; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg024831 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg024831
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionDUF4283 domain-containing protein
Genome locationscaffold12:13791127..13794331
RNA-Seq ExpressionSpg024831
SyntenySpg024831
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR025558 - Domain of unknown function DUF4283


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571775.1 putative vacuolar protein sorting-associated protein 13A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.2e-2975.79Show/hide
Query:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI
        LGC+RM +++WDQFLEES WD   ARLI+EPFSIWIVG ELGTF VRSGSKRPQRSF+LKL DSHV+SGSD+TVI AEVR+FSIAVF  YAG  +
Subjt:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI

KAG7011477.1 Vacuolar protein sorting-associated protein 13C [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.2e-2975.79Show/hide
Query:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI
        LGC+RM +++WDQFLEES WD   ARLI+EPFSIWIVG ELGTF VRSGSKRPQRSF+LKL DSHV+SGSD+TVI AEVR+FSIAVF  YAG  +
Subjt:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI

XP_022931777.1 uncharacterized protein LOC111438054 [Cucurbita moschata]2.2e-2975.79Show/hide
Query:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI
        LGC+RM +++WDQFLEES WD   ARLI+EPFSIWIVG ELGTF VRSGSKRPQRSF+LKL DSHV+SGSD+TVI AEVR+FSIAVF  YAG  +
Subjt:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI

XP_022973254.1 uncharacterized protein LOC111471811 [Cucurbita maxima]2.2e-2975.79Show/hide
Query:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI
        LGC+RM +++WDQFLEES WD   ARLI+EPFSIWIVG ELGTF VRSGSKRPQRSF+LKL DSHV+SGSD+TVI AEVR+FSIAVF  YAG  +
Subjt:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI

XP_023553987.1 uncharacterized protein LOC111811402 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.2e-2975.79Show/hide
Query:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI
        LGC+RM +++WDQFLEES WD   ARLI+EPFSIWIVG ELGTF VRSGSKRPQRSF+LKL DSHV+SGSD+TVI AEVR+FSIAVF  YAG  +
Subjt:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEI9 PH domain-containing protein2.0e-2871.58Show/hide
Query:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI
        LGCMRM +++WDQ +EES WDS  A+LI+EPFS+WIVG ELGTF V+SGSKRPQRSF+LKL+DSHV+SGSD+TVI AEVR+ SIAVF  YAG  +
Subjt:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI

A0A1S3CPY5 uncharacterized protein LOC103503494 isoform X12.2e-2769.47Show/hide
Query:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI
        LGCMRM +++WDQ +EES WDS  A+LI+EPFS+WIVG ELGTF VRSG KRPQRSF+LKL++SHV+SGSD+TVI A+VR+ SIAVF  YAG  +
Subjt:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI

A0A5A7T4X4 PH domain-containing protein2.2e-2769.47Show/hide
Query:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI
        LGCMRM +++WDQ +EES WDS  A+LI+EPFS+WIVG ELGTF VRSG KRPQRSF+LKL++SHV+SGSD+TVI A+VR+ SIAVF  YAG  +
Subjt:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI

A0A6J1EUN4 uncharacterized protein LOC1114380541.1e-2975.79Show/hide
Query:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI
        LGC+RM +++WDQFLEES WD   ARLI+EPFSIWIVG ELGTF VRSGSKRPQRSF+LKL DSHV+SGSD+TVI AEVR+FSIAVF  YAG  +
Subjt:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI

A0A6J1IE12 uncharacterized protein LOC1114718111.1e-2975.79Show/hide
Query:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI
        LGC+RM +++WDQFLEES WD   ARLI+EPFSIWIVG ELGTF VRSGSKRPQRSF+LKL DSHV+SGSD+TVI AEVR+FSIAVF  YAG  +
Subjt:  LGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G17140.1 pleckstrin homology (PH) domain-containing protein3.8e-1642.11Show/hide
Query:  VVLPAKVCRSIKSP---VHLGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRS
        V L    C+    P     L C R  +++ D F +ES WD+       EPFSIW +G EL TF VRSG K+P R F+LKL+D  +  G+D+ VI AE+ +
Subjt:  VVLPAKVCRSIKSP---VHLGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRS

Query:  FSIAVFGHYAGFSI
        FS A+F  Y G  +
Subjt:  FSIAVFGHYAGFSI

AT4G17140.2 pleckstrin homology (PH) domain-containing protein3.8e-1642.11Show/hide
Query:  VVLPAKVCRSIKSP---VHLGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRS
        V L    C+    P     L C R  +++ D F +ES WD+       EPFSIW +G EL TF VRSG K+P R F+LKL+D  +  G+D+ VI AE+ +
Subjt:  VVLPAKVCRSIKSP---VHLGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRS

Query:  FSIAVFGHYAGFSI
        FS A+F  Y G  +
Subjt:  FSIAVFGHYAGFSI

AT4G17140.3 pleckstrin homology (PH) domain-containing protein3.8e-1642.11Show/hide
Query:  VVLPAKVCRSIKSP---VHLGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRS
        V L    C+    P     L C R  +++ D F +ES WD+       EPFSIW +G EL TF VRSG K+P R F+LKL+D  +  G+D+ VI AE+ +
Subjt:  VVLPAKVCRSIKSP---VHLGCMRM-ILSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRS

Query:  FSIAVFGHYAGFSI
        FS A+F  Y G  +
Subjt:  FSIAVFGHYAGFSI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGGGAGGAGGATTATTCAAGTTCCAGCGGGCTTGAATAAGAAAGGATGGTATATATTTTGGGAAATGATTAGGGATTTCTCGCTCAAAATTCACTCTTATGAGAA
TCTTCCTGTTTTAGCTAATGACTCAGAAGGTCAAGTCTTTTCTAACTCCTATGCTGAAGTGGTTAAGCGAGGTGGCTCTATGAAGAATTCATTCTCCTTGGAAGATTCAG
CCAGAAATGTTAAGTTTGTTAATGAAGAAGCTTATTGGGTTCGTAAGAATTGGGATGTGCTGAAAATAGACTTGGAAAGCTCACTCGTTGTTTCTAGATTGATGGCCCAT
TATTCTTGGAAGAATGTTAAGATTGCCCTTGAGGATTTCTTTAAATCTTCAGTCTCGATCAACCGCTTTATGGATGATAAAGCCTTCATTCAGGTGGCAGATGGTCGCTT
GGATCTTTCAGTGAATGGCAAGTGGAAGAAATTTGGGAACCTTCATTTGAAATTGGAATTTTGGTCCTCTGAAATCCATTCACAGCCAAAATTTATAAAAAGCTACGGAG
GTTGGATTGCAATAAGAAATCTACCTTTGAATTTGTGGCATCGTGATTCCTTTGAAGCTATTGGAAAGAACCTTGGAGGCTTGGTTAGTATTTCATCCAATACGCTTAAT
TTATTAGATTCTTCTGAAGCCTTCATTGAAGTAGAAAAGAATTTTTGTGGCTCTATCCCTGCTGATATTAATGTTAAGATTGGTAATAAGCTTGAATTTTCTTTAAGATA
TGGTGATATTAATGCATTAGAGGACAAAAATTTGAAGTTTGATTCAAGTAGAAAGTTAATTGTCAATGACTTTTCAAATTCCCTAGATATAATTAGGGTTAAGCAAGTGA
TATTGGATGAAGAAGTGGACCTTGTTAATGAAGGGGAAAGGTTGAATGAATCGCCATTTATTTCTTGTTATCAGGAGGATTTTAATGCGACAATGGGTTCTCCAAAAGTT
GCTTCGTTGCATGTTGAGCATATTAATTACGCTGGCTGTAATGAACCTCCTTCCAAGATGATTAATGACAGCAATTGCAATTTGAAAGATGATATACAACAGCTACTGGG
ATCGTCAAATATCAGTTCTGAAAATGGGTTAATTCAGTCCAAGGATTTTAAGGAATTGTCTGTCCAAATTCCAAGGGAGAGAGACATTTTAATGAGGCGTTGGGTTCTCC
AAAAGGAAGTTCAGCCGCCTCAGATTCATGAACCTCCTCCCAAGAATTTTAATGTCGTTATTTGCAATTTAAATGATGATGTCCAGCAGGTAACATTAAAGAATTATTCT
CGGAAAAAGGCTTCTCATTCATTGGCTGTTAAGTCCAACATTAATGTTGATCATTTGGAAGCTGAATGTACTCATTTAATTGCTGCAAATAAGGCTTTGGGATCTTCAAA
TGTGGAAATGGACGATGAGTCTATTGTTAGTGTAAGCAGTGAGGATTCTGATCAGTTGTTGGATAAAGAGGACTGTGAGGAGCACTTTTCAGAAGACCAAATTGTTCCAA
GGAAATCATCTGGTCTTTTGTGGAAGCCTATGGAAAATCAGGTTGTATTGCCTGCAAAGGTATGCCGAAGCATCAAGTCTCCAGTGCATTTGGGATGCATGCGGATGATA
TTATCGTGGGATCAGTTTTTGGAGGAAAGTACTTGGGATTCTTTAGTTGCCAGGTTAATATCAGAGCCATTCAGCATATGGATAGTTGGTACTGAGTTAGGGACCTTCAA
TGTGCGGAGTGGGTCTAAGAGGCCGCAGAGGAGTTTCAGTCTTAAGCTTTCGGATTCACATGTATCAAGTGGTTCAGATAGCACCGTAATTGTTGCAGAAGTGAGATCGT
TTTCTATAGCAGTTTTTGGTCACTATGCAGGATTCTCTATTCAAGATATTTGCCTCAATTGGGAAGCTTTCATTTTTCCATCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATGGGAGGAGGATTATTCAAGTTCCAGCGGGCTTGAATAAGAAAGGATGGTATATATTTTGGGAAATGATTAGGGATTTCTCGCTCAAAATTCACTCTTATGAGAA
TCTTCCTGTTTTAGCTAATGACTCAGAAGGTCAAGTCTTTTCTAACTCCTATGCTGAAGTGGTTAAGCGAGGTGGCTCTATGAAGAATTCATTCTCCTTGGAAGATTCAG
CCAGAAATGTTAAGTTTGTTAATGAAGAAGCTTATTGGGTTCGTAAGAATTGGGATGTGCTGAAAATAGACTTGGAAAGCTCACTCGTTGTTTCTAGATTGATGGCCCAT
TATTCTTGGAAGAATGTTAAGATTGCCCTTGAGGATTTCTTTAAATCTTCAGTCTCGATCAACCGCTTTATGGATGATAAAGCCTTCATTCAGGTGGCAGATGGTCGCTT
GGATCTTTCAGTGAATGGCAAGTGGAAGAAATTTGGGAACCTTCATTTGAAATTGGAATTTTGGTCCTCTGAAATCCATTCACAGCCAAAATTTATAAAAAGCTACGGAG
GTTGGATTGCAATAAGAAATCTACCTTTGAATTTGTGGCATCGTGATTCCTTTGAAGCTATTGGAAAGAACCTTGGAGGCTTGGTTAGTATTTCATCCAATACGCTTAAT
TTATTAGATTCTTCTGAAGCCTTCATTGAAGTAGAAAAGAATTTTTGTGGCTCTATCCCTGCTGATATTAATGTTAAGATTGGTAATAAGCTTGAATTTTCTTTAAGATA
TGGTGATATTAATGCATTAGAGGACAAAAATTTGAAGTTTGATTCAAGTAGAAAGTTAATTGTCAATGACTTTTCAAATTCCCTAGATATAATTAGGGTTAAGCAAGTGA
TATTGGATGAAGAAGTGGACCTTGTTAATGAAGGGGAAAGGTTGAATGAATCGCCATTTATTTCTTGTTATCAGGAGGATTTTAATGCGACAATGGGTTCTCCAAAAGTT
GCTTCGTTGCATGTTGAGCATATTAATTACGCTGGCTGTAATGAACCTCCTTCCAAGATGATTAATGACAGCAATTGCAATTTGAAAGATGATATACAACAGCTACTGGG
ATCGTCAAATATCAGTTCTGAAAATGGGTTAATTCAGTCCAAGGATTTTAAGGAATTGTCTGTCCAAATTCCAAGGGAGAGAGACATTTTAATGAGGCGTTGGGTTCTCC
AAAAGGAAGTTCAGCCGCCTCAGATTCATGAACCTCCTCCCAAGAATTTTAATGTCGTTATTTGCAATTTAAATGATGATGTCCAGCAGGTAACATTAAAGAATTATTCT
CGGAAAAAGGCTTCTCATTCATTGGCTGTTAAGTCCAACATTAATGTTGATCATTTGGAAGCTGAATGTACTCATTTAATTGCTGCAAATAAGGCTTTGGGATCTTCAAA
TGTGGAAATGGACGATGAGTCTATTGTTAGTGTAAGCAGTGAGGATTCTGATCAGTTGTTGGATAAAGAGGACTGTGAGGAGCACTTTTCAGAAGACCAAATTGTTCCAA
GGAAATCATCTGGTCTTTTGTGGAAGCCTATGGAAAATCAGGTTGTATTGCCTGCAAAGGTATGCCGAAGCATCAAGTCTCCAGTGCATTTGGGATGCATGCGGATGATA
TTATCGTGGGATCAGTTTTTGGAGGAAAGTACTTGGGATTCTTTAGTTGCCAGGTTAATATCAGAGCCATTCAGCATATGGATAGTTGGTACTGAGTTAGGGACCTTCAA
TGTGCGGAGTGGGTCTAAGAGGCCGCAGAGGAGTTTCAGTCTTAAGCTTTCGGATTCACATGTATCAAGTGGTTCAGATAGCACCGTAATTGTTGCAGAAGTGAGATCGT
TTTCTATAGCAGTTTTTGGTCACTATGCAGGATTCTCTATTCAAGATATTTGCCTCAATTGGGAAGCTTTCATTTTTCCATCTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDGRRIIQVPAGLNKKGWYIFWEMIRDFSLKIHSYENLPVLANDSEGQVFSNSYAEVVKRGGSMKNSFSLEDSARNVKFVNEEAYWVRKNWDVLKIDLESSLVVSRLMAH
YSWKNVKIALEDFFKSSVSINRFMDDKAFIQVADGRLDLSVNGKWKKFGNLHLKLEFWSSEIHSQPKFIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLN
LLDSSEAFIEVEKNFCGSIPADINVKIGNKLEFSLRYGDINALEDKNLKFDSSRKLIVNDFSNSLDIIRVKQVILDEEVDLVNEGERLNESPFISCYQEDFNATMGSPKV
ASLHVEHINYAGCNEPPSKMINDSNCNLKDDIQQLLGSSNISSENGLIQSKDFKELSVQIPRERDILMRRWVLQKEVQPPQIHEPPPKNFNVVICNLNDDVQQVTLKNYS
RKKASHSLAVKSNINVDHLEAECTHLIAANKALGSSNVEMDDESIVSVSSEDSDQLLDKEDCEEHFSEDQIVPRKSSGLLWKPMENQVVLPAKVCRSIKSPVHLGCMRMI
LSWDQFLEESTWDSLVARLISEPFSIWIVGTELGTFNVRSGSKRPQRSFSLKLSDSHVSSGSDSTVIVAEVRSFSIAVFGHYAGFSIQDICLNWEAFIFPS