; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg030697 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg030697
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationscaffold11:24833214..24839162
RNA-Seq ExpressionSpg030697
SyntenySpg030697
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141207.1 tryptophan synthase alpha chain [Cucumis sativus]4.4e-14681.32Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR+LPLNKIPNTLIFSPRPCKISV QSKRFAP AAL A P VGLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF AIISMLK VIPELS PISLFTYYNPILKRGVENFM+ IKD GVR                          GLVV
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV

Query:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE
        PDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLTTPTTPK+RMK+IVEASEGF+YLVSS+GVTGTRTSVS RVQTLLEE+K          +VTEKPVAVGFGISKPE
Subjt:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        HVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFT+SLKSALS
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

XP_008465320.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]4.7e-14881.9Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP
        MDIAFK SR+LPLNKIPNTLIFSPRPCKISV Q+KRFAP AAL A P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF AIISMLK VIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFM+ IKD GVR                          GLVV
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV

Query:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE
        PDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLTTPTTPK+RMK IVEASEGF+YLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEE+K          +VTEKPVAVGFGISKPE
Subjt:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        HVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

XP_022932801.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita moschata]8.0e-14881.61Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LPLNKIP T I SPRPC ISVFQSKRFAP AALTASP  GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV
        YSDPLADGPVIQAAATR+LAR+TNF AIISMLK VIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFM+TI+DAGVR                          GLVV
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV

Query:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE
        PDVPLEET +LR+EAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMK+IVEASEGF+YLVSSVGVTG RTSVSGRVQ+LLEEIK          +VTEKPVAVGFGISKPE
Subjt:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELE FTKSL+SALS
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

XP_023528646.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-14781.61Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LPLNKIP T I SPRPC ISVFQSKRFAP AALTASP  GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV
        YSDPLADGPVIQAAATR+L R+TNF AIISMLK VIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFM+TI+DAGVR                          GLVV
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV

Query:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE
        PDVPLEET +LR+EAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMK+IVEASEGF+YLVSSVGVTG RTSVSGRVQ+LLEEIK          +VTEKPVAVGFGISKPE
Subjt:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELE FTKSLKSALS
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

XP_038906368.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Benincasa hispida]4.4e-14681.32Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP
        M IAFKSS   PLNKIP++ IFSPRPCKISVF+SKRFAP A L ASP VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF AIISMLK VIPELSCPISLFTYYN ILKRG+ENF++ IKDAGVR                          GLVV
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV

Query:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE
        PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDI EASEGF+YLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEE+K          +VT+KPVAVGFGISKPE
Subjt:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        HVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD81 Tryptophan synthase2.1e-14681.32Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR+LPLNKIPNTLIFSPRPCKISV QSKRFAP AAL A P VGLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF AIISMLK VIPELS PISLFTYYNPILKRGVENFM+ IKD GVR                          GLVV
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV

Query:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE
        PDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLTTPTTPK+RMK+IVEASEGF+YLVSS+GVTGTRTSVS RVQTLLEE+K          +VTEKPVAVGFGISKPE
Subjt:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        HVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFT+SLKSALS
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

A0A1S3CNL8 Tryptophan synthase2.3e-14881.9Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP
        MDIAFK SR+LPLNKIPNTLIFSPRPCKISV Q+KRFAP AAL A P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF AIISMLK VIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFM+ IKD GVR                          GLVV
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV

Query:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE
        PDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLTTPTTPK+RMK IVEASEGF+YLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEE+K          +VTEKPVAVGFGISKPE
Subjt:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        HVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

A0A1S4E560 Tryptophan synthase2.8e-14681.03Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP
        MDIAFK SR+LPLNKIPNTLIFSPRPCKISV Q+KRFAP AAL A P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF AIISMLK VIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFM+ IKD                              GLVV
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV

Query:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE
        PDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLTTPTTPK+RMK IVEASEGF+YLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEE+K          +VTEKPVAVGFGISKPE
Subjt:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        HVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

A0A5D3E2H9 Tryptophan synthase2.3e-14881.9Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP
        MDIAFK SR+LPLNKIPNTLIFSPRPCKISV Q+KRFAP AAL A P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV
        YSDPLADGPVIQAAATRSLAR+TNF AIISMLK VIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFM+ IKD GVR                          GLVV
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV

Query:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE
        PDVPLEETE+LRKEAVK+NIELVLLTTPTTPK+RMK IVEASEGF+YLVSS+GVTGTRTSVSGRVQTLLEE+K          +VTEKPVAVGFGISKPE
Subjt:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        HVKQVA WGADG+I+GSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

A0A6J1EXE2 Tryptophan synthase3.9e-14881.61Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP
        MDIAFKSSR LPLNKIP T I SPRPC ISVFQSKRFAP AALTASP  GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGVP
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV
        YSDPLADGPVIQAAATR+LAR+TNF AIISMLK VIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFM+TI+DAGVR                          GLVV
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVV

Query:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE
        PDVPLEET +LR+EAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMK+IVEASEGF+YLVSSVGVTG RTSVSGRVQ+LLEEIK          +VTEKPVAVGFGISKPE
Subjt:  PDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPE

Query:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELE FTKSL+SALS
Subjt:  HVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B7JUK2 Tryptophan synthase alpha chain1.0e-7351.85Show/hide
Query:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYN
        +S+ F  LR++ + ALIP+ITAGDPDL TTA+AL++L A G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L R      ++ ++K V PE+  PI LFTYYN
Subjt:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYN

Query:  PILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVS
        PI  RGVE F+  +K AGV+                          GLVVPD+PLEE E L K A +  I + LL  PT+P +R++ I   S+GFIYLVS
Subjt:  PILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVS

Query:  SVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
          GVTG R+ V+ RV+ LL  ++            T+KP+ VGFGISKPEH  QV  WGAD VIVGSAMVK L E  +PEEGLK +  F + LK AL
Subjt:  SVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

B8HPH2 Tryptophan synthase alpha chain3.6e-7451Show/hide
Query:  VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTY
        V +S  F+ LR++ + ALIP+ITAGDP L  TA+AL+VL   G+D+IELGVPYSDPLADGP IQAAATR+L + T   A++ M+  V P L  P+ LFTY
Subjt:  VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTY

Query:  YNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYL
        YNPI  RGVE F+  +  AGV+                          GLVVPD+PLEE + +  +A    IEL LL  PTTP+ R+  I E S+GFIYL
Subjt:  YNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYL

Query:  VSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        VS+ GVTG R+ V GRV  LL E+          QQVT+KP+ VGFGIS+PEH +QV  WGAD  IVGSA VK L E  +PE+GL  + +F +SLK+AL+
Subjt:  VSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSALS

O22765 Tryptophan synthase alpha chain4.8e-11171.38Show/hide
Query:  TASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPI
        T S  VGLSETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNF +IISMLK VIP+LSCPI
Subjt:  TASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPI

Query:  SLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASE
        +LFTYYNPIL+RGVEN+M  IK+AGV                           GL+VPDVPLEETE LR EA K+ IELVLLTTPTTPK+RM  IVEASE
Subjt:  SLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASE

Query:  GFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSL
        GFIYLVSSVGVTGTR SV+ +VQ+LL++IK          + T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGVIVGSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FTKSL
Subjt:  GFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSL

Query:  KSAL
        KSAL
Subjt:  KSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic1.1e-7852.19Show/hide
Query:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYN
        +S+T   L  +GK A IPYITAGDPDL+TTAEAL++L  CG+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA  T   A++ ML+ V PELSCP+ L +YY 
Subjt:  LSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYN

Query:  PILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVS
        PI+ R     +  +K+AGV                           GL+VPD+P      L  EA   N+ELVLLTTP  P+DRMK+I +ASEGF+YLVS
Subjt:  PILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVS

Query:  SVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
          GVTG R +V+ RV++L++E+K          +VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADGVI+GSAMV+ LGEA SP++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  SVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic8.7e-11364.94Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAAL-TASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGV
        M IAFKS  +  L    + + F       S    KRF P A+L T+SP +GL++TF +L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL ACGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAAL-TASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLV
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN  +I+ ML +V+P++SCPISLFTYYNPILKRG+  FM +I+  GV+                          GLV
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLV

Query:  VPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKP
        VPDVPLEETE+LRKEA+  +IELVLLTTPTTP +RMK IV+ASEGFIYLVSS+GVTG R+SVSG+VQ+LL++IK          + T+KPVAVGFGISKP
Subjt:  VPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKP

Query:  EHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        EHVKQ+AGWGADGVIVGSAMVKLLG+A+SP EGLKELE  TKSLKSAL
Subjt:  EHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain6.2e-11464.94Show/hide
Query:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAAL-TASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGV
        M IAFKS  +  L    + + F       S    KRF P A+L T+SP +GL++TF +L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL ACGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAAL-TASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLV
        PYSDPLADGPVIQAAATRSL R TN  +I+ ML +V+P++SCPISLFTYYNPILKRG+  FM +I+  GV+                          GLV
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLV

Query:  VPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKP
        VPDVPLEETE+LRKEA+  +IELVLLTTPTTP +RMK IV+ASEGFIYLVSS+GVTG R+SVSG+VQ+LL++IK          + T+KPVAVGFGISKP
Subjt:  VPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKP

Query:  EHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        EHVKQ+AGWGADGVIVGSAMVKLLG+A+SP EGLKELE  TKSLKSAL
Subjt:  EHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein3.4e-11271.38Show/hide
Query:  TASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPI
        T S  VGLSETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL + TNF +IISMLK VIP+LSCPI
Subjt:  TASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPI

Query:  SLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASE
        +LFTYYNPIL+RGVEN+M  IK+AGV                           GL+VPDVPLEETE LR EA K+ IELVLLTTPTTPK+RM  IVEASE
Subjt:  SLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASE

Query:  GFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSL
        GFIYLVSSVGVTGTR SV+ +VQ+LL++IK          + T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGVIVGSAMVK+LGE++SPE+GLKELE FTKSL
Subjt:  GFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKELENFTKSL

Query:  KSAL
        KSAL
Subjt:  KSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGCTTTCAAATCTTCAAGGTTACTTCCCCTCAACAAGATACCCAATACACTCATCTTTTCTCCACGTCCTTGTAAGATTTCAGTCTTCCAATCCAAGCGGTT
TGCTCCAACGGCTGCCCTTACAGCCTCCCCTGGCGTTGGACTGTCCGAAACATTCAACAAATTGAGGGAACAAGGCAAGGTCGCATTGATCCCTTACATCACTGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCGACTACGGCTGAAGCATTAAAGGTGCTTTCCGCCTGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTT
ATACAGGCTGCAGCTACTCGGTCCTTGGCTAGGGACACAAACTTCTATGCGATAATTTCTATGCTGAAGAGGGTGATTCCTGAACTATCTTGTCCAATTTCCCTTTTTAC
ATATTATAACCCAATTCTTAAACGTGGTGTTGAGAACTTCATGATAACAATAAAAGATGCTGGTGTACGAGGTATAGAGTCAGGTTGCAAGTTTGGTGCTGGGGGCTTGG
GCAAGAGGCTACTACTCAAGCCTGTTCCTGCAAACATGGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAATTTTGAGAAAGGAAGCTGTAAAGTACAATATT
GAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCCAAAGATAGGATGAAAGACATCGTTGAAGCTTCAGAAGGATTTATATATCTTGTGAGCTCCGTTGGAGTTACTGGTAC
CCGCACATCAGTGAGTGGCAGAGTTCAAACTCTCCTTGAGGAAATTAAACAGGAATGCTTCCCGATCTGCTTTGCACAACAGGTTACGGAAAAACCAGTAGCAGTTGGTT
TTGGTATATCGAAACCTGAGCATGTGAAACAGGTGGCTGGCTGGGGGGCAGATGGTGTTATTGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAATCCCCTGAG
GAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCACTTTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACATTGCTTTCAAATCTTCAAGGTTACTTCCCCTCAACAAGATACCCAATACACTCATCTTTTCTCCACGTCCTTGTAAGATTTCAGTCTTCCAATCCAAGCGGTT
TGCTCCAACGGCTGCCCTTACAGCCTCCCCTGGCGTTGGACTGTCCGAAACATTCAACAAATTGAGGGAACAAGGCAAGGTCGCATTGATCCCTTACATCACTGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCGACTACGGCTGAAGCATTAAAGGTGCTTTCCGCCTGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTT
ATACAGGCTGCAGCTACTCGGTCCTTGGCTAGGGACACAAACTTCTATGCGATAATTTCTATGCTGAAGAGGGTGATTCCTGAACTATCTTGTCCAATTTCCCTTTTTAC
ATATTATAACCCAATTCTTAAACGTGGTGTTGAGAACTTCATGATAACAATAAAAGATGCTGGTGTACGAGGTATAGAGTCAGGTTGCAAGTTTGGTGCTGGGGGCTTGG
GCAAGAGGCTACTACTCAAGCCTGTTCCTGCAAACATGGGGCTTGTTGTTCCAGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAATTTTGAGAAAGGAAGCTGTAAAGTACAATATT
GAACTGGTACTCTTAACTACACCAACCACGCCCAAAGATAGGATGAAAGACATCGTTGAAGCTTCAGAAGGATTTATATATCTTGTGAGCTCCGTTGGAGTTACTGGTAC
CCGCACATCAGTGAGTGGCAGAGTTCAAACTCTCCTTGAGGAAATTAAACAGGAATGCTTCCCGATCTGCTTTGCACAACAGGTTACGGAAAAACCAGTAGCAGTTGGTT
TTGGTATATCGAAACCTGAGCATGTGAAACAGGTGGCTGGCTGGGGGGCAGATGGTGTTATTGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAATCCCCTGAG
GAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCACTTTCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFKSSRLLPLNKIPNTLIFSPRPCKISVFQSKRFAPTAALTASPGVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSACGSDIIELGVPYSDPLADGPV
IQAAATRSLARDTNFYAIISMLKRVIPELSCPISLFTYYNPILKRGVENFMITIKDAGVRGIESGCKFGAGGLGKRLLLKPVPANMGLVVPDVPLEETEILRKEAVKYNI
ELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFIYLVSSVGVTGTRTSVSGRVQTLLEEIKQECFPICFAQQVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAMVKLLGEAQSPE
EGLKELENFTKSLKSALS