; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg030164 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg030164
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptioncytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein
Genome locationscaffold6:14782023..14787567
RNA-Seq ExpressionSpg030164
SyntenySpg030164
Gene Ontology termsGO:0017004 - cytochrome complex assembly (biological process)
GO:0045454 - cell redox homeostasis (biological process)
GO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003834 - Cytochrome C biogenesis protein, transmembrane domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022142907.1 cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein isoform X1 [Momordica charantia]1.6e-17090.5Show/hide
Query:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASVY
        MSL+MSHSGG GINSI I +SKR  SKTRGK V+PMKL+GR  AAED+SKDIE VE+KNSS HFQA+AFVN ISAT+FL V+AAKA  LKDMWEGAASVY
Subjt:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASVY

Query:  TVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAAS
        T+ADGGIGDWFG FLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKS+ EVVGNS+AFSLGLATTLALLGIAAS
Subjt:  TVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAAS

Query:  FAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTY
        FAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIEL+LPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLAT+LGYVATSKDP+VGGSLLLTY
Subjt:  FAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTY

Query:  TTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM
        TTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINP+SGALLLGGGVYTFLDR+FPVTM+M
Subjt:  TTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM

XP_022985240.1 cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein [Cucurbita maxima]3.6e-16789.69Show/hide
Query:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDI-ESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV
        M  LM+HSGGFGINSI+I TSKR   +  GKYV P+  +G   AA DQ+KDI E VES NSSNHF A+AFVNAISATSFLAVDAAKA +L+ MWEGAASV
Subjt:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDI-ESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV

Query:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA
        YT+ADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSR EVVGNSVAF+LGLATTLALLGIAA
Subjt:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA

Query:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT
        SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDP+VGGSLLLT
Subjt:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT

Query:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM
        YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVY+FLDR+FPVTM+M
Subjt:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM

XP_023553444.1 cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-16689.14Show/hide
Query:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDI-ESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV
        M  LM+HSGGFGINSI+I TSK    +  GKYV P+K +G   AA+DQ+KDI E VES NSSNHF A+AFVNA+SATSFLAVDAAKA +L+ MWEGAASV
Subjt:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDI-ESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV

Query:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA
        YT+ADGGIGDW GGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSR EVVGNSVAF+LGLATTLALLGIAA
Subjt:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA

Query:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT
        SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDP+VGGSLLLT
Subjt:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT

Query:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM
        YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVY+FLDR+FPVTM+M
Subjt:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM

XP_038903026.1 cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein isoform X1 [Benincasa hispida]5.0e-16989.34Show/hide
Query:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRF-QSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMW------
        MSLLMSHSGGF INS +I +SKR  QS T GKYV+P+K +GR  AA+DQSKDIE VE+KNSSN+FQA+AFVNAISATSFLAVDAAKA  LK MW      
Subjt:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRF-QSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMW------

Query:  -EGAASVYTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTL
         EGAA+VYT+ADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSR EVVGNSVAFSLGLATTL
Subjt:  -EGAASVYTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTL

Query:  ALLGIAASFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLV
        ALLGIAASFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIEL+LPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLAT+LGYVATSKDP++
Subjt:  ALLGIAASFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLV

Query:  GGSLLLTYTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM
        GGSLLLTYTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDR+FPVTM+M
Subjt:  GGSLLLTYTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM

XP_038903027.1 cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein isoform X2 [Benincasa hispida]4.1e-17191.09Show/hide
Query:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRF-QSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV
        MSLLMSHSGGF INS +I +SKR  QS T GKYV+P+K +GR  AA+DQSKDIE VE+KNSSN+FQA+AFVNAISATSFLAVDAAKA  LK MWEGAA+V
Subjt:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRF-QSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV

Query:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA
        YT+ADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSR EVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA
Subjt:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA

Query:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT
        SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIEL+LPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLAT+LGYVATSKDP++GGSLLLT
Subjt:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT

Query:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM
        YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDR+FPVTM+M
Subjt:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BSW3 cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein isoform X11.6e-16588.58Show/hide
Query:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRF-QSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV
        MS+LMS+SGGF INSI+I TSKR     T GKYV+P+K +GR  AA+DQ +DIE VE++NS N+FQA+AFVNAISATSFLAVDAAKA  LK MWEGAASV
Subjt:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRF-QSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV

Query:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA
        YT+ADGG+GDWFGG LYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKS+ EVVGNSVAFSLGLATTLALLGI A
Subjt:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA

Query:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT
        SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFF+NFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDP++GGSLLLT
Subjt:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT

Query:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM
        YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLL GGVYTFLDR+FPVTM+M
Subjt:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM

A0A5D3BU70 Cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein isoform X15.6e-16688.86Show/hide
Query:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRF-QSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV
        MS+LMS+SGGF INSI+I TSKR     T GKYV+P+K +GR  AA+DQ KDIE VE++NS N+FQA+AFVNAISATSFLAVDAAKA  LK MWEGAASV
Subjt:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRF-QSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV

Query:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA
        YT+ADGG+GDWFGG LYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKS+ EVVGNSVAFSLGLATTLALLGI A
Subjt:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA

Query:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT
        SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFF+NFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDP++GGSLLLT
Subjt:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT

Query:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM
        YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLL GGVYTFLDR+FPVTM+M
Subjt:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM

A0A6J1CP79 cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein isoform X17.5e-17190.5Show/hide
Query:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASVY
        MSL+MSHSGG GINSI I +SKR  SKTRGK V+PMKL+GR  AAED+SKDIE VE+KNSS HFQA+AFVN ISAT+FL V+AAKA  LKDMWEGAASVY
Subjt:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASVY

Query:  TVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAAS
        T+ADGGIGDWFG FLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKS+ EVVGNS+AFSLGLATTLALLGIAAS
Subjt:  TVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAAS

Query:  FAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTY
        FAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIEL+LPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLAT+LGYVATSKDP+VGGSLLLTY
Subjt:  FAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTY

Query:  TTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM
        TTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINP+SGALLLGGGVYTFLDR+FPVTM+M
Subjt:  TTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM

A0A6J1ENE1 cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein1.9e-16689.14Show/hide
Query:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDI-ESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV
        M  LM+HSGGFGINS +I TSK    +  GKYV P+KL+G   AA+ Q+KDI E VES NSSNHF A+AFVNAISATSFLAVDAAKA +L+ MWEGAA V
Subjt:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDI-ESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV

Query:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA
        YT+ADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSR EVVGNSVAF+LGLATTLALLGIAA
Subjt:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA

Query:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT
        SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDP+VGGSLLLT
Subjt:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT

Query:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM
        YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVY+FLDR+FPVTM+M
Subjt:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM

A0A6J1JAT1 cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein1.7e-16789.69Show/hide
Query:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDI-ESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV
        M  LM+HSGGFGINSI+I TSKR   +  GKYV P+  +G   AA DQ+KDI E VES NSSNHF A+AFVNAISATSFLAVDAAKA +L+ MWEGAASV
Subjt:  MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDI-ESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASV

Query:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA
        YT+ADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSR EVVGNSVAF+LGLATTLALLGIAA
Subjt:  YTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAA

Query:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT
        SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDP+VGGSLLLT
Subjt:  SFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLT

Query:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM
        YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVY+FLDR+FPVTM+M
Subjt:  YTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P51364 Putative cytochrome c-type biogenesis protein DbsD-like1.0e-2329.74Show/hide
Query:  LYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGLP
        LY++    N     QL+ ++  S + +F +G  TS SPC +S+LP+ + YI   G   S+ + + N   F LG  ++   LG+ A+   K Y Q+  G+P
Subjt:  LYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGLP

Query:  LAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAASF
        + ++ + + MG +LL I+ L      +N + R    N   +++ YL+G+   LA S CSTP+  TLL +V ++ +  +G   +L Y+ GY+ P+++ + F
Subjt:  LAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAASF

Query:  AGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYT
        +    +  S    ++   P SG +LL  G ++
Subjt:  AGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYT

Q1XDC3 Putative cytochrome c-type biogenesis protein DbsD-like3.1e-2031.25Show/hide
Query:  FLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGL
        F+Y++    N     QL+ L+ TS + IF +G  TSLSPC +S+LP+ + YI       +      N   F LG  ++   LGI A+   K Y Q   G+
Subjt:  FLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGL

Query:  PLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAAS
        P  ++ + + MGLNLL I+ +  P F           N   + + YL+G+   +A S CSTP+  TLL ++ +++    G   +L Y+ GY+ P+++ + 
Subjt:  PLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAAS

Query:  FAGALQSL
        F+ +   L
Subjt:  FAGALQSL

Q2QY07 Cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein 22.0e-12081.63Show/hide
Query:  ISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASVYTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGK
        ++  S +A  AA A  + D   G++ +  +AD  IGDWFG  LYSAGQQAN AVQDQLSALSFTSLAVIFGAG VTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGK
Subjt:  ISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASVYTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGK

Query:  SRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPC
         R+EVVGNSVAFSLGLATTLA+LG+AASFAGKAYGQ+GQGLP+AASGLAVIMGLNLLE+IELQLPSFF ++DPR+AAAN PSSVQAYLAGLTFALAASPC
Subjt:  SRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPC

Query:  STPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVT
        STPVLATLLGYVATS+DP+VGGSLLLTYTTGYV PLL+AASFAGALQSLLSFR++S+WINPISGA LLGGGVYT LDR+FP T
Subjt:  STPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVT

Q2RAR6 Cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein 12.6e-12081.27Show/hide
Query:  ISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASVYTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGK
        ++  S +A  AA A  + D   G++ +  +AD  +GDWFG  LYSAGQQAN AVQDQLSALSFTSLAVIFGAG VTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGK
Subjt:  ISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASVYTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGK

Query:  SRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPC
         R+EVVGNSVAFSLGLATTLA+LG+AASFAGKAYGQ+GQGLP+AASGLAVIMGLNLLE+IELQLPSFF ++DPR+AAAN PSSVQAYLAGLTFALAASPC
Subjt:  SRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPC

Query:  STPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVT
        STPVLATLLGYVATS+DP+VGGSLLLTYTTGYV PLL+AASFAGALQSLLSFR++S+WINPISGA LLGGGVYT LDR+FP T
Subjt:  STPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVT

Q9M5P3 Cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein1.4e-11868.73Show/hide
Query:  SGGF--GINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALK-DMWEGAASVYTVAD
        +GGF  G +S R+   KR+     GK+      + R  +    +  +E +ESK+     +     + +   + + + +AKA  LK  + + A S+Y +A+
Subjt:  SGGF--GINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALK-DMWEGAASVYTVAD

Query:  GGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGK
        G +GD  G FLYSA QQAN AVQDQLSALS TSLAVIFGAG VTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSR +V+G++VAF+LGLATTLALLGI ASFAGK
Subjt:  GGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGK

Query:  AYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGY
        AYGQIGQGLP+AASGLA++MGLNLLEIIELQLPSFF+NFDPR+AAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATS+DP++GGSLLLTYTTGY
Subjt:  AYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGY

Query:  VVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFP-VTMSM
        V PL++AASFAGALQSLLS RK S+WINPISGALLLGGG+YTFLDR+FP  TM M
Subjt:  VVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFP-VTMSM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G54290.1 cytochrome c biogenesis protein family1.0e-11968.73Show/hide
Query:  SGGF--GINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALK-DMWEGAASVYTVAD
        +GGF  G +S R+   KR+     GK+      + R  +    +  +E +ESK+     +     + +   + + + +AKA  LK  + + A S+Y +A+
Subjt:  SGGF--GINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALK-DMWEGAASVYTVAD

Query:  GGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGK
        G +GD  G FLYSA QQAN AVQDQLSALS TSLAVIFGAG VTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSR +V+G++VAF+LGLATTLALLGI ASFAGK
Subjt:  GGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGK

Query:  AYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGY
        AYGQIGQGLP+AASGLA++MGLNLLEIIELQLPSFF+NFDPR+AAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATS+DP++GGSLLLTYTTGY
Subjt:  AYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGY

Query:  VVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFP-VTMSM
        V PL++AASFAGALQSLLS RK S+WINPISGALLLGGG+YTFLDR+FP  TM M
Subjt:  VVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDRMFP-VTMSM

AT5G54290.2 cytochrome c biogenesis protein family2.3e-11975.4Show/hide
Query:  IESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALK-DMWEGAASVYTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSL
        +E +ESK+     +     + +   + + + +AKA  LK  + + A S+Y +A+G +GD  G FLYSA QQAN AVQDQLSALS TSLAVIFGAG VTSL
Subjt:  IESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALK-DMWEGAASVYTVADGGIGDWFGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSL

Query:  SPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAA
        SPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSR +V+G++VAF+LGLATTLALLGI ASFAGKAYGQIGQGLP+AASGLA++MGLNLLEIIELQLPSFF+NFDPR+AAA
Subjt:  SPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGLPLAASGLAVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAA

Query:  NFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDR
        NFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATS+DP++GGSLLLTYTTGYV PL++AASFAGALQSLLS RK S+WINPISGALLLGGG+YTFLDR
Subjt:  NFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSWINPISGALLLGGGVYTFLDR

Query:  MFP-VTMSM
        +FP  TM M
Subjt:  MFP-VTMSM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTCTCCTTATGAGCCATTCTGGTGGTTTCGGCATCAATTCCATCAGAATTCCCACCTCTAAACGTTTTCAGAGCAAGACGCGAGGTAAATATGTCGTGCCTATGAA
ATTGGTAGGGAGACTATTCGCAGCTGAGGATCAAAGTAAAGATATTGAGTCAGTGGAGAGTAAAAACAGCAGCAATCATTTTCAAGCCGTGGCTTTTGTAAATGCCATTT
CTGCGACAAGTTTCCTTGCAGTAGACGCAGCAAAGGCTGGAGCTTTAAAGGATATGTGGGAAGGAGCTGCTTCTGTTTATACTGTGGCTGATGGTGGCATTGGAGATTGG
TTTGGAGGCTTCTTGTATTCAGCTGGACAACAGGCTAATGTTGCAGTTCAGGATCAATTATCTGCTCTCAGTTTTACTAGTTTGGCAGTAATTTTTGGGGCAGGGTTCGT
AACCAGCCTTTCCCCTTGCACATTGAGTGTTTTGCCTTTGACCCTTGGTTACATAGGAGCTTTTGGATCAGGGAAGAGCAGAACAGAGGTTGTTGGAAACTCTGTTGCTT
TCTCTTTAGGACTTGCTACGACCCTAGCACTGTTAGGCATAGCTGCTTCTTTTGCTGGAAAGGCATATGGACAGATTGGCCAAGGATTACCTTTGGCTGCTTCAGGCTTA
GCTGTTATTATGGGCCTAAACTTATTGGAGATAATTGAGTTGCAACTACCCTCATTCTTTGACAATTTTGATCCCCGTTCTGCCGCTGCCAACTTTCCATCAAGTGTGCA
AGCATATCTAGCTGGGCTTACATTTGCTTTGGCTGCATCTCCTTGCAGTACTCCTGTGTTGGCTACGTTGCTTGGATATGTAGCTACATCCAAGGATCCGTTAGTCGGGG
GCAGCCTCCTTTTGACATACACAACTGGCTACGTCGTGCCGCTACTTCTTGCAGCTTCATTTGCTGGAGCATTACAGAGCCTTCTGTCATTCCGCAAGTTCTCATCATGG
ATTAATCCTATAAGTGGTGCTCTCCTGTTGGGTGGAGGTGTTTATACTTTCTTGGACAGAATGTTTCCAGTCACAATGTCAATGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTCTCCTTATGAGCCATTCTGGTGGTTTCGGCATCAATTCCATCAGAATTCCCACCTCTAAACGTTTTCAGAGCAAGACGCGAGGTAAATATGTCGTGCCTATGAA
ATTGGTAGGGAGACTATTCGCAGCTGAGGATCAAAGTAAAGATATTGAGTCAGTGGAGAGTAAAAACAGCAGCAATCATTTTCAAGCCGTGGCTTTTGTAAATGCCATTT
CTGCGACAAGTTTCCTTGCAGTAGACGCAGCAAAGGCTGGAGCTTTAAAGGATATGTGGGAAGGAGCTGCTTCTGTTTATACTGTGGCTGATGGTGGCATTGGAGATTGG
TTTGGAGGCTTCTTGTATTCAGCTGGACAACAGGCTAATGTTGCAGTTCAGGATCAATTATCTGCTCTCAGTTTTACTAGTTTGGCAGTAATTTTTGGGGCAGGGTTCGT
AACCAGCCTTTCCCCTTGCACATTGAGTGTTTTGCCTTTGACCCTTGGTTACATAGGAGCTTTTGGATCAGGGAAGAGCAGAACAGAGGTTGTTGGAAACTCTGTTGCTT
TCTCTTTAGGACTTGCTACGACCCTAGCACTGTTAGGCATAGCTGCTTCTTTTGCTGGAAAGGCATATGGACAGATTGGCCAAGGATTACCTTTGGCTGCTTCAGGCTTA
GCTGTTATTATGGGCCTAAACTTATTGGAGATAATTGAGTTGCAACTACCCTCATTCTTTGACAATTTTGATCCCCGTTCTGCCGCTGCCAACTTTCCATCAAGTGTGCA
AGCATATCTAGCTGGGCTTACATTTGCTTTGGCTGCATCTCCTTGCAGTACTCCTGTGTTGGCTACGTTGCTTGGATATGTAGCTACATCCAAGGATCCGTTAGTCGGGG
GCAGCCTCCTTTTGACATACACAACTGGCTACGTCGTGCCGCTACTTCTTGCAGCTTCATTTGCTGGAGCATTACAGAGCCTTCTGTCATTCCGCAAGTTCTCATCATGG
ATTAATCCTATAAGTGGTGCTCTCCTGTTGGGTGGAGGTGTTTATACTTTCTTGGACAGAATGTTTCCAGTCACAATGTCAATGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSLLMSHSGGFGINSIRIPTSKRFQSKTRGKYVVPMKLVGRLFAAEDQSKDIESVESKNSSNHFQAVAFVNAISATSFLAVDAAKAGALKDMWEGAASVYTVADGGIGDW
FGGFLYSAGQQANVAVQDQLSALSFTSLAVIFGAGFVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSRTEVVGNSVAFSLGLATTLALLGIAASFAGKAYGQIGQGLPLAASGL
AVIMGLNLLEIIELQLPSFFDNFDPRSAAANFPSSVQAYLAGLTFALAASPCSTPVLATLLGYVATSKDPLVGGSLLLTYTTGYVVPLLLAASFAGALQSLLSFRKFSSW
INPISGALLLGGGVYTFLDRMFPVTMSM