CuGenDBv2

Gene ID	Spg025799
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	EF-hand domain-containing protein
Genome location	scaffold7:1972437..1975764
RNA-Seq Expression	Spg025799
Synteny	Spg025799
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6601391.1 hypothetical protein SDJN03_06624, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7032169.1 hypothetical protein SDJN02_06212, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_022956920.1 uncharacterized protein LOC111458461 isoform X1 [Cucurbita moschata]

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XP_022991615.1 uncharacterized protein LOC111488176 isoform X1 [Cucurbita maxima]

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XP_023513837.1 uncharacterized protein LOC111778321 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A6J1DAC4 uncharacterized protein LOC111019130

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A0A6J1GXT8 uncharacterized protein LOC111458461 isoform X2

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A0A6J1GZ36 uncharacterized protein LOC111458461 isoform X1

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A0A6J1JTF7 uncharacterized protein LOC111488176 isoform X1

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A0A6J1JVD0 uncharacterized protein LOC111488176 isoform X2

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT1G69980.1 unknown protein

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        S  +S+ A+ H  D   G+EEI    GRR LL FKETP+GSN+TF CS SGPCV+C  SEK  EKYRCSETGYRIP KC E+++  ++   KK+ +  + 
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         D+          ++ +    + RNL D S  AT   SQ+Y TYRSC+PS +EEKLSV+GFE I+L L L+SG+ +Y R+++TV   G  +SGR+Q NSR
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        F
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Sequences

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CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTGTTGGAATTTTTCTTTGCTTCCTTTTCTTCTCCTTCTCTTAAGCTTCTCTGCTTCACTCGACGCCCAATTGCACAATACAGACAGAGTTGGGGGAAACGAAGAAAT
TGAGATAGGGTTTGGGCGCAGAGCTCTGTTGAGTTTTAAAGAGACTCCTCGGGGAAGTAACGTAACCTTTGAATGCTCTCGTTCTGGTCCCTGTGTTGCCTGCCCCTACT
CCGAAAAGAACGATGAAAAATATCGCTGCAGTGAGACTGGCTATCGTATTCCCCTGAAATGTGTGGAAATCAAAGACACTTCAAAAATTTCCAATGATAAAAAATCTCAT
GATGGTCGCTCAATGCTTGATGAGCACAAGCTTGTGATTCCTGTGCTGAATGATGCAAGTGGTCATGCTTCATCAATTGAACACAGAAATTTACGAGATAGTTCTATCTC
AGCAACAGATGGTTCTCAGACTTACATCACTTACAGAAGCTGTATTCCATCAGTTAATGAAGAAAAGTTGTCTGTGATAGGTTTTGAGGGCATTGTGCTATGCTTGCTGC
TCGTAAGTGGTTCAGTTGTATACTTCAGAAGGAAGCGAACTGTTTCAACGGCTGGTTTTGCTTCTGGCAGGGTGCAGTCAAACTCCAGGTTCTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

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DGRSMLDEHKLVIPVLNDASGHASSIEHRNLRDSSISATDGSQTYITYRSCIPSVNEEKLSVIGFEGIVLCLLLVSGSVVYFRRKRTVSTAGFASGRVQSNSRF

Spg025799 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome