; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg023791 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg023791
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionMADS-box transcription factor 6
Genome locationscaffold13:8059563..8065093
RNA-Seq ExpressionSpg023791
SyntenySpg023791
Gene Ontology termsGO:0009908 - flower development (biological process)
GO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ABE03878.1 AGAMOUS LIKE6-like protein [Momordica charantia]8.2e-11589.92Show/hide
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XP_011656687.1 agamous-like MADS-box protein MADS3 [Cucumis sativus]6.9e-11485.83Show/hide
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XP_022146242.1 agamous-like MADS-box protein AGL6 [Momordica charantia]3.7e-11590.32Show/hide
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XP_038877325.1 agamous-like MADS-box protein MADS3 isoform X1 [Benincasa hispida]3.0e-11789.47Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCU5 Uncharacterized protein3.4e-11485.83Show/hide
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A0A1S3CBY8 agamous-like MADS-box protein AGL65.7e-11485.94Show/hide
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A0A6J1CZ22 agamous-like MADS-box protein AGL61.8e-11590.32Show/hide
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A0A6J1KE81 MADS-box transcription factor 62.1e-10891.67Show/hide
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Q1KTF3 AGAMOUS LIKE6-like protein4.0e-11589.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P29386 Agamous-like MADS-box protein AGL65.2e-8063.89Show/hide
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        ESL RT+R+LLGEDLG + VKELQ LE+QLEAAL   RQRKTQ+M+E+MEDLR+KERQLGD+N++LK+K E EG   K+ Q  W++S+A      + + F
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        P++ S    ++C  EP LQIG+Q ++  +G  SSV KS +  ETNF+QGWV+
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Q38837 Agamous-like MADS-box protein AGL131.4e-6155.28Show/hide
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        MGRG+VE+KRIENKI RQVTFSKR++GLLKKAYELSVLCDAEV+LIIFS+ GKLYEF + G  +T+ERY RC  +   N   ++TQ   QE++KLK KYE
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        SL RTHR+L+GEDL  +S+KELQ LE+QLE AL+  R++KTQ+M+EQME+LRRKER+LGD+N   KLKLE E  + K  Q    +    A     F +Q+
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Query:  SP----IECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKS---MTCETNFIQ
        +      +C     LQIG+Q ++     SSV KS      ETNF+Q
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Q6EU39 MADS-box transcription factor 61.5e-7966.14Show/hide
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        E+L RT RHLLGEDLGPLSVKELQ LEKQLE AL+QARQRKTQ+M+EQ+E+LRRKERQLG++NR+LK KLE EG   N +++Q    +  A  E+G ++ 
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        +Q  P       EP LQIGY + F     +++Q+S      E NF+ GWV+
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Q7XUN2 MADS-box transcription factor 172.6e-7162.4Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTKTLERYQRCCFSPQHN---YIEQETQNWFQEISKLKA
        MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAG  KTLE+Y  CC++ Q +       E Q+W+QE+S+LK 
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Query:  KYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEGQN---LKSIQSFWSSSSAPAEHGN
        K E L R+ RH+LGEDLGPLS+KELQ LEKQLE +L+QARQRKTQIM+EQ++DLRRKERQLG+LN++LK KLEAE  +     +IQ  W   +     G 
Subjt:  KYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEGQN---LKSIQSFWSSSSAPAEHGN

Query:  SFPMQASP-IECQHEPILQIGYQNYF--SAEGPSSVQKSMTCETNFIQGW
            Q  P I+C  EP LQIGY  +    A  P S         NF+ GW
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Q8LLR1 Agamous-like MADS-box protein MADS39.8e-10380.57Show/hide
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        SL RT RHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLE ALAQARQRKTQ+MIEQMEDLRRKERQLGDLN++LKLKLEAEGQ+LK+IQ  W+ S+A A  GNS     
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Query:  PMQASPIECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKSMTCETNFIQGWVI
        P Q++P++C+ EPILQIGY +Y  AEGP SV KSM  E+NFIQGWV+
Subjt:  PMQASPIECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKSMTCETNFIQGWVI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24260.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein3.5e-5551.37Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTKTLERYQRCCF-SPQHNYIEQET---QNWFQEISKL
        MGRGRVELKRIENKINRQVTF+KRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFS+RGKLYEF  S+   +TLERYQ+C + +P+ N   +E     +  QE  KL
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTKTLERYQRCCF-SPQHNYIEQET---QNWFQEISKL

Query:  KAKYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEG--------QNLKSIQSFWSSSS
        K +Y++L RT R+LLGEDLGPLS KEL++LE+QL+++L Q R  +TQ M++Q+ DL+ KER L + N+ L+L+L A+G         N + +  +     
Subjt:  KAKYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEG--------QNLKSIQSFWSSSS

Query:  APAEHGNSFPMQASPIECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKSMTCETNFIQGWV
           +H  +F     P+EC  EPILQIGYQ      G            N++ GW+
Subjt:  APAEHGNSFPMQASPIECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKSMTCETNFIQGWV

AT1G24260.2 K-box region and MADS-box transcription factor family protein4.6e-5551.17Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTKTLERYQRCCF-SPQHNYIEQET----QNWFQEISK
        MGRGRVELKRIENKINRQVTF+KRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFS+RGKLYEF  S+   +TLERYQ+C + +P+ N   +E      +  QE  K
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTKTLERYQRCCF-SPQHNYIEQET----QNWFQEISK

Query:  LKAKYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEG--------QNLKSIQSFWSSS
        LK +Y++L RT R+LLGEDLGPLS KEL++LE+QL+++L Q R  +TQ M++Q+ DL+ KER L + N+ L+L+L A+G         N + +  +    
Subjt:  LKAKYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEG--------QNLKSIQSFWSSS

Query:  SAPAEHGNSFPMQASPIECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKSMTCETNFIQGWV
            +H  +F     P+EC  EPILQIGYQ      G            N++ GW+
Subjt:  SAPAEHGNSFPMQASPIECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKSMTCETNFIQGWV

AT2G45650.1 AGAMOUS-like 63.7e-8163.89Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTKTLERYQRCC-FSPQHNYIEQETQNWFQEISKLKAKY
        MGRGRVE+KRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGS G   T+ERY RC   S  +N  E+ TQ+W QE++KLK+KY
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTKTLERYQRCC-FSPQHNYIEQETQNWFQEISKLKAKY

Query:  ESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEGQNLKSIQSFWSSSSAPA---EHGNSF
        ESL RT+R+LLGEDLG + VKELQ LE+QLEAAL   RQRKTQ+M+E+MEDLR+KERQLGD+N++LK+K E EG   K+ Q  W++S+A      + + F
Subjt:  ESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEGQNLKSIQSFWSSSSAPA---EHGNSF

Query:  PMQAS---PIECQHEPILQIGYQNYFSAEGP-SSVQKS-MTCETNFIQGWVI
        P++ S    ++C  EP LQIG+Q ++  +G  SSV KS +  ETNF+QGWV+
Subjt:  PMQAS---PIECQHEPILQIGYQNYFSAEGP-SSVQKS-MTCETNFIQGWVI

AT3G61120.1 AGAMOUS-like 131.0e-6255.28Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTKTLERYQRCCFSPQHNYIEQETQNWFQEISKLKAKYE
        MGRG+VE+KRIENKI RQVTFSKR++GLLKKAYELSVLCDAEV+LIIFS+ GKLYEF + G  +T+ERY RC  +   N   ++TQ   QE++KLK KYE
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTKTLERYQRCCFSPQHNYIEQETQNWFQEISKLKAKYE

Query:  SLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEGQNLKSIQSFWSSSSAPAEHGNSFPMQA
        SL RTHR+L+GEDL  +S+KELQ LE+QLE AL+  R++KTQ+M+EQME+LRRKER+LGD+N   KLKLE E  + K  Q    +    A     F +Q+
Subjt:  SLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEGQNLKSIQSFWSSSSAPAEHGNSFPMQA

Query:  SP----IECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKS---MTCETNFIQ
        +      +C     LQIG+Q ++     SSV KS      ETNF+Q
Subjt:  SP----IECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKS---MTCETNFIQ

AT5G15800.1 K-box region and MADS-box transcription factor family protein2.3e-5449.42Show/hide
Query:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTKTLERYQRCCFS--PQHNYIEQETQNWFQEISKLKA
        MGRGRVELKRIENKINRQVTF+KRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFS+RGKLYEF  S+   KTL+RYQ+C +     +N   +E +N ++E  KLK 
Subjt:  MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF-GSAGTTKTLERYQRCCFS--PQHNYIEQETQNWFQEISKLKA

Query:  KYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEGQNLKSIQSFWSSSSAPAEHGNSFP
        +YE+L R  R+LLGEDLGPL+ KEL+ LE+QL+ +L Q R  KTQ M++Q+ DL+ KE+ L + NR L +KL+    ++  ++S         E G    
Subjt:  KYESLCRTHRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEGQNLKSIQSFWSSSSAPAEHGNSFP

Query:  MQA----------SPIECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKSMTCETN-FIQGWVI
          A           P+EC   P LQ+GY N   +E  ++  ++   + N +I GW++
Subjt:  MQA----------SPIECQHEPILQIGYQNYFSAEGPSSVQKSMTCETN-FIQGWVI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAGAGGAAGAGTTGAACTGAAGCGAATAGAGAACAAAATCAACCGCCAAGTCACATTCTCCAAGCGCCGAAATGGCCTCCTCAAAAAGGCCTACGAGCTC
TCTGTTCTTTGCGATGCCGAGGTCGCTCTCATCATCTTCTCCAGCCGCGGCAAGCTCTACGAGTTTGGCAGTGCAGGTACCACCAAAACATTGGAGCGTTACCAA
CGTTGTTGTTTCTCTCCTCAACACAATTACATCGAACAAGAAACCCAGAACTGGTTCCAGGAAATCTCAAAACTGAAAGCTAAATATGAATCTCTTTGTCGGACT
CATAGGCATTTGCTTGGGGAAGATCTTGGACCATTGAGTGTAAAAGAGCTCCAAAATCTTGAAAAGCAACTTGAAGCAGCTCTTGCTCAAGCTAGACAAAGGAAG
ACTCAGATTATGATTGAGCAGATGGAAGACCTGCGCAGAAAGGAACGTCAACTTGGGGACCTCAACAGAGAGCTTAAGCTCAAGCTTGAGGCAGAGGGACAAAAT
CTTAAATCCATCCAAAGTTTTTGGAGTTCTAGCTCTGCACCTGCTGAACATGGCAACAGCTTCCCAATGCAAGCTAGCCCTATCGAATGCCAACACGAACCCATC
TTACAAATCGGGTATCAGAATTATTTCTCAGCAGAGGGGCCATCATCTGTCCAAAAGAGCATGACATGTGAGACAAACTTCATACAAGGATGGGTTATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAAGAGGAAGAGTTGAACTGAAGCGAATAGAGAACAAAATCAACCGCCAAGTCACATTCTCCAAGCGCCGAAATGGCCTCCTCAAAAAGGCCTACGAGCTC
TCTGTTCTTTGCGATGCCGAGGTCGCTCTCATCATCTTCTCCAGCCGCGGCAAGCTCTACGAGTTTGGCAGTGCAGGTACCACCAAAACATTGGAGCGTTACCAA
CGTTGTTGTTTCTCTCCTCAACACAATTACATCGAACAAGAAACCCAGAACTGGTTCCAGGAAATCTCAAAACTGAAAGCTAAATATGAATCTCTTTGTCGGACT
CATAGGCATTTGCTTGGGGAAGATCTTGGACCATTGAGTGTAAAAGAGCTCCAAAATCTTGAAAAGCAACTTGAAGCAGCTCTTGCTCAAGCTAGACAAAGGAAG
ACTCAGATTATGATTGAGCAGATGGAAGACCTGCGCAGAAAGGAACGTCAACTTGGGGACCTCAACAGAGAGCTTAAGCTCAAGCTTGAGGCAGAGGGACAAAAT
CTTAAATCCATCCAAAGTTTTTGGAGTTCTAGCTCTGCACCTGCTGAACATGGCAACAGCTTCCCAATGCAAGCTAGCCCTATCGAATGCCAACACGAACCCATC
TTACAAATCGGGTATCAGAATTATTTCTCAGCAGAGGGGCCATCATCTGTCCAAAAGAGCATGACATGTGAGACAAACTTCATACAAGGATGGGTTATTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRGRVELKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEFGSAGTTKTLERYQRCCFSPQHNYIEQETQNWFQEISKLKAKYESLCRT
HRHLLGEDLGPLSVKELQNLEKQLEAALAQARQRKTQIMIEQMEDLRRKERQLGDLNRELKLKLEAEGQNLKSIQSFWSSSSAPAEHGNSFPMQASPIECQHEPI
LQIGYQNYFSAEGPSSVQKSMTCETNFIQGWVI