; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg025099 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg025099
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationscaffold12:9243962..9245760
RNA-Seq ExpressionSpg025099
SyntenySpg025099
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575064.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-4981.25Show/hide
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XP_023006467.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]3.1e-4982.03Show/hide
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XP_023547686.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.1e-4982.03Show/hide
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XP_038875155.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]6.6e-5288.28Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C9N4 protein RALF-like 331.1e-4782.54Show/hide
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A0A6J1EV64 protein RALF-like 333.8e-4578.12Show/hide
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A0A6J1H3W7 protein RALF-like 338.7e-5081.25Show/hide
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A0A6J1KG89 protein RALF-like 339.9e-4678.91Show/hide
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A0A6J1KVY0 protein RALF-like 331.5e-4982.03Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 332.4e-3369.37Show/hide
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        +RGCSAITRCR
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Q945T0 Rapid alkalinization factor1.1e-2870.11Show/hide
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        +PA+S   C+GSI EC   +     EFE+DSE NRRILAT +YISYGAL++N++PCSRRGASYYNC+PGAQANPY+RGCSAITRCRS
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.1e-3257.97Show/hide
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        G+SR    +++ A + ILA H + +  S+   +F+ D    F P ++ECRG+IAEC            F      G EFEMDSEINRRILAT RYISYGA
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        LRRN IPCSRRGASYYNCR GAQANPY+RGCSAITRCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 223.2e-2552.38Show/hide
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        ++   ++ A +AILA    ++ SA+        +L FV A S      C GSIAEC   +     E E DS+I+RRILA  +YISYGA+RRN++PCSRRG
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        ASYYNC+ GAQANPY+RGCS ITRCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 12.2e-2672.84Show/hide
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        S C GSIAEC  A+     E EMDSEINRRILATT+YISY +L+RN++PCSRRGASYYNC+ GAQANPY+RGCS I RCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.6e-2772.84Show/hide
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        S C GSIAEC  A+     E EMDSEINRRILATT+YISY +L+RN++PCSRRGASYYNC+ GAQANPY+RGCS I RCRS
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AT2G33775.1 ralf-like 191.1e-1767.21Show/hide
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        ++ MDSE NRR LA  R YISYGALR+NN+PCSRRG SYY+C+   +ANPY RGCS IT C
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AT3G05490.1 ralf-like 222.3e-2652.38Show/hide
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        ++   ++ A +AILA    ++ SA+        +L FV A S      C GSIAEC   +     E E DS+I+RRILA  +YISYGA+RRN++PCSRRG
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.5e-3357.97Show/hide
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        G+SR    +++ A + ILA H + +  S+   +F+ D    F P ++ECRG+IAEC            F      G EFEMDSEINRRILAT RYISYGA
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        LRRN IPCSRRGASYYNCR GAQANPY+RGCSAITRCR
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AT4G15800.1 ralf-like 331.7e-3469.37Show/hide
Query:  VAILASHFLLISSAMPVDFSADHNLLFVPAKSECRGSIAECFLADSAFGTEFEMDSEINRRILATTRYISYGALRRNNIPCSRRGASYYNCRPGAQANPY
        +AIL  HFL   +A+    S D    FVP +S+C G+IAEC L  S    EFEMDSEINRRILATT+YISYGALRRN +PCSRRGASYYNCR GAQANPY
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Query:  TRGCSAITRCR
        +RGCSAITRCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAATCTCACGCGTTTCTTCTCTCCTTGCTGCCGTCGCCATTCTCGCCTCTCACTTTCTTCTCATCTCATCGGCGATGCCCGTCGATTTCTCCGCCGACCACAACCT
CCTCTTCGTTCCGGCAAAATCCGAGTGCCGAGGCTCAATCGCCGAGTGCTTCCTCGCCGATTCCGCTTTCGGAACGGAGTTCGAGATGGACTCTGAGATCAATCGCCGAA
TTTTAGCGACTACTCGCTACATCAGCTATGGCGCTCTGAGAAGGAACAACATTCCTTGCTCTCGCCGCGGTGCTTCTTACTACAACTGCCGGCCAGGTGCTCAGGCGAAT
CCTTACACCCGCGGTTGCAGCGCCATCACTCGCTGCCGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAATCTCACGCGTTTCTTCTCTCCTTGCTGCCGTCGCCATTCTCGCCTCTCACTTTCTTCTCATCTCATCGGCGATGCCCGTCGATTTCTCCGCCGACCACAACCT
CCTCTTCGTTCCGGCAAAATCCGAGTGCCGAGGCTCAATCGCCGAGTGCTTCCTCGCCGATTCCGCTTTCGGAACGGAGTTCGAGATGGACTCTGAGATCAATCGCCGAA
TTTTAGCGACTACTCGCTACATCAGCTATGGCGCTCTGAGAAGGAACAACATTCCTTGCTCTCGCCGCGGTGCTTCTTACTACAACTGCCGGCCAGGTGCTCAGGCGAAT
CCTTACACCCGCGGTTGCAGCGCCATCACTCGCTGCCGGAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGISRVSSLLAAVAILASHFLLISSAMPVDFSADHNLLFVPAKSECRGSIAECFLADSAFGTEFEMDSEINRRILATTRYISYGALRRNNIPCSRRGASYYNCRPGAQAN
PYTRGCSAITRCRS