFDQINLASSMVRELIANVGAASAN------------NAMNQHHPAMQQSSGSANNFKTKLCANFAKGTCTFRERCHFAHGESELRKPGM
        T +QI+ AS+MV++LI  + +A+               +  + HP         +NFKTK+C  F+KG CTF +RCHFAHGE+ELRK G+
Subjt:  TFDQINLASSMVRELIANVGAASAN------------NAMNQHHPAMQQSSGSANNFKTKLCANFAKGTCTFRERCHFAHGESELRKPGM

AT3G19360.1 Zinc finger (CCCH-type) family protein5.6e-0836.04Show/hide
Query:  CTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQMI--SPAIPPGARN--------------------PVGPPSFPDGVSSPAV-KTRLCNKFNSAEGCRFGD
        C KF     CP+G+ C+F H     F+  S  +  S  I  GA                      PV  P    GV      KTRLC KF+    C FGD
Subjt:  CTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQMI--SPAIPPGARN--------------------PVGPPSFPDGVSSPAV-KTRLCNKFNSAEGCRFGD

Query:  KCHFAHGEWEL
        KCHFAHG+ EL
Subjt:  KCHFAHGEWEL

AT5G06770.1 KH domain-containing protein / zinc finger (CCCH type) family protein5.9e-5844.31Show/hide
Query:  RKRERTETAL--NGNGAFKKSKPVCQTSHCLLSFNRVACSLFEYMDVEMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQM--ISPA
        RKR R E A   N NG FK+SK                         EM+S+STGLGSKS+PCTKFFSTSGCPFG+ CHF HYVPGG+ A +QM  + P 
Subjt:  RKRERTETAL--NGNGAFKKSKPVCQTSHCLLSFNRVACSLFEYMDVEMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQM--ISPA

Query:  IPPGARNPVGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAHGEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKI
        +   +RN  G                     +   G RF                       G G                  P  GP + FGAS T+KI
Subjt:  IPPGARNPVGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAHGEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKI

Query:  SVDASLAGPIIGKNGVNSKNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEGTFDQINLASSMVRELIANVGAASANNAMNQHHPAMQQSSGSANNFKTKLCANF
        SVDASLAG IIGK G++SK ICR TGA+LSIK+HE D NLK IELEGTF+QIN+AS MVRELI  +G+      +    P  +   GS  N+KTK+C  +
Subjt:  SVDASLAGPIIGKNGVNSKNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEGTFDQINLASSMVRELIANVGAASANNAMNQHHPAMQQSSGSANNFKTKLCANF

Query:  AKGTCTFRERCHFAHGESELRKPGM
        +KG CT+ +RCHFAHGESELR+ G+
Subjt:  AKGTCTFRERCHFAHGESELRKPGM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCCTGACGGCGTTCGCAAGAGGGAAAGAACTGAAACCGCCTTGAATGGCAATGGCGCCTTTAAGAAGTCCAAACCAGTTTGCCAGACTAGTCATTGCCTTTTATC
CTTTAACCGTGTAGCTTGCTCTCTGTTTGAGTATATGGATGTGGAAATGGACTCCTTATCTACTGGTTTAGGAAGCAAATCGAGGCCTTGCACAAAGTTTTTCAGCACTT
CTGGTTGCCCTTTTGGTGAGGGTTGTCATTTTGCACACTATGTTCCTGGCGGATTCAAAGCAATTTCTCAGATGATCAGTCCTGCTATTCCCCCTGGCGCTAGAAATCCA
GTCGGCCCCCCATCCTTTCCAGATGGTGTTTCGTCTCCAGCTGTCAAGACACGGTTGTGCAATAAATTCAACTCAGCTGAAGGCTGCAGGTTCGGTGACAAATGTCATTT
TGCTCATGGTGAGTGGGAACTTGGAAGGCCAAACCCTCCACAAGAACACGGTGGAATGGGACCACCAATACAACAACCCAGAATGGGTGGTGGCTGGAATGTGCCTCCAC
CACCACCTAACCATGGACCTGCTGCTAGCTTCGGGGCCTCTGCAACCGCAAAGATTAGTGTCGATGCATCACTTGCAGGGCCCATAATTGGGAAAAATGGGGTCAACTCA
AAGAATATATGTCGTATGACAGGAGCAAGGCTTTCTATAAAAGAACACGAGTCAGACTCTAACCTGAAGAACATTGAGTTGGAGGGCACCTTTGATCAGATCAATCTAGC
TAGTTCGATGGTGCGTGAGTTGATTGCAAATGTTGGTGCTGCCTCTGCCAATAATGCCATGAATCAGCATCATCCTGCTATGCAGCAATCATCTGGCTCCGCAAACAACT
TTAAGACCAAGCTTTGTGCCAACTTTGCAAAAGGTACTTGTACGTTTAGAGAAAGATGCCATTTTGCCCACGGTGAAAGTGAATTGCGCAAACCAGGTATGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACCCTGACGGCGTTCGCAAGAGGGAAAGAACTGAAACCGCCTTGAATGGCAATGGCGCCTTTAAGAAGTCCAAACCAGTTTGCCAGACTAGTCATTGCCTTTTATC
CTTTAACCGTGTAGCTTGCTCTCTGTTTGAGTATATGGATGTGGAAATGGACTCCTTATCTACTGGTTTAGGAAGCAAATCGAGGCCTTGCACAAAGTTTTTCAGCACTT
CTGGTTGCCCTTTTGGTGAGGGTTGTCATTTTGCACACTATGTTCCTGGCGGATTCAAAGCAATTTCTCAGATGATCAGTCCTGCTATTCCCCCTGGCGCTAGAAATCCA
GTCGGCCCCCCATCCTTTCCAGATGGTGTTTCGTCTCCAGCTGTCAAGACACGGTTGTGCAATAAATTCAACTCAGCTGAAGGCTGCAGGTTCGGTGACAAATGTCATTT
TGCTCATGGTGAGTGGGAACTTGGAAGGCCAAACCCTCCACAAGAACACGGTGGAATGGGACCACCAATACAACAACCCAGAATGGGTGGTGGCTGGAATGTGCCTCCAC
CACCACCTAACCATGGACCTGCTGCTAGCTTCGGGGCCTCTGCAACCGCAAAGATTAGTGTCGATGCATCACTTGCAGGGCCCATAATTGGGAAAAATGGGGTCAACTCA
AAGAATATATGTCGTATGACAGGAGCAAGGCTTTCTATAAAAGAACACGAGTCAGACTCTAACCTGAAGAACATTGAGTTGGAGGGCACCTTTGATCAGATCAATCTAGC
TAGTTCGATGGTGCGTGAGTTGATTGCAAATGTTGGTGCTGCCTCTGCCAATAATGCCATGAATCAGCATCATCCTGCTATGCAGCAATCATCTGGCTCCGCAAACAACT
TTAAGACCAAGCTTTGTGCCAACTTTGCAAAAGGTACTTGTACGTTTAGAGAAAGATGCCATTTTGCCCACGGTGAAAGTGAATTGCGCAAACCAGGTATGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDPDGVRKRERTETALNGNGAFKKSKPVCQTSHCLLSFNRVACSLFEYMDVEMDSLSTGLGSKSRPCTKFFSTSGCPFGEGCHFAHYVPGGFKAISQMISPAIPPGARNP
VGPPSFPDGVSSPAVKTRLCNKFNSAEGCRFGDKCHFAHGEWELGRPNPPQEHGGMGPPIQQPRMGGGWNVPPPPPNHGPAASFGASATAKISVDASLAGPIIGKNGVNS
KNICRMTGARLSIKEHESDSNLKNIELEGTFDQINLASSMVRELIANVGAASANNAMNQHHPAMQQSSGSANNFKTKLCANFAKGTCTFRERCHFAHGESELRKPGM