; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg024919 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg024919
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationscaffold12:9417281..9418330
RNA-Seq ExpressionSpg024919
SyntenySpg024919
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022951659.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]4.7e-13379.86Show/hide
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XP_023002177.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita maxima]7.0e-13781.6Show/hide
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XP_023536885.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-13480.21Show/hide
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XP_023536887.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.0e-13379.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BQ38 probable carbohydrate esterase At4g342152.5e-13281.25Show/hide
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A0A6J1GIT2 probable carbohydrate esterase At4g342152.1e-13178.47Show/hide
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A0A6J1GJF6 probable carbohydrate esterase At4g342152.3e-13379.86Show/hide
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A0A6J1I774 probable carbohydrate esterase At4g342157.0e-13580.34Show/hide
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A0A6J1KIR8 probable carbohydrate esterase At4g342153.4e-13781.6Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342151.0e-4540.23Show/hide
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        P  IFIL+GQSNMAGRGGV KD  +   VWD  +PP C P+ SILRL+  L+WE A EP+H  ID GK  G+GP M+ A  ++ +      V+GLVPCA 
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        GGT I++W +         Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ +   ++R+D+    LPII V IA    +       + 
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         VR AQ  L  +L +VV +D+  LP+          D+ H  T  ++ LG  LA  YLS++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)2.9e-4841.67Show/hide
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        T  ++IFILAGQSNMAGRGGV  D + +  VWDG +PP C+ +PSILRL  KL+W+ A+EP+H  ID+ KT G+GP M  A ++  + GQ    VGLVPC
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Query:  ARGGTLIEQWIKNPSNPNKTFYQNFIERIKA--SDKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFFTDIRNDIKPRFLPIIIVKIALYDFFMKHDT
        + GGT + QW K      +  Y+  ++R KA  +   GG  RA+ WYQGESD      A  YK  L KFF+D+RND++   LPII V +A         T
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Query:  HDLPTVRAAQEA-LQHELPDVVTIDSWKLPINFTTFEGFSLDHGHFNTATEIALGKWLADTYLS
           P + A ++A L+ +L +V  +D+  LP+          D  H  T++++ LG  +A+++L+
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)7.1e-4740.23Show/hide
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        P  IFIL+GQSNMAGRGGV KD  +   VWD  +PP C P+ SILRL+  L+WE A EP+H  ID GK  G+GP M+ A  ++ +      V+GLVPCA 
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Query:  GGTLIEQWIKNPSNPNKTFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFFTDIRNDIKPRFLPIIIVKIALYDFFMKHDTHDLP
        GGT I++W +         Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ +   ++R+D+    LPII V IA    +       + 
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         VR AQ  L  +L +VV +D+  LP+          D+ H  T  ++ LG  LA  YLS++
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)7.1e-4740.23Show/hide
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        P  IFIL+GQSNMAGRGGV KD  +   VWD  +PP C P+ SILRL+  L+WE A EP+H  ID GK  G+GP M+ A  ++ +      V+GLVPCA 
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Query:  GGTLIEQWIKNPSNPNKTFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFFTDIRNDIKPRFLPIIIVKIALYDFFMKHDTHDLP
        GGT I++W +         Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ +   ++R+D+    LPII V IA    +       + 
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Query:  TVRAAQEALQHELPDVVTIDSWKLPINFTTFEGFSLDHGHFNTATEIALGKWLADTYLSHY
         VR AQ  L  +L +VV +D+  LP+          D+ H  T  ++ LG  LA  YLS++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCAAAATGGCTTTGTTGAGATTGTCTATCTTGTTATGTATGATGCTATTTGGCCTTTCCCTTTCAGGGGCTACTTCTCCTATGAACATATTTATCCTCGCCGGTCA
GAGCAACATGGCTGGCCGAGGTGGGGTTGAGAAAGATAAATCGGGACACCTTGTGTGGGATGGGTATGTCCCACCAGTGTGTCAACCCGACCCATCCATCCTACGATTGA
ACCCTAAGCTCCAATGGGAGGTAGCACGAGAGCCTATCCATGCAGGGATTGACCTCGGCAAGACCCCTGGGATTGGTCCGGCAATGTCAATTGCTCGCCAGCTACAAGCA
AAAGCTGGGCAAAAGGTAGGTGTTGTGGGTTTAGTTCCTTGTGCTAGAGGTGGCACTTTAATCGAACAATGGATTAAAAACCCTAGCAATCCTAATAAAACTTTTTACCA
AAATTTCATTGAACGAATCAAAGCGTCAGATAAAGAAGGTGGGGTGGTGCGTGCTCTTTTTTGGTACCAAGGGGAAAGCGATGCAGCTATGAGTGACACTGCTCATAGAT
ACAAAGACAACCTAAAGAAGTTCTTCACTGACATCCGTAATGATATAAAACCTAGATTTTTACCCATCATTATTGTTAAAATAGCCCTCTATGACTTTTTTATGAAGCAT
GATACTCATGATTTGCCAACAGTGAGGGCAGCACAAGAAGCACTCCAACACGAGTTGCCGGATGTGGTGACCATCGACTCTTGGAAATTGCCTATAAACTTTACCACATT
CGAAGGCTTTAGCCTAGATCATGGTCATTTTAATACCGCCACTGAGATTGCTTTGGGTAAATGGTTGGCTGATACCTACCTTTCCCACTATGGACATTTACTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTCAAAATGGCTTTGTTGAGATTGTCTATCTTGTTATGTATGATGCTATTTGGCCTTTCCCTTTCAGGGGCTACTTCTCCTATGAACATATTTATCCTCGCCGGTCA
GAGCAACATGGCTGGCCGAGGTGGGGTTGAGAAAGATAAATCGGGACACCTTGTGTGGGATGGGTATGTCCCACCAGTGTGTCAACCCGACCCATCCATCCTACGATTGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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DTHDLPTVRAAQEALQHELPDVVTIDSWKLPINFTTFEGFSLDHGHFNTATEIALGKWLADTYLSHYGHLL