; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg028865 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg028865
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionRetrotrans_gag domain-containing protein
Genome locationscaffold7:34632680..34633831
RNA-Seq ExpressionSpg028865
SyntenySpg028865
Gene Ontology termsGO:0006278 - RNA-dependent DNA biosynthetic process (biological process)
GO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0090305 - nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0003964 - RNA-directed DNA polymerase activity (molecular function)
GO:0004190 - aspartic-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0004519 - endonuclease activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAA0045180.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold30G001810 [Cucumis melo var. makuwa]8.7e-0769.81Show/hide
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KAA0056353.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-0693.94Show/hide
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TYK17971.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-0797.06Show/hide
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TYK27372.1 uncharacterized protein E5676_scaffold325G00500 [Cucumis melo var. makuwa]8.7e-0769.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TKT0 Reverse transcriptase1.1e-0797.06Show/hide
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A0A5A7TPS6 Retrotrans_gag domain-containing protein4.2e-0769.81Show/hide
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A0A5A7UKD3 DNA/RNA polymerases superfamily protein9.4e-0793.94Show/hide
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A0A5D3D150 Reverse transcriptase1.1e-0797.06Show/hide
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A0A5D3DV36 Retrotrans_gag domain-containing protein4.2e-0769.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGTCGTCAGTGTTGGGCGGCCCCCACTACGACAAAGACGATGGGAGTGTTGGGCGGGCCACACTACATCGTAGAGCTAGTAAACGTTGGTTGTTTTCAAGGTTCCG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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