; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg029874 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg029874
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionLong chain acyl-CoA synthetase 4-like protein
Genome locationscaffold6:7924775..7929317
RNA-Seq ExpressionSpg029874
SyntenySpg029874
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044898.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein isoform 2 [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-5294.96Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNK RKQRR PNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD+RSSLRQGALA RRSNFQGNQFALA EVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

KAE8649209.1 hypothetical protein Csa_014401 [Cucumis sativus]6.8e-5391.2Show/hide
Query:  FIGCHDMAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEV
        F+G   MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNK RKQRR PNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD+RSSLRQGALA RRSNFQGNQF LA EV
Subjt:  FIGCHDMAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEV

Query:  ARKAAVAPIRPRAFNRRAPNWNKTR
        ARKAAVAPIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  ARKAAVAPIRPRAFNRRAPNWNKTR

KAG6600514.1 Nucleoside diphosphate kinase IV, chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-5293.33Show/hide
Query:  DMAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAA
        +MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNK RKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD R+SLRQGALAKRRSNFQGNQFALA EVAR AA
Subjt:  DMAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAA

Query:  VAPIRPRAFNRRAPNWNKTR
        VAPIRPRAFNRR PNW KTR
Subjt:  VAPIRPRAFNRRAPNWNKTR

XP_008451954.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103493102 [Cucumis melo]2.0e-5294.96Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNK RKQRR PNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD+RSSLRQGALA RRSNFQGNQFALA EVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

XP_022941746.1 uncharacterized protein LOC111447019 isoform X2 [Cucurbita moschata]4.4e-5294.12Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNK RKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD R+SLRQGALAKRRSNFQGNQFALA EVAR AAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAFNRR PNW KTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BTH9 uncharacterized protein LOC1034931029.6e-5394.96Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNK RKQRR PNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD+RSSLRQGALA RRSNFQGNQFALA EVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

A0A5A7TPS5 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein isoform 29.6e-5394.96Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNK RKQRR PNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD+RSSLRQGALA RRSNFQGNQFALA EVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

A0A5D3CYD8 Uncharacterized protein9.6e-5394.96Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNK RKQRR PNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD+RSSLRQGALA RRSNFQGNQFALA EVARKAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAF RRAPNWNKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

A0A6J1FLY6 uncharacterized protein LOC111447019 isoform X22.1e-5294.12Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNK RKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD R+SLRQGALAKRRSNFQGNQFALA EVAR AAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAFNRR PNW KTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

A0A6J1FPB6 uncharacterized protein LOC111447019 isoform X12.1e-5294.12Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNK RKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD R+SLRQGALAKRRSNFQGNQFALA EVAR AAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAV

Query:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR
        APIRPRAFNRR PNW KTR
Subjt:  APIRPRAFNRRAPNWNKTR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G10970.1 unknown protein1.2e-2354.62Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVAP
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT     K++R  NK +KF + A ++   K QR+MD+RS +RQGA AK+RSNFQGNQF +   VARKAA A 
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVAP

Query:  IRPRAFN-RRAPNWNKTRY
         R R +N  R  N N++R+
Subjt:  IRPRAFN-RRAPNWNKTRY

AT4G10970.2 unknown protein1.2e-2354.62Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVAP
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT     K++R  NK +KF + A ++   K QR+MD+RS +RQGA AK+RSNFQGNQF +   VARKAA A 
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVAP

Query:  IRPRAFN-RRAPNWNKTRY
         R R +N  R  N N++R+
Subjt:  IRPRAFN-RRAPNWNKTRY

AT4G10970.3 unknown protein1.2e-2354.62Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVAP
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT     K++R  NK +KF + A ++   K QR+MD+RS +RQGA AK+RSNFQGNQF +   VARKAA A 
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVAP

Query:  IRPRAFN-RRAPNWNKTRY
         R R +N  R  N N++R+
Subjt:  IRPRAFN-RRAPNWNKTRY

AT4G10970.4 unknown protein1.2e-2354.62Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVAP
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT     K++R  NK +KF + A ++   K QR+MD+RS +RQGA AK+RSNFQGNQF +   VARKAA A 
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVAP

Query:  IRPRAFN-RRAPNWNKTRY
         R R +N  R  N N++R+
Subjt:  IRPRAFN-RRAPNWNKTRY

AT4G23910.1 unknown protein1.9e-1649.09Show/hide
Query:  PLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMS--KNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVA-
        PL  E IA+TEKK+ MALDDIIK++  K   NK +K RR  NK Q F N A ++    ++  M++ S++RQGA+ KRRS FQG QF +   +ARKA+ A 
Subjt:  PLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMS--KNTGNKARKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVA-

Query:  --PIRPRAFN
            R RAFN
Subjt:  --PIRPRAFN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGCGACGATGTTGGCGTTTCGATGGAAACCCTAGATGTCTGTTTGCGATTTCGTTGAGAGCGAGGAGATTTCTTGGTTCTGTTAGGGTTTTGTCGTTGAAGGGTGT
GTATTTGGATGCGTTTGCTGTTTTTGTAATTCAGTCGGAACTAAATCAGCGGATTCTTTTCATCCCTTTCATTGGTTGTCACGATATGGCGGCTAAACCACTTACTACTG
AGGCAATTGCCATAACTGAGAAGAAGATGGACATGGCTTTAGACGATATTATCAAAATGTCAAAAAATACTGGAAATAAAGCCAGGAAGCAAAGAAGGTTTCCGAACAAA
ATGCAGAAATTTCCAAATAACGCTACTCAAGATAGACCTAGGAAGTTGCAGCGTTTCATGGACACAAGGTCTTCTCTAAGACAGGGGGCTTTGGCCAAAAGAAGGTCAAA
TTTTCAAGGGAATCAGTTTGCTTTGGCAAACGAGGTTGCAAGAAAGGCTGCAGTTGCTCCAATCCGCCCTAGAGCTTTTAATCGTAGGGCACCCAATTGGAATAAGACAA
GGTATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTGCGACGATGTTGGCGTTTCGATGGAAACCCTAGATGTCTGTTTGCGATTTCGTTGAGAGCGAGGAGATTTCTTGGTTCTGTTAGGGTTTTGTCGTTGAAGGGTGT
GTATTTGGATGCGTTTGCTGTTTTTGTAATTCAGTCGGAACTAAATCAGCGGATTCTTTTCATCCCTTTCATTGGTTGTCACGATATGGCGGCTAAACCACTTACTACTG
AGGCAATTGCCATAACTGAGAAGAAGATGGACATGGCTTTAGACGATATTATCAAAATGTCAAAAAATACTGGAAATAAAGCCAGGAAGCAAAGAAGGTTTCCGAACAAA
ATGCAGAAATTTCCAAATAACGCTACTCAAGATAGACCTAGGAAGTTGCAGCGTTTCATGGACACAAGGTCTTCTCTAAGACAGGGGGCTTTGGCCAAAAGAAGGTCAAA
TTTTCAAGGGAATCAGTTTGCTTTGGCAAACGAGGTTGCAAGAAAGGCTGCAGTTGCTCCAATCCGCCCTAGAGCTTTTAATCGTAGGGCACCCAATTGGAATAAGACAA
GGTATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLRRCWRFDGNPRCLFAISLRARRFLGSVRVLSLKGVYLDAFAVFVIQSELNQRILFIPFIGCHDMAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKARKQRRFPNK
MQKFPNNATQDRPRKLQRFMDTRSSLRQGALAKRRSNFQGNQFALANEVARKAAVAPIRPRAFNRRAPNWNKTRY