; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg026050 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg026050
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionserine/arginine-rich splicing factor RSZ21
Genome locationscaffold7:1683265..1689004
RNA-Seq ExpressionSpg026050
SyntenySpg026050
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily
IPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK15593.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]6.1e-8989.95Show/hide
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XP_008446226.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 [Cucumis melo]4.7e-8989.5Show/hide
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XP_011655636.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 [Cucumis sativus]6.1e-8989.05Show/hide
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XP_022956661.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21-like [Cucurbita moschata]1.3e-8688.94Show/hide
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XP_038892593.1 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 [Benincasa hispida]4.4e-8790.77Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BEJ4 serine/arginine-rich splicing factor RSZ212.3e-8989.5Show/hide
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A0A5D3CUM7 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ21 isoform X13.0e-8989.95Show/hide
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A0A6J1DBV4 serine/arginine-rich splicing factor RSZ211.8e-8688.72Show/hide
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A0A6J1GX57 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21-like6.2e-8788.94Show/hide
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A0A6J1KZV2 serine/arginine-rich splicing factor RSZ21-like1.1e-8688.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81126 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ226.0e-5564.08Show/hide
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O81127 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ211.7e-6269.08Show/hide
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Q69KL9 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ21A5.3e-5163.13Show/hide
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Q6K4N0 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ211.7e-4962Show/hide
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        M R+Y+GNLDPRVT  +LEDEFR+FGVLRS             VWVAR+PPG+AFI+FDD+RDA DA++ LDGKNGWRVELS NS   GG    R R GG
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         E +KCYECGE GHFARECR R G  G G G RRS S  R RSP Y +   YGRRS SPR  RSPRRRS++ P RGRSYSRSP     R  SPYA+G  G
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Q9SJA6 Serine/arginine-rich splicing factor RSZ22A1.2e-5563.41Show/hide
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        GRG GG DLKCYECGE GHFARECRSRGGS    GG RRS S     PR R+SP+Y   GRRS SPR +  P  R  +P  RGR+YSRSPP   AR   P
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        YANGN
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23860.1 RS-containing zinc finger protein 211.2e-6369.08Show/hide
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         ED KCYECGE GHFARECR     RG G   RRSPSPRRRRSP Y  Y RRS SPRG+RS PRRRS+TPP+RGRSYSRSPPYR +R            R
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AT1G23860.2 RS-containing zinc finger protein 211.2e-6369.08Show/hide
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         ED KCYECGE GHFARECR     RG G   RRSPSPRRRRSP Y  Y RRS SPRG+RS PRRRS+TPP+RGRSYSRSPPYR +R            R
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AT1G23860.4 RS-containing zinc finger protein 211.5e-6167.63Show/hide
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         ED KCYECGE GHFARECR     RG G   RRSPSPRRRRSP Y      S SPRG+RS PRRRS+TPP+RGRSYSRSPPYR +R            R
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AT2G24590.1 RNA recognition motif and CCHC-type zinc finger domains containing protein8.6e-5763.41Show/hide
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        GRG GG DLKCYECGE GHFARECRSRGGS    GG RRS S     PR R+SP+Y   GRRS SPR +  P  R  +P  RGR+YSRSPP   AR   P
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AT4G31580.1 serine/arginine-rich 224.3e-5664.08Show/hide
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        M+RVY+GNLDPRVTER+LEDEFR FGV+RS             VWVARRPPGYAF++F+D RDA DAI+ALDGKNGWRVE SHN   +GGGG GG RG G
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        G      GG DLKCYECGE GHFARECR+RGG+       R    PR RRSPS   YGRRS SPR +    PRRRS + PP RGRSYSRSPP   AR   
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        PYANGN
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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