; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg024881 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg024881
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionProtein TIC 214
Genome locationscaffold12:11229775..11230527
RNA-Seq ExpressionSpg024881
SyntenySpg024881
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008896 - Protein TIC214


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
BBN69961.1 hypothetical protein Prudu_1292S000200 [Prunus dulcis]2.0e-3179.46Show/hide
Query:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP------ISSPIVTEKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTE
        EEGTE KVSATTGFITGQLMMFI IYY PLHLALGR HTITVLALP      I SPIVT+KLKETSET       EETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTE
Subjt:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP------ISSPIVTEKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTE

Query:  EDTSPSLFFGRK
        ED SPSLF   K
Subjt:  EDTSPSLFFGRK

QYJ09122.1 Ycf1 [Staphylea holocarpa]1.7e-2539.92Show/hide
Query:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP------------------------------------------------------
        EEGTE KVSATTGFI GQLM+FI IYYAPLHLALGR HTITVLALP                                                      
Subjt:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP------------------------------------------------------

Query:  --------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKETS
                                                                                              I SPI+T+KLKETS
Subjt:  --------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKETS

Query:  ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRKGGSGQIR
        ETEERGESEEETD+EIETTSET+GTKQEQEGSTEED SPSLFFGRKGGSGQ R
Subjt:  ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRKGGSGQIR

RZC64927.1 hypothetical protein C5167_008621 [Papaver somniferum]1.8e-2767.69Show/hide
Query:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKLK-ETSETEERGESEEE
        MEEGTE +VSATTGFITGQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVL LP                           + SPIVT+KLK ET+ETEERGESE E
Subjt:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKLK-ETSETEERGESEEE

Query:  TDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        TDVEIET SETKGTKQE EGS EED SPSL
Subjt:  TDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL

RZC75017.1 hypothetical protein C5167_050499 [Papaver somniferum]1.8e-2767.69Show/hide
Query:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKLK-ETSETEERGESEEE
        MEEGTE +VSATTGFITGQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVL LP                           + SPIVT+KLK ET+ETEERGESE E
Subjt:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKLK-ETSETEERGESEEE

Query:  TDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        TDVEIET SETKGTKQE EGS EED SPSL
Subjt:  TDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL

TXG46214.1 hypothetical protein EZV62_028245 [Acer yangbiense]5.1e-2765.44Show/hide
Query:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKL--KETSETEERGESEE
        MEEGTE KVSATTGFI GQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALP                           I SPI T+KL  KETSETEER   EE
Subjt:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKL--KETSETEERGESEE

Query:  ETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRK
        ETDVEIETT E +GTKQEQE STEED SPSLF   K
Subjt:  ETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A4Y7JW43 Uncharacterized protein8.6e-2867.69Show/hide
Query:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKLK-ETSETEERGESEEE
        MEEGTE +VSATTGFITGQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVL LP                           + SPIVT+KLK ET+ETEERGESE E
Subjt:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKLK-ETSETEERGESEEE

Query:  TDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        TDVEIET SETKGTKQE EGS EED SPSL
Subjt:  TDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL

A0A4Y7KQA8 Uncharacterized protein8.6e-2867.69Show/hide
Query:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKLK-ETSETEERGESEEE
        MEEGTE +VSATTGFITGQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVL LP                           + SPIVT+KLK ET+ETEERGESE E
Subjt:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKLK-ETSETEERGESEEE

Query:  TDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        TDVEIET SETKGTKQE EGS EED SPSL
Subjt:  TDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL

A0A5C7GQU1 Uncharacterized protein2.5e-2765.44Show/hide
Query:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKL--KETSETEERGESEE
        MEEGTE KVSATTGFI GQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALP                           I SPI T+KL  KETSETEER   EE
Subjt:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP---------------------------ISSPIVTEKL--KETSETEERGESEE

Query:  ETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRK
        ETDVEIETT E +GTKQEQE STEED SPSLF   K
Subjt:  ETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRK

A0A5H2Y3H5 Uncharacterized protein9.8e-3279.46Show/hide
Query:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP------ISSPIVTEKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTE
        EEGTE KVSATTGFITGQLMMFI IYY PLHLALGR HTITVLALP      I SPIVT+KLKETSET       EETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTE
Subjt:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP------ISSPIVTEKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTE

Query:  EDTSPSLFFGRK
        ED SPSLF   K
Subjt:  EDTSPSLFFGRK

A0A6N2MYE5 Uncharacterized protein2.7e-3482.14Show/hide
Query:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALPISSPIVTEKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPS
        EEGTE KVSATTGFITGQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALPI SPI T+KLKETSETEER   EEETDVEIETT ETKGTKQEQEGSTEED S S
Subjt:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALPISSPIVTEKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPS

Query:  LFFGRKGGSGQI
        LF   K    +I
Subjt:  LFFGRKGGSGQI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A393 Protein TIC 2141.3e-2036.76Show/hide
Query:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTE KVSATTGFITGQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKET
                                                                                               I SPI+T+KLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKET

Query:  SETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRKGGSGQI
        S+TEE  ESEEE DVEIETTSE KGTKQEQEGSTEED S SLF   K  S +I
Subjt:  SETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRKGGSGQI

A6MM95 Protein TIC 2141.2e-2137.6Show/hide
Query:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTE KVSATTGFITGQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALP                                                     
Subjt:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKET
                                                                                               + +PIVT+KLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKET

Query:  SETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        S+TEERGESEEE DVEIETTSETKGTKQEQE STEED SPSL
Subjt:  SETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL

Q06GT8 Protein TIC 2142.0e-2137.66Show/hide
Query:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP-----------------------------------------------------
        MEEGTE +VSATTGFITGQLMMFI IYYAPLH+ALGR HTITVL LP                                                     
Subjt:  MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP-----------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKET
                                                                                               I SPIVT+KLKET
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKET

Query:  SETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTS
        SETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEED S
Subjt:  SETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTS

Q0ZIW0 Protein TIC 2148.8e-2237.4Show/hide
Query:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP------------------------------------------------------
        EEGTE KVSA TGFITGQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALP                                                      
Subjt:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP------------------------------------------------------

Query:  --------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKETS
                                                                                              I SPI+T+K+KETS
Subjt:  --------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKETS

Query:  ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRK
        ETEERGESEEETDVEIE TSETKGTKQEQE STEED SPSLF   K
Subjt:  ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRK

Q49KU0 Protein TIC 2142.2e-2036.99Show/hide
Query:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP------------------------------------------------------
        EEGTE KVSATTGFI GQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALP                                                      
Subjt:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP------------------------------------------------------

Query:  --------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKETS
                                                                                              I SPIVT+K KETS
Subjt:  --------------------------------------------------------------------------------------ISSPIVTEKLKETS

Query:  ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRK
        ETEERGE EEETDVEIETT ETKGT+QEQEGSTEED  PSLF   K
Subjt:  ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07739.1 Ycf1 protein2.0e-1691.3Show/hide
Query:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP
        EEGTE KVSATTGFI GQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALP
Subjt:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP

ATCG01000.1 Ycf1 protein2.0e-1691.3Show/hide
Query:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP
        EEGTE KVSATTGFI GQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALP
Subjt:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP

ATCG01000.1 Ycf1 protein8.8e-0164.29Show/hide
Query:  EIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLF
        +++ TSET GTKQ+QE STEE   PSLF
Subjt:  EIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLF

ATCG01130.1 Ycf1 protein2.0e-1691.3Show/hide
Query:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP
        EEGTE KVSATTGFI GQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALP
Subjt:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP

ATCG01130.1 Ycf1 protein8.8e-0164.29Show/hide
Query:  EIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLF
        +++ TSET GTKQ+QE STEE   PSLF
Subjt:  EIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLF

ATMG00370.1 Ycf1 protein2.0e-1691.3Show/hide
Query:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP
        EEGTE KVSATTGFI GQLMMFI IYYAPLHLALGR HTITVLALP
Subjt:  EEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGAAGGAACCGAGACGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATTGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGTAG
ACGTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCAATATCGTCACCCATTGTTACTGAGAAACTGAAAGAAACCTCAGAAACGGAGGAAAGGGGGGAAAGCGAGGAAGAAACAG
ATGTAGAAATAGAAACCACTTCCGAAACGAAGGGGACTAAACAGGAACAAGAGGGATCCACCGAAGAAGATACTTCTCCTTCCCTTTTTTTCGGAAGAAAAGGAGGATCC
GGACAAATTCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGAAGGAACCGAGACGAAAGTATCAGCAACAACAGGTTTTATTACGGGACAGCTCATGATGTTCATATTGATCTATTATGCGCCTCTGCATCTAGCATTGGGTAG
ACGTCATACAATAACTGTCCTAGCTCTACCAATATCGTCACCCATTGTTACTGAGAAACTGAAAGAAACCTCAGAAACGGAGGAAAGGGGGGAAAGCGAGGAAGAAACAG
ATGTAGAAATAGAAACCACTTCCGAAACGAAGGGGACTAAACAGGAACAAGAGGGATCCACCGAAGAAGATACTTCTCCTTCCCTTTTTTTCGGAAGAAAAGGAGGATCC
GGACAAATTCGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEEGTETKVSATTGFITGQLMMFILIYYAPLHLALGRRHTITVLALPISSPIVTEKLKETSETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSLFFGRKGGS
GQIR