; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg027270 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg027270
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionMitochondrial carrier protein
Genome locationscaffold8:9673454..9677918
RNA-Seq ExpressionSpg027270
SyntenySpg027270
Gene Ontology termsGO:1901962 - S-adenosyl-L-methionine transmembrane transport (biological process)
GO:0005743 - mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000095 - S-adenosyl-L-methionine transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR018108 - Mitochondrial substrate/solute carrier
IPR023395 - Mitochondrial carrier domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605287.1 S-adenosylmethionine carrier 1, chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-3996.63Show/hide
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KAG7035245.1 S-adenosylmethionine carrier 1, chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.5e-3996.63Show/hide
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XP_022948205.1 S-adenosylmethionine carrier 1, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita moschata]2.9e-4097.75Show/hide
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XP_023007319.1 S-adenosylmethionine carrier 1, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita maxima]2.9e-4097.75Show/hide
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XP_023534780.1 S-adenosylmethionine carrier 1, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.8e-4096.63Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMV4 Uncharacterized protein1.7e-3893.26Show/hide
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A0A2P6RRI2 Putative mitochondrial carrier protein5.0e-3892.13Show/hide
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A0A6J1DKW4 S-adenosylmethionine carrier 1, chloroplastic/mitochondrial3.8e-3892.13Show/hide
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A0A6J1G954 S-adenosylmethionine carrier 1, chloroplastic/mitochondrial1.4e-4097.75Show/hide
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A0A6J1L4L9 S-adenosylmethionine carrier 1, chloroplastic/mitochondrial1.4e-4097.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HT41 Probable S-adenosylmethionine carrier 2, chloroplastic4.1e-2976.92Show/hide
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        GA+TG +TTPLDVIKTRLMVQGS  QYKG+ DC++TI+REEG  AL KG+GPRVLWIGIGGSIFFGVLE TK++L ER
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O60029 Putative mitochondrial carrier protein PET81.9e-1043.42Show/hide
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        L G +  A TTPLDV+KTR+M+     +   ++   +T+ REEG     +GIGPR +WI  GG+IF GV E+   L
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P38921 Putative mitochondrial carrier protein PET84.5e-1243.02Show/hide
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        + G +  A TTPLD +KTRLM+  +      +I     I REEGP     G+GPR +WI  GG+IF G+ E+   LL +  PTA E
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Q55E45 Mitochondrial substrate carrier family protein E7.7e-1247.37Show/hide
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        GA   A+T PLDVIKTR+ VQ S  +  YKG+ D  +TI++EEGP A +KG+G R+ WI  G ++     E  K L
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Q94AG6 S-adenosylmethionine carrier 1, chloroplastic/mitochondrial5.9e-3682.02Show/hide
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        GALTGA+TTPLDVIKTRLMVQGSA QY+GI+DCVQTIVREEG PALLKGIGPRVLWIGIGGSIFFGVLESTKR L +RRP   ++ K++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G34065.1 S-adenosylmethionine carrier 22.9e-3076.92Show/hide
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        GA+TG +TTPLDVIKTRLMVQGS  QYKG+ DC++TI+REEG  AL KG+GPRVLWIGIGGSIFFGVLE TK++L ER
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AT1G74240.1 Mitochondrial substrate carrier family protein2.7e-1245.68Show/hide
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        SS   L+   L G L+  +TTPLDV+KTRL VQGS  +YKG +D V  I R+EGP    +G  PRV+W     ++ F  +E
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AT4G39460.1 S-adenosylmethionine carrier 14.2e-3782.02Show/hide
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AT4G39460.2 S-adenosylmethionine carrier 14.2e-3782.02Show/hide
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        GALTGA+TTPLDVIKTRLMVQGSA QY+GI+DCVQTIVREEG PALLKGIGPRVLWIGIGGSIFFGVLESTKR L +RRP   ++ K++
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AT5G66380.1 folate transporter 11.7e-0936.96Show/hide
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        GAL    T P+ ++KTRL +Q   +Q   Y G++D  +TIV+EEGP AL KGI P ++ +   G+I F   E  ++++V+ +   R+    D
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTTGCAAAGGTGACTCGAGCGTTCAGATCACAGTGCAGGTTTGCGGGTCGAATGGTTGCGGGTTGCGTGGTCGCGAGTCGATTTGGTCACAAACGGCGTTGAAGGA
CGTCGACGGCGGCGGAAGACGGCTAGGGTTAGGTGTGGCAACGAAGGTGTATGGGTCAAGGCAAAACACAAGGCCACCAATGTCGGAAGTAGGATGCACCAATCAAGAAT
GGTGGCTAGGGTTCCGATGGCAGTGGCGGCTAGGGTTTCAAAGGGGAGTTGCAAGCTCCTTGCGAGGTCAACAAGCAATGAGTGAGGTGAGGTGCAGGCACGTGGTGTCG
GCTTGGTGCTTACGTGCATTTGGGGCTTGTGTGGTGGTCTTGGATAGCAACATGAATATATTCCTTCATCTTGAAGGCTCTTCTTGTCGGTTCCTTATTTGGAAGGTTCT
TCTTGGTGCATTAACTGGAGCTATAACCACCCCCCTCGATGTCATTAAGACAAGATTAATGGTTCAAGGATCTGCAAATCAGTATAAGGGAATTATCGACTGTGTCCAAA
CGATTGTCAGGGAGGAAGGACCTCCTGCACTTTTGAAGGGCATCGGACCTCGAGTGCTATGGATAGGCATTGGTGGTTCCATCTTCTTCGGCGTCCTTGAAAGCACAAAA
CGATTACTAGTAGAGAGACGTCCCACTGCTCGTGAAGACCCAAAGCAAGACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACTTGCAAAGGTGACTCGAGCGTTCAGATCACAGTGCAGGTTTGCGGGTCGAATGGTTGCGGGTTGCGTGGTCGCGAGTCGATTTGGTCACAAACGGCGTTGAAGGA
CGTCGACGGCGGCGGAAGACGGCTAGGGTTAGGTGTGGCAACGAAGGTGTATGGGTCAAGGCAAAACACAAGGCCACCAATGTCGGAAGTAGGATGCACCAATCAAGAAT
GGTGGCTAGGGTTCCGATGGCAGTGGCGGCTAGGGTTTCAAAGGGGAGTTGCAAGCTCCTTGCGAGGTCAACAAGCAATGAGTGAGGTGAGGTGCAGGCACGTGGTGTCG
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TCTTGGTGCATTAACTGGAGCTATAACCACCCCCCTCGATGTCATTAAGACAAGATTAATGGTTCAAGGATCTGCAAATCAGTATAAGGGAATTATCGACTGTGTCCAAA
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CGATTACTAGTAGAGAGACGTCCCACTGCTCGTGAAGACCCAAAGCAAGACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTCKGDSSVQITVQVCGSNGCGLRGRESIWSQTALKDVDGGGRRLGLGVATKVYGSRQNTRPPMSEVGCTNQEWWLGFRWQWRLGFQRGVASSLRGQQAMSEVRCRHVVS
AWCLRAFGACVVVLDSNMNIFLHLEGSSCRFLIWKVLLGALTGAITTPLDVIKTRLMVQGSANQYKGIIDCVQTIVREEGPPALLKGIGPRVLWIGIGGSIFFGVLESTK
RLLVERRPTAREDPKQD