; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg029947 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg029947
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionRAB GTPase 11C
Genome locationscaffold6:13442389..13444798
RNA-Seq ExpressionSpg029947
SyntenySpg029947
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060583.1 ras-related protein RABA2a isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-11277.05Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLI--------
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATR               MRE+IR F  LDLDDE R + V+LI        
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLI--------

Query:  --------------------RMRKTFVISVV------------LVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELR
                            RMR+TFVISV+            LVEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELR
Subjt:  --------------------RMRKTFVISVV------------LVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELR

Query:  DHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAA-NIKEGKTIVVGESEANTKKA
        DHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EP+AA NIKEGKTIVVGESEANTKKA
Subjt:  DHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAA-NIKEGKTIVVGESEANTKKA

Query:  CCSSS
        CCSSS
Subjt:  CCSSS

KAG6600719.1 Ras-related protein RABA2a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.3e-10579.55Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
        IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPA ANIKEGKTIVVGESE N+KKACCSSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS

XP_004133721.1 ras-related protein RABA2a [Cucumis sativus]1.1e-10480.38Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAA-NIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
        IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EPAAA NIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAA-NIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS

XP_022989944.1 ras-related protein RABA2a-like [Cucurbita maxima]4.9e-10579.55Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNV+RWLKELRDHAD+NIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSY+EKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
        IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEAN+KKACCSSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS

XP_038905598.1 ras-related protein RABA2a [Benincasa hispida]3.4e-10681.06Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
        IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6P8 Uncharacterized protein5.3e-10580.38Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAA-NIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
        IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EPAAA NIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAA-NIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS

A0A1S3BTD1 ras-related protein RABA2a1.2e-10480Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAA-NIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
        IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EP+AA NIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAA-NIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS

A0A5D3BW01 Ras-related protein RABA2a isoform X11.2e-11277.05Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLI--------
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATR               MRE+IR F  LDLDDE R + V+LI        
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLI--------

Query:  --------------------RMRKTFVISVV------------LVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELR
                            RMR+TFVISV+            LVEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELR
Subjt:  --------------------RMRKTFVISVV------------LVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELR

Query:  DHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAA-NIKEGKTIVVGESEANTKKA
        DHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EP+AA NIKEGKTIVVGESEANTKKA
Subjt:  DHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAA-NIKEGKTIVVGESEANTKKA

Query:  CCSSS
        CCSSS
Subjt:  CCSSS

A0A6J1FQI3 ras-related protein RABA2a-like6.9e-10579.55Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
        IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPA ANIKEGKTIVVGESE N+KKACCSSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS

A0A6J1JQR7 ras-related protein RABA2a-like2.4e-10579.55Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNV+RWLKELRDHAD+NIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSY+EKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS
        IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEAN+KKACCSSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04486 Ras-related protein RABA2a2.3e-9773.68Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MARRPD++YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKP TF+NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAA-ANIKEGKTI-VVGESEANTKKACCSSS
        IETSALEA NVEKAFQTILSE+YRIISKKS++SD+  A ANIKEG+TI V   SE+N KK CCSSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAA-ANIKEGKTI-VVGESEANTKKACCSSS

Q39434 Ras-related protein Rab2BV1.9e-8362.36Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TFDNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DLKHLRAV+ ED Q+ AEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSS
        +ETSALEA N+EKAFQTIL+EIY IISKK+L + E ++    +G TI V ++ AN +++CCS+
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSS

Q40193 Ras-related protein Rab11C4.6e-8261.89Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TFDNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLRAV+ +D  + +EKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDE-PAAANIK-EGKTIVVGESEANTKKACCSS
        +ETSALEATN+EKAFQTIL+EIY I+SKK+L + E  A A++  +G TI V ++  NTKK CCS+
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDE-PAAANIK-EGKTIVVGESEANTKKACCSS

Q96283 Ras-related protein RABA2c1.1e-8363.91Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        M  R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT Q                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEG+TIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TFDNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED QS AEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIK---EGKTIVVGESEANTKKACCSS
        +ETSALEATNVEKAFQTIL EIY IISKK+L + E AAAN     +G TI V ++    K+ACCSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIK---EGKTIVVGESEANTKKACCSS

Q9LNW1 Ras-related protein RABA2b2.1e-8262.36Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF+NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED +S AEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSS
        +ETSALEATN+EKAFQTILSEIY IISKK+L + E A     +G  I + +S A  +K CCS+
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B1.5e-8362.36Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF+NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED +S AEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSS
        +ETSALEATN+EKAFQTILSEIY IISKK+L + E A     +G  I + +S A  +K CCS+
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSS

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C1.6e-9873.68Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MARRPD++YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKP TF+NVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAA-ANIKEGKTI-VVGESEANTKKACCSSS
        IETSALEA NVEKAFQTILSE+YRIISKKS++SD+  A ANIKEG+TI V   SE+N KK CCSSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAA-ANIKEGKTI-VVGESEANTKKACCSSS

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C7.8e-8563.91Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        M  R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT Q                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEG+TIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TFDNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED QS AEKEGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIK---EGKTIVVGESEANTKKACCSS
        +ETSALEATNVEKAFQTIL EIY IISKK+L + E AAAN     +G TI V ++    K+ACCSS
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIK---EGKTIVVGESEANTKKACCSS

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D7.3e-8362.03Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI
        MA R + DYDYLFK+VLIGDSGVGK+N+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQ                                             
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVI

Query:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF
            VEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TFDNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK DL HLR+VA ED Q+ AE EGLSF
Subjt:  SVVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSF

Query:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIK---EGKTIVVGESEANTKKACCSS
        +ETSALEATNVEKAFQT+L+EIY IISKK+L + E AAAN     +G TI V ++    K+ CCS+
Subjt:  IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPAAANIK---EGKTIVVGESEANTKKACCSS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F2.8e-7457.52Show/hide
Query:  ARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVIS
        A R DD+YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEF LESKSTIGVEFATR++ V                        DD++                 
Subjt:  ARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVIS

Query:  VVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFI
                +KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVT+ +TF+NV RWLKELRDH D+NIVIM +GNK DL+HLRAV+TEDA+++AE+E   F+
Subjt:  VVLVEGRTIKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFI

Query:  ETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLN-SDEPAAANIKEGKTIVVGESE---ANTKKACCSS
        ETSALE+ NVE AF  +LS+IYR++S+K+L+  D+PAA  + +G+TI VG  +   A  K  CCS+
Subjt:  ETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLN-SDEPAAANIKEGKTIVVGESE---ANTKKACCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCGGAGACCCGACGACGACTACGATTATCTCTTCAAAGTTGTTCTAATCGGCGATTCCGGCGTTGGAAAATCCAACCTCCTTTCCCGATTCACTCGGAATGAGTT
TTGTTTGGAGTCCAAGTCCACCATTGGCGTCGAATTCGCCACTCGTACTCTTCAGGTTTCTCTCTCTCTTGATTTCTCTCTCATTAGTGAAATGCGGGAAGTTATTCGTC
TTTTTATTGCCTTGGATTTGGACGATGAATTAAGAACAATGCTTGTGAATTTGATTAGAATGAGGAAAACTTTTGTAATATCTGTAGTTCTTGTCGAGGGAAGAACCATA
AAAGCTCAGATATGGGACACGGCCGGTCAAGAGCGTTATCGAGCAATAACCAGTGCTTACTATAGGGGTGCCCTTGGAGCCCTTCTAGTGTATGACGTAACAAAGCCAAT
GACATTCGACAATGTAAGCCGCTGGTTGAAGGAACTTAGGGACCATGCAGATTCCAACATAGTCATCATGTTAATCGGAAACAAAACCGATCTGAAACACCTCCGAGCAG
TGGCGACAGAGGACGCACAGAGCTACGCCGAGAAAGAAGGGCTATCGTTCATCGAAACTTCTGCTCTTGAAGCAACAAACGTGGAGAAGGCCTTCCAAACTATTCTCTCA
GAGATATATCGGATAATCAGTAAGAAGTCCCTCAACTCGGATGAGCCTGCTGCTGCAAACATCAAGGAAGGAAAAACCATTGTGGTTGGTGAATCGGAGGCCAATACAAA
GAAGGCTTGTTGCTCCTCTTCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCCGGAGACCCGACGACGACTACGATTATCTCTTCAAAGTTGTTCTAATCGGCGATTCCGGCGTTGGAAAATCCAACCTCCTTTCCCGATTCACTCGGAATGAGTT
TTGTTTGGAGTCCAAGTCCACCATTGGCGTCGAATTCGCCACTCGTACTCTTCAGGTTTCTCTCTCTCTTGATTTCTCTCTCATTAGTGAAATGCGGGAAGTTATTCGTC
TTTTTATTGCCTTGGATTTGGACGATGAATTAAGAACAATGCTTGTGAATTTGATTAGAATGAGGAAAACTTTTGTAATATCTGTAGTTCTTGTCGAGGGAAGAACCATA
AAAGCTCAGATATGGGACACGGCCGGTCAAGAGCGTTATCGAGCAATAACCAGTGCTTACTATAGGGGTGCCCTTGGAGCCCTTCTAGTGTATGACGTAACAAAGCCAAT
GACATTCGACAATGTAAGCCGCTGGTTGAAGGAACTTAGGGACCATGCAGATTCCAACATAGTCATCATGTTAATCGGAAACAAAACCGATCTGAAACACCTCCGAGCAG
TGGCGACAGAGGACGCACAGAGCTACGCCGAGAAAGAAGGGCTATCGTTCATCGAAACTTCTGCTCTTGAAGCAACAAACGTGGAGAAGGCCTTCCAAACTATTCTCTCA
GAGATATATCGGATAATCAGTAAGAAGTCCCTCAACTCGGATGAGCCTGCTGCTGCAAACATCAAGGAAGGAAAAACCATTGTGGTTGGTGAATCGGAGGCCAATACAAA
GAAGGCTTGTTGCTCCTCTTCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVSLSLDFSLISEMREVIRLFIALDLDDELRTMLVNLIRMRKTFVISVVLVEGRTI
KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVSRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILS
EIYRIISKKSLNSDEPAAANIKEGKTIVVGESEANTKKACCSSS