CuGenDBv2

Gene ID	Spg026558
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Chorein_N domain-containing protein
Genome location	scaffold6:18088590..18100346
RNA-Seq Expression	Spg026558
Synteny	Spg026558
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR026728 - UHRF1-binding protein 1-like IPR026854 - Vacuolar protein sorting-associated protein 13-like, N-terminal domain

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0025451.1 Chorein_N domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_008463451.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501618 [Cucumis melo]

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XP_023536640.1 uncharacterized protein LOC111797765 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038904051.1 uncharacterized protein LOC120090451 isoform X1 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

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A0A0A0L7Q7 Chorein_N domain-containing protein

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A0A1S3CJR3 uncharacterized protein LOC103501618

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A0A5A7SMI5 Chorein_N domain-containing protein

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A0A6J1FP42 uncharacterized protein LOC111447221

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A0A6J1IS31 uncharacterized protein LOC111477917

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

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Alignment

AT3G20720.1 unknown protein

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AT3G20720.2 unknown protein

4.0e-65

80.26

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGTCGATTCTGGCGCGAGCCCTCGAGTACACTCTCAAGTATTGGTTGAAATCTTTCTCACGGGACCAGTTTAAATTGCAGGGCCGGACCGCGCAGCTCTCCAATTT
GGATATCAATGGAGACGCTCTGCATTCCAGCATGGGGTTGCCGCCGGCGCTAAATGTTACGACGGCGAGGGTTGGCAAGTTGGAGATTATGTTACCTTCGCTGAGTAATG
TACAAGTTGAACCAATCGTTGTGCAAATAGATAGATTGGATTTAGTATTAGAGGAGAATCCAGATGCAGACGTGGGTAGAAGCACTAGTAGTAGTCAAACTTCTTCCAGC
CCTATGAAGGGTGGCGGTTATGGATTTGCTGATAAGATTGCAGATGGAATGACATTAGAGGTTCGCACTGTCAATCTGCTACTTGAAACTGGTGGTGGATCACGACATCA
AGGAGGAGCAACCTGGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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PMKGGGYGFADKIADGMTLEVRTVNLLLETGGGSRHQGGATW

Spg026558 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome