; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg029824 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg029824
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionGATA transcription factor 19-like
Genome locationscaffold6:9274699..9275833
RNA-Seq ExpressionSpg029824
SyntenySpg029824
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0009908 - flower development (biological process)
GO:0031969 - chloroplast membrane (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000679 - Zinc finger, GATA-type
IPR013088 - Zinc finger, NHR/GATA-type
IPR044272 - GATA transcription factor 18/19/20


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600583.1 GATA transcription factor 18, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-11884.59Show/hide
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         TWVP HSPV TQKLPCLS AA+NNESMFIGNDDVRRTE ENGI +LSWRLNVTDHRPSLV DFTR
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XP_004146553.2 GATA transcription factor 18 isoform X1 [Cucumis sativus]5.0e-9472.1Show/hide
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        KHK++GR G G        +AA   GGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAA    T   +VAESNHHHH+   HHH M
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XP_022942846.1 GATA transcription factor 19-like [Cucurbita moschata]3.8e-11884.27Show/hide
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        T  WVP HSPV TQKLPCLS AA+NNESMFIGNDDVRRTE ENGI +LSWRLNVTDHRPSLV DFTR
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XP_022982306.1 GATA transcription factor 19-like [Cucurbita maxima]1.4e-11583.52Show/hide
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        MMHHCGG GG  SSFSVFLSVPNH GAAH+MMDIYS NY   SSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSE D+DKRAA RHHR SAGSYVSNFCWDLLHPKH
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        KS GRS A N+AA   GGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVN TA    AESN+HHH  Q  HH MF GNYTNS+
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         TWVP HSPV TQKLPCLS  AA++NESMFIGNDDVRRTE ENGI +LSWRLNVTDHRPSLV DFTR
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XP_023533953.1 GATA transcription factor 19-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-11985.23Show/hide
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        MMHHCGG GG  SSFSVFLSVPNH GAAH+MMDIYS NY SSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSE D+DKRAA RHHRRSAGSYVSNFCWDLLHPKHKS
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         GRS A N+AA    GDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVN TA    AESN+HHH  Q  HH MF GNYTNST T
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        WVP HSPV TQKLPCLS AA+NNESMFIGNDDVRRTE ENGI +LSWRLNVTDHRPSLV DFTR
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KY15 GATA-type domain-containing protein2.4e-9472.1Show/hide
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        MMHH GGGGG   SSFSVFLSVPNHGAA    D+YS++   +SSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSE D DKRAAA     HHRRSAGSYVSNFCWDLLHP
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        KHK++GR G G        +AA   GGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAA    T   +VAESNHHHH+   HHH M
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        F G+YTNS TWVPQ  P TTQK PCLS A        IGN+DV    PENGI FLSWRLNV  TDHRP+LV DFTR
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A0A1S3BSF9 GATA transcription factor 18-like4.7e-9070.97Show/hide
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        MMHH      GGGGG SSFS+FLSVPNHGAA    D+Y  STNY   SSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSE D+DKRAAAR+ HRRSAGSYVSNFCWD
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        LLHPKHK++GR   G       +AA    GDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAA    T   + AESNH       HH
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        H MF G+YTNS+TWVPQ  P TTQK PCLS A        IGNDDV    PENGI FLSWRLNV  TDHRP+LV DFTR
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A0A5A7TMS0 GATA transcription factor 18-like5.8e-8072.57Show/hide
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        STNY  +SSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSE D+DKRAAAR+ HRRSAGSYVSNFCWDLLHPKHK++GR   G       +AA   GGDPLLARRCANCD
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        TTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAA    T   + AESNH       HHH MF G+YTNS+TWVPQ  P TTQK PCLS A        IG
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        NDDV    PENGI FLSWRLNV  TDHRP+LV DFTR
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A0A6J1FQ08 GATA transcription factor 19-like1.8e-11884.27Show/hide
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        MMHHCGG  GG  SSFSVFLSVPNH GAAH+MMDIYS NY   SSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSE D+DKRAA RHHRRSAGSYVSNFCWDLLHPK
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        HKS GRS A N+AA   GGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVN TA    AESN+HHH  Q  HH MF GNYTNS
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        T  WVP HSPV TQKLPCLS AA+NNESMFIGNDDVRRTE ENGI +LSWRLNVTDHRPSLV DFTR
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A0A6J1IYZ2 GATA transcription factor 19-like6.6e-11683.52Show/hide
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        MMHHCGG GG  SSFSVFLSVPNH GAAH+MMDIYS NY   SSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSE D+DKRAA RHHR SAGSYVSNFCWDLLHPKH
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        KS GRS A N+AA   GGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVN TA    AESN+HHH  Q  HH MF GNYTNS+
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         TWVP HSPV TQKLPCLS  AA++NESMFIGNDDVRRTE ENGI +LSWRLNVTDHRPSLV DFTR
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8AX51 GATA transcription factor 151.7e-2847.03Show/hide
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        M+HH   GG                  S+FS+F  + N            AA++     +T+ PSS SSSS  SVDCTLSLGTPS+R +E  A    AA 
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Query:  HHRRSAGSYVS----NFCWDLLHPKH--KSTGRSGAGNS-AAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAA
        H       Y S       WD     +     GR   G +  AA  G D LL RRCANC T STPLWRNGPRGPKSLCNACGIR+KKEERRAAAT  TTA 
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Query:  GA
        GA
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Q6L5E5 GATA transcription factor 151.7e-2847.03Show/hide
Query:  MMHHCGGGG----------------GPSSFSVFLSVPN----------HGAAHEMMDIYSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAAR
        M+HH   GG                  S+FS+F  + N            AA++     +T+ PSS SSSS  SVDCTLSLGTPS+R +E  A    AA 
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Query:  HHRRSAGSYVS----NFCWDLLHPKH--KSTGRSGAGNS-AAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAA
        H       Y S       WD     +     GR   G +  AA  G D LL RRCANC T STPLWRNGPRGPKSLCNACGIR+KKEERRAAAT  TTA 
Subjt:  HHRRSAGSYVS----NFCWDLLHPKH--KSTGRSGAGNS-AAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAA

Query:  GA
        GA
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Q6QPM2 GATA transcription factor 196.9e-3848.05Show/hide
Query:  YSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDLLHPKHKSTGRSGAGNSAAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPL
        +S     S  SS  +SVDCTLSLGTPSTR    D D+R  + H   + G       WD L+   K  G            GG  LLARRCANCDTTSTPL
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Query:  WRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAG--AVAESNHHHHYQQQHHHHMFGGNYTNSTTWVPQHSPVTTQKLPCLSPAAMNNESMFIGNDDV
        WRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRA+   N+T+ G    A      H    ++++     Y +S+ W  QH+   TQ++P  SPA  NNE  ++  DDV
Subjt:  WRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAG--AVAESNHHHHYQQQHHHHMFGGNYTNSTTWVPQHSPVTTQKLPCLSPAAMNNESMFIGNDDV

Query:  RRTEPE-NGIPFLSWRLNVTDHRPSLVPDFT
        R  + +    PFLSWRLNV D R  LV DFT
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Q8LC79 GATA transcription factor 181.1e-4645.65Show/hide
Query:  SFSVFLSVPNHGAAHEMMDIYSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDLLHPKHK---------------
        S+S+  S+ N G   +  + Y           S S VDCTLSLGTPSTR  E D  +R   R     A S +SNF WDL+H K+                
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Query:  ---STGRSGAGNSAAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAV---AESNHHHHYQQQHHHHMFGGN
           S G SG G       GGD LLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERR  A    T  GA     +   HH+    ++H     N
Subjt:  ---STGRSGAGNSAAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAV---AESNHHHHYQQQHHHHMFGGN

Query:  YTNSTTWVPQHSPVTTQKLPCLSPAAMNNESMFIGN------DDVRRTEPENGIPFLSWRLNVTDHRPSLVPDFTR
          N T W   HS   TQ++PC  PA   NE  F+ +      ++V       G+PFLSWRLNV D R SLV DFTR
Subjt:  YTNSTTWVPQHSPVTTQKLPCLSPAAMNNESMFIGN------DDVRRTEPENGIPFLSWRLNVTDHRPSLVPDFTR

Q9ZPX0 GATA transcription factor 201.9e-2742.72Show/hide
Query:  SSFSVFLSVPNHGAAHEMMDIYSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDL-LHPKHKSTGRSGAGNSAAA
        S+FS+F S  N    H        NY   ++ SS +SVDCTLSLGTPSTR  +          HHR S+ +  +N   D  +H  +  T     G  A +
Subjt:  SSFSVFLSVPNHGAAHEMMDIYSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDL-LHPKHKSTGRSGAGNSAAA

Query:  LPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAVAES--------NHHHHYQQQHHHHMFGGNYTNSTTWVPQH
        LP       RRCA+CDTTSTPLWRNGP+GPKSLCNACGIRFKKEERRA A   T + G  + +        N   +Y   HHHH      ++S +W  Q+
Subjt:  LPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAVAES--------NHHHHYQQQHHHHMFGGNYTNSTTWVPQH

Query:  SPVTTQKLPCLSP
            TQ++P  SP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18380.1 GATA transcription factor 201.3e-2842.72Show/hide
Query:  SSFSVFLSVPNHGAAHEMMDIYSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDL-LHPKHKSTGRSGAGNSAAA
        S+FS+F S  N    H        NY   ++ SS +SVDCTLSLGTPSTR  +          HHR S+ +  +N   D  +H  +  T     G  A +
Subjt:  SSFSVFLSVPNHGAAHEMMDIYSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDL-LHPKHKSTGRSGAGNSAAA

Query:  LPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAVAES--------NHHHHYQQQHHHHMFGGNYTNSTTWVPQH
        LP       RRCA+CDTTSTPLWRNGP+GPKSLCNACGIRFKKEERRA A   T + G  + +        N   +Y   HHHH      ++S +W  Q+
Subjt:  LPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAVAES--------NHHHHYQQQHHHHMFGGNYTNSTTWVPQH

Query:  SPVTTQKLPCLSP
            TQ++P  SP
Subjt:  SPVTTQKLPCLSP

AT3G50870.1 GATA type zinc finger transcription factor family protein7.6e-4845.65Show/hide
Query:  SFSVFLSVPNHGAAHEMMDIYSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDLLHPKHK---------------
        S+S+  S+ N G   +  + Y           S S VDCTLSLGTPSTR  E D  +R   R     A S +SNF WDL+H K+                
Subjt:  SFSVFLSVPNHGAAHEMMDIYSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDLLHPKHK---------------

Query:  ---STGRSGAGNSAAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAV---AESNHHHHYQQQHHHHMFGGN
           S G SG G       GGD LLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERR  A    T  GA     +   HH+    ++H     N
Subjt:  ---STGRSGAGNSAAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAV---AESNHHHHYQQQHHHHMFGGN

Query:  YTNSTTWVPQHSPVTTQKLPCLSPAAMNNESMFIGN------DDVRRTEPENGIPFLSWRLNVTDHRPSLVPDFTR
          N T W   HS   TQ++PC  PA   NE  F+ +      ++V       G+PFLSWRLNV D R SLV DFTR
Subjt:  YTNSTTWVPQHSPVTTQKLPCLSPAAMNNESMFIGN------DDVRRTEPENGIPFLSWRLNVTDHRPSLVPDFTR

AT4G26150.1 cytokinin-responsive gata factor 19.3e-1451.43Show/hide
Query:  SGAGNSAAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAVA
        S   NS       +  + R C++C+TT TPLWR+GPRGPKSLCNACGIR +K  R A AT   TA   V+
Subjt:  SGAGNSAAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAVA

AT4G36620.1 GATA transcription factor 194.9e-3948.05Show/hide
Query:  YSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDLLHPKHKSTGRSGAGNSAAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPL
        +S     S  SS  +SVDCTLSLGTPSTR    D D+R  + H   + G       WD L+   K  G            GG  LLARRCANCDTTSTPL
Subjt:  YSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDLLHPKHKSTGRSGAGNSAAALPGGDPLLARRCANCDTTSTPL

Query:  WRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAG--AVAESNHHHHYQQQHHHHMFGGNYTNSTTWVPQHSPVTTQKLPCLSPAAMNNESMFIGNDDV
        WRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRA+   N+T+ G    A      H    ++++     Y +S+ W  QH+   TQ++P  SPA  NNE  ++  DDV
Subjt:  WRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAG--AVAESNHHHHYQQQHHHHMFGGNYTNSTTWVPQHSPVTTQKLPCLSPAAMNNESMFIGNDDV

Query:  RRTEPE-NGIPFLSWRLNVTDHRPSLVPDFT
        R  + +    PFLSWRLNV D R  LV DFT
Subjt:  RRTEPE-NGIPFLSWRLNVTDHRPSLVPDFT

AT5G56860.1 GATA type zinc finger transcription factor family protein8.7e-1265.31Show/hide
Query:  RRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAG
        R C++C+TT TPLWR+GPRGPKSLCNACGIR +K  R A A     AAG
Subjt:  RRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGCACCACTGCGGCGGCGGCGGCGGCCCCTCTTCCTTTTCTGTTTTCTTGTCTGTCCCCAACCACGGCGCCGCCCATGAGATGATGGATATCTATTCTACTAATTA
CCCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTCCTTCTTCCGTCGATTGTACTCTCTCTCTCGGCACTCCCTCCACGCGATCGTCGGAATTGGATGCCGACAAACGCGCCGCCGCAC
GCCACCACCGGCGCTCTGCCGGCTCTTATGTCTCTAACTTCTGTTGGGATTTGTTGCACCCCAAACACAAGAGTACCGGCCGTTCCGGTGCTGGTAATAGTGCCGCCGCG
CTCCCCGGCGGCGATCCACTTCTTGCTCGGCGGTGCGCTAACTGCGACACCACGTCCACTCCGCTTTGGAGAAATGGGCCGAGAGGGCCTAAGTCTTTATGCAATGCGTG
TGGGATTCGATTCAAGAAGGAAGAGCGGCGGGCGGCGGCGACGGTGAACACCACGGCGGCCGGAGCGGTGGCGGAATCAAATCACCACCACCATTACCAACAACAACACC
ACCACCACATGTTCGGCGGGAACTATACGAATTCAACTACGTGGGTCCCACAACACTCGCCGGTGACGACCCAGAAACTTCCATGCCTGTCGCCGGCCGCCATGAACAAC
GAATCGATGTTCATCGGAAACGACGACGTTCGAAGAACGGAACCCGAAAATGGAATTCCGTTCCTCTCTTGGCGCCTTAACGTTACCGATCACCGGCCCAGCCTCGTCCC
CGACTTCACAAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGCACCACTGCGGCGGCGGCGGCGGCCCCTCTTCCTTTTCTGTTTTCTTGTCTGTCCCCAACCACGGCGCCGCCCATGAGATGATGGATATCTATTCTACTAATTA
CCCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCTCCTTCTTCCGTCGATTGTACTCTCTCTCTCGGCACTCCCTCCACGCGATCGTCGGAATTGGATGCCGACAAACGCGCCGCCGCAC
GCCACCACCGGCGCTCTGCCGGCTCTTATGTCTCTAACTTCTGTTGGGATTTGTTGCACCCCAAACACAAGAGTACCGGCCGTTCCGGTGCTGGTAATAGTGCCGCCGCG
CTCCCCGGCGGCGATCCACTTCTTGCTCGGCGGTGCGCTAACTGCGACACCACGTCCACTCCGCTTTGGAGAAATGGGCCGAGAGGGCCTAAGTCTTTATGCAATGCGTG
TGGGATTCGATTCAAGAAGGAAGAGCGGCGGGCGGCGGCGACGGTGAACACCACGGCGGCCGGAGCGGTGGCGGAATCAAATCACCACCACCATTACCAACAACAACACC
ACCACCACATGTTCGGCGGGAACTATACGAATTCAACTACGTGGGTCCCACAACACTCGCCGGTGACGACCCAGAAACTTCCATGCCTGTCGCCGGCCGCCATGAACAAC
GAATCGATGTTCATCGGAAACGACGACGTTCGAAGAACGGAACCCGAAAATGGAATTCCGTTCCTCTCTTGGCGCCTTAACGTTACCGATCACCGGCCCAGCCTCGTCCC
CGACTTCACAAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMHHCGGGGGPSSFSVFLSVPNHGAAHEMMDIYSTNYPSSSSSSSPSSVDCTLSLGTPSTRSSELDADKRAAARHHRRSAGSYVSNFCWDLLHPKHKSTGRSGAGNSAAA
LPGGDPLLARRCANCDTTSTPLWRNGPRGPKSLCNACGIRFKKEERRAAATVNTTAAGAVAESNHHHHYQQQHHHHMFGGNYTNSTTWVPQHSPVTTQKLPCLSPAAMNN
ESMFIGNDDVRRTEPENGIPFLSWRLNVTDHRPSLVPDFTR