; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg023608 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg023608
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionProline-rich nuclear receptor coactivator
Genome locationscaffold13:2287765..2288355
RNA-Seq ExpressionSpg023608
SyntenySpg023608
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575030.1 hypothetical protein SDJN03_25669, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.9e-9594.9Show/hide
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XP_004144965.1 uncharacterized protein LOC101217755 [Cucumis sativus]1.6e-8991.5Show/hide
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XP_022138318.1 uncharacterized protein LOC111009532 [Momordica charantia]8.1e-8992.96Show/hide
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XP_022930480.1 uncharacterized protein LOC111436920 [Cucurbita moschata]3.2e-8588.78Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCP9 Uncharacterized protein7.9e-9091.5Show/hide
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A0A1S3C7J3 uncharacterized protein LOC1034979041.4e-9192.5Show/hide
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A0A5A7SWA1 Uncharacterized protein1.4e-9192.5Show/hide
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A0A6J1CCP9 uncharacterized protein LOC1110095323.9e-8992.96Show/hide
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A0A6J1EX01 uncharacterized protein LOC1114369201.5e-8588.78Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G25250.1 unknown protein2.7e-0530.5Show/hide
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        P + K+ ++N    S S   S               V IL+RGE ++ KI  E    + +        ++G  P  +   IRI + +   +  A  YAG 
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          S SP PS +PLP+F   K V+      AT DL ++LRLD
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AT3G21570.1 unknown protein3.7e-1534.17Show/hide
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        MGTEI+RPQ+CL++R+R  PA                  +N R N        +P+QR+RF              SD+ +    ++V       R+GES 
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        DS    +  K                                P     D+YAGS+ F++SP+PSSLPLPSFSKKK  S +V    DDSA++DLRRLLRL
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AT4G32020.1 unknown protein7.3e-1132.02Show/hide
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        MG  +L PQDCL      +++ R P A  C  R     S++      PR  S+R S+     P    R   +   P  + +      K++ N++ + +V 
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        IL+RGE +  K  S+ + +  D   +  T R+GP P ++P QIR+   +   +  A  YAG     SP PS +PLP+F  KK         AT DL R+L
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        RLD
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGACTGAGATCCTACGGCCTCAGGATTGTTTGATCGAACGGATCAGAGTTCCGCCGGCAGCGTTGTGTCGCCGGAGGAGTTCTTATGGGTACTCTGATTCG
AATGTTTGTAACTATAATCCTAGATCTAACAGGAAGTCGGCGGCTCGGTCGGAGCGGCCGGAGCAGCGGAAGCGGTTTGTTTCGAATCACTCGGAGCCGTCGGTC
TCGAAGAGATCGAGTTCCGATGATTTGAAGGCGATGAAGAATAGTTTGGTGATGGAGAAGGTTACGATCTTGAGGCGAGGTGAATCGCTCGATTCGAAGATCAAG
AGCGAAGCTCTGAAGAAGGAAGGTGATAATCTGGTCGTGTGTGGGACCGAGAGGTTGGGGCCGGCGCCGGAAATGGTACCGAAACAGATCCGAATCGTCGACGTT
AGGTGTCCGATTGCCGGAAAAGCCGACGTGTACGCCGGATCGGCGTTTTCGATGTCGCCGTCTCCAAGTTCTCTTCCGTTACCGTCTTTCTCGAAGAAGAAACAG
GTATCCACCATCGTTGACGACTCGGCTACCAGAGATCTGAGGCGTTTGCTTCGGCTCGACGCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGACTGAGATCCTACGGCCTCAGGATTGTTTGATCGAACGGATCAGAGTTCCGCCGGCAGCGTTGTGTCGCCGGAGGAGTTCTTATGGGTACTCTGATTCG
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AGCGAAGCTCTGAAGAAGGAAGGTGATAATCTGGTCGTGTGTGGGACCGAGAGGTTGGGGCCGGCGCCGGAAATGGTACCGAAACAGATCCGAATCGTCGACGTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGTEILRPQDCLIERIRVPPAALCRRRSSYGYSDSNVCNYNPRSNRKSAARSERPEQRKRFVSNHSEPSVSKRSSSDDLKAMKNSLVMEKVTILRRGESLDSKIK
SEALKKEGDNLVVCGTERLGPAPEMVPKQIRIVDVRCPIAGKADVYAGSAFSMSPSPSSLPLPSFSKKKQVSTIVDDSATRDLRRLLRLDA