; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg025213 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg025213
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionReticulon family protein
Genome locationscaffold13:42133250..42134240
RNA-Seq ExpressionSpg025213
SyntenySpg025213
Gene Ontology termsGO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR044177 - Reticulon-like protein B22/B23


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7020756.1 Reticulon-like protein B22 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.2e-5791.54Show/hide
Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKAKAF
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK   F
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVKAKAF
XP_011655303.1 reticulon-like protein B22 [Cucumis sativus]3.5e-5690.48Show/hide
Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        M+ IG R EGL+DT+MA+R+INCKTEVGKP VALICGSLVYYHCA+RNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQ+SQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
XP_022952032.1 reticulon-like protein B22 isoform X1 [Cucurbita moschata]5.4e-5793.65Show/hide
Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
XP_022952033.1 reticulon-like protein B23 isoform X2 [Cucurbita moschata]5.4e-5793.65Show/hide
Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
XP_038889154.1 reticulon-like protein B22 [Benincasa hispida]1.3e-5892.86Show/hide
Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        M+ IGRR+EGL++TEMANRTINCKTEVGKP VALICGSL+YYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSM+AW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KQM7 Reticulon domain-containing protein1.7e-5690.48Show/hide
Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        M+ IG R EGL+DT+MA+R+INCKTEVGKP VALICGSLVYYHCA+RNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQ+SQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
A0A6J1GJ96 reticulon-like protein B22 isoform X12.6e-5793.65Show/hide
Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
A0A6J1GJC4 reticulon-like protein B23 isoform X22.6e-5793.65Show/hide
Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
A0A6J1I734 reticulon-like protein B22 isoform X12.6e-5793.65Show/hide
Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
A0A6J1ICJ8 reticulon-like protein B23 isoform X22.6e-5793.65Show/hide
Query:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
        MN I  RSE LKD EMANR+I+CKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW
Subjt:  MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAW

Query:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
        LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFVK
Subjt:  LANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFVK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0C941 Reticulon-like protein B231.4e-3678.22Show/hide
Query:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV
        E+GK +  LI G+LVY+HCA RN++LLSL++DV IVLL SLAILGLLFRH+NVSVPVDPLEWQISQDTA +++A LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFV
Subjt:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV

Query:  K
        K
Subjt:  K
Q8GWH5 Reticulon-like protein B221.2e-3880.2Show/hide
Query:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV
        E+GK +  LI G+LVYYHCAYRN++LLSL +DVFIVLLCSLAILGLLFR +NVSVPVDPLEWQISQDTA++++A LANT+GAAE VLRVAATGHDKRLFV
Subjt:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV

Query:  K
        K
Subjt:  K
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16825.1 Reticulon family protein1.0e-3778.22Show/hide
Query:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV
        E+GK +  LI G+LVY+HCA RN++LLSL++DV IVLL SLAILGLLFRH+NVSVPVDPLEWQISQDTA +++A LANT+GAAESVLRVAATGHDKRLFV
Subjt:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV

Query:  K
        K
Subjt:  K
AT1G78895.1 Reticulon family protein8.4e-4080.2Show/hide
Query:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV
        E+GK +  LI G+LVYYHCAYRN++LLSL +DVFIVLLCSLAILGLLFR +NVSVPVDPLEWQISQDTA++++A LANT+GAAE VLRVAATGHDKRLFV
Subjt:  EVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFV

Query:  K
        K
Subjt:  K

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACCTAATTGGGCGGAGGAGCGAGGGCTTGAAAGACACAGAGATGGCGAATCGTACGATTAACTGCAAGACAGAAGTAGGGAAACCCCTTGTAGCTCTGATTTGCGG
TTCATTGGTCTATTACCATTGCGCCTATCGAAATTCCAGTCTCCTCTCCCTCGTTGCTGACGTTTTCATCGTTCTCCTTTGCTCTCTCGCCATTCTCGGCCTTCTCTTCC
GCCATATGAATGTCTCGGTACCGGTGGACCCCCTTGAGTGGCAAATATCGCAGGATACTGCTAATAGTATGATTGCTTGGTTAGCCAATACCTTAGGTGCGGCTGAGTCT
GTTCTGAGGGTAGCAGCAACGGGGCATGACAAGAGGCTTTTTGTTAAGGCGAAGGCCTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAACCTAATTGGGCGGAGGAGCGAGGGCTTGAAAGACACAGAGATGGCGAATCGTACGATTAACTGCAAGACAGAAGTAGGGAAACCCCTTGTAGCTCTGATTTGCGG
TTCATTGGTCTATTACCATTGCGCCTATCGAAATTCCAGTCTCCTCTCCCTCGTTGCTGACGTTTTCATCGTTCTCCTTTGCTCTCTCGCCATTCTCGGCCTTCTCTTCC
GCCATATGAATGTCTCGGTACCGGTGGACCCCCTTGAGTGGCAAATATCGCAGGATACTGCTAATAGTATGATTGCTTGGTTAGCCAATACCTTAGGTGCGGCTGAGTCT
GTTCTGAGGGTAGCAGCAACGGGGCATGACAAGAGGCTTTTTGTTAAGGCGAAGGCCTTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNLIGRRSEGLKDTEMANRTINCKTEVGKPLVALICGSLVYYHCAYRNSSLLSLVADVFIVLLCSLAILGLLFRHMNVSVPVDPLEWQISQDTANSMIAWLANTLGAAES
VLRVAATGHDKRLFVKAKAF