; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg025208 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg025208
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationscaffold13:40027320..40028371
RNA-Seq ExpressionSpg025208
SyntenySpg025208
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022951659.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]1.5e-12877.16Show/hide
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XP_023536885.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.3e-13077.51Show/hide
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XP_038886442.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Benincasa hispida]1.5e-12877.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNC5 SASA domain-containing protein1.6e-12677.51Show/hide
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A0A6J1GIT2 probable carbohydrate esterase At4g342151.1e-12776.47Show/hide
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A0A6J1GJF6 probable carbohydrate esterase At4g342157.5e-12977.16Show/hide
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A0A6J1I774 probable carbohydrate esterase At4g342151.5e-12976.98Show/hide
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A0A6J1KIR8 probable carbohydrate esterase At4g342159.1e-13579.93Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342151.5e-4639.78Show/hide
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        P +     PN IFIL+GQSNMAGRGGV  D       WD  +P EC P+ SILRL+ + +WE A EP+H  ID GK  G+GP MA A  ++ +    + V
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)2.2e-4841.22Show/hide
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        I++ +   P L   T   N  IFILAGQSNMAGRGGV ND    T  WDG +P EC+ +PSILRL  + +W+ A+EP+H  ID+ KT G+GP M  A ++
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        I V +A            L AVR AQ  L+ +L +V  +D+  LP+          D  H  T++++ LG  +A+++L+
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)1.1e-4739.78Show/hide
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        P +     PN IFIL+GQSNMAGRGGV  D       WD  +P EC P+ SILRL+ + +WE A EP+H  ID GK  G+GP MA A  ++ +    + V
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        +GLVPCA GGT I++W +         Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y  N+ +   ++R+D+    LPII V IA    +I
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)1.1e-4739.78Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTTATTAAGACTATCTATCTTGCTATGTATGCTATTTGGCCCTTCCCTTTCAAGGGCTACTTCTCCTAACAACATATTCATCCTCGCCGGTCAAAGCAACATGGC
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TAACCTAGATCATGGTCATTTTAATACTGCCACCGAGCTTGTTTTGGGTGAATGGTTGGCTGATACCTACCTCTCCCACTTTGGTCATTTACTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTTATTAAGACTATCTATCTTGCTATGTATGCTATTTGGCCCTTCCCTTTCAAGGGCTACTTCTCCTAACAACATATTCATCCTCGCCGGTCAAAGCAACATGGC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QKAGVVGLVPCARGGTLIEQWMKNPSNPNETFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHKYKENIKKFFTDIRNDIKPRFLPIIVVKIALYDFFIEHDTH
DLPAVRAAQDALEQELPDVVTIDSWKLPINFTTYEGFNLDHGHFNTATELVLGEWLADTYLSHFGHLL