; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg031967 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg031967
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionleucine-rich repeat extensin-like protein 3
Genome locationscaffold11:37372859..37373371
RNA-Seq ExpressionSpg031967
SyntenySpg031967
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6582188.1 hypothetical protein SDJN03_22190, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-6783.43Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        METAISLKFF+SLTAVLL FPA FSS+  A RRT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPPSSG YYY  PPPP+QPTYTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL
        SSPPPP G  G  G+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPG SAAAGRLT+    SVLTV LF FLLAL
Subjt:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL

KGN57146.1 hypothetical protein Csa_010613 [Cucumis sativus]6.2e-6983.43Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        MET I L+F ISLTA+LLLFP+  SS+PV H R+SAGAKYQIECTMCSACDNPC QYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSG Y YYSPPPPAQP+YTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL
        SSPPPP GII  GG+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF+YHTPPPGSSAA  RLT+    SVLTVALF+FLLAL
Subjt:  SSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL

XP_022137790.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Momordica charantia]9.9e-6781.25Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGA---KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPT
        ME    L+F + L AVLL+FPA   S+P   RRTSAGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSG YYYYSPPPPAQPT
Subjt:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGA---KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL
        YTYSSPPPPRGIIGG+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAA  LT+    SV T  LFT LLAL
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL

XP_022955565.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita moschata]2.4e-6884.57Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        METAISLKFFISLTAVLL FPA FSS+P A RRT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPPSSG YYY  PPPP+QPTYTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL
        SSPPPP G  G  G+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPG SAAAGRLT+    SVLTV LF FLLAL
Subjt:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL

XP_038906774.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Benincasa hispida]1.5e-7086.21Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        METAISL+FFISLTAVLLLFPA FSS+PVA RR SAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPP    PPPPVNCPPPPSPPSSG YYYYSPPPP QPTYTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGII-GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL
        SSPPPPRGI  GG+YQPPPY+NYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAA G LT+    SVLTVALF+FLL L
Subjt:  SSPPPPRGII-GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAN7 Nutrient reservoir3.0e-6983.43Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        MET I L+F ISLTA+LLLFP+  SS+PV H R+SAGAKYQIECTMCSACDNPC QYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSG Y YYSPPPPAQP+YTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL
        SSPPPP GII  GG+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF+YHTPPPGSSAA  RLT+    SVLTVALF+FLLAL
Subjt:  SSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL

A0A5A7U5R9 Nutrient reservoir2.4e-6681.82Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYS-PPPPAQPTYT
        ME  ISL+  ISLT +LLL     SS+PV H R+SAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPP+SG Y YYS PPPPAQPTYT
Subjt:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYS-PPPPAQPTYT

Query:  YSSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL
        YSSPPPPRGII  GG+YQPPPY+NYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAA GRLT+    SVLTVALF+FLL L
Subjt:  YSSPPPPRGII--GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL

A0A6J1C7N8 leucine-rich repeat extensin-like protein 34.8e-6781.25Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGA---KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPT
        ME    L+F + L AVLL+FPA   S+P   RRTSAGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSG YYYYSPPPPAQPT
Subjt:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGA---KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL
        YTYSSPPPPRGIIGG+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAA  LT+    SV T  LFT LLAL
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL

A0A6J1GVF6 leucine-rich repeat extensin-like protein 61.1e-6884.57Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        METAISLKFFISLTAVLL FPA FSS+P A RRT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPPSSG YYY  PPPP+QPTYTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL
        SSPPPP G  G  G+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPG SAAAGRLT+    SVLTV LF FLLAL
Subjt:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL

A0A6J1IXZ9 leucine-rich repeat extensin-like protein 64.8e-6783.43Show/hide
Query:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY
        METAISLKFFISLTAVLL F A FSS+P A RRT AGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP ++CPPPPSPPSSG YYY  PPPP+QPTYTY
Subjt:  METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTY

Query:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL
        SSPPPP G  G  G+YQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPG SAAAGRLT+    SVLTV LF FLLAL
Subjt:  SSPPPPRGIIG--GFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTS----SVLTVALFTFLLAL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P06599 Extensin6.6e-0543.14Show/hide
Query:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQ------PTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPP--NPIVPYFPFYYHTPPPGSSA
        Y SPPPP  SPPPP + PPPP       Y+Y SPPPP        P Y Y SPPPP       + PPP  ++ +PPPP  +P  P   + Y +PPP   +
Subjt:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQ------PTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPP--NPIVPYFPFYYHTPPPGSSA

Query:  AA
         A
Subjt:  AA

Q9LUI1 Leucine-rich repeat extensin-like protein 61.2e-0644.86Show/hide
Query:  AKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF
        + Y I+C     C  P     SPPPPPP PPPP   PPPP PP         PPPP  P Y Y SPPPP      +  PPP   Y  PPPP+P     P+
Subjt:  AKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF

Query:  YYHTPPP
         Y  PPP
Subjt:  YYHTPPP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 38.6e-0546.88Show/hide
Query:  PCGQYLSPP----PPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPP
        P   + +PP    PPPPSPPPPV  PPPP PP    Y    PPPP  P   YS PPPP         PPP     +PPPP+P  P  P Y   PPP
Subjt:  PCGQYLSPP----PPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G06750.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein3.0e-2155.04Show/hide
Query:  IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHT
        + CTMCS+CDNPC    +P P   SPP     PPPPS    G  YYYSPPPP+        PP      GG+Y PP Y NY  PPPPNPIVPYFPFYYHT
Subjt:  IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHT

Query:  PPPGSSAAAGRLTSSVLTVALFTFLLALV
        PP G S +A RL +S+L  ALF  LL  V
Subjt:  PPPGSSAAAGRLTSSVLTVALFTFLLALV

AT3G22800.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein8.5e-0844.86Show/hide
Query:  AKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF
        + Y I+C     C  P     SPPPPPP PPPP   PPPP PP         PPPP  P Y Y SPPPP      +  PPP   Y  PPPP+P     P+
Subjt:  AKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF

Query:  YYHTPPP
         Y  PPP
Subjt:  YYHTPPP

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein6.1e-0646.88Show/hide
Query:  PCGQYLSPP----PPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPP
        P   + +PP    PPPPSPPPPV  PPPP PP    Y    PPPP  P   YS PPPP         PPP     +PPPP+P  P  P Y   PPP
Subjt:  PCGQYLSPP----PPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPP

AT4G16140.1 proline-rich family protein5.5e-2353.73Show/hide
Query:  ECTMCSACDNPCGQYLSPPPPP--PSPPPP----VNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYS--NYPAPPPPNPIVPY
        +CTMC++CDNPC    SPPPPP  PSPPPP      CPPPPS    G YYYY   PPA  + +Y   PPP    GG+Y PPP S  NYP  PPPNPIVPY
Subjt:  ECTMCSACDNPCGQYLSPPPPP--PSPPPP----VNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYS--NYPAPPPPNPIVPY

Query:  FPFYYHTPPPGS----SAAAGRLTSSVLTVALFT
        FPFYY+ PPP S    S A  R +  V  + +F+
Subjt:  FPFYYHTPPPGS----SAAAGRLTSSVLTVALFT

AT5G49280.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein2.2e-2758.96Show/hide
Query:  IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPP----VNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYS-NYPAPPPPNPIVPYFP
        + CTMCS+CDNPC    S  PPPPSPPPP      CPPPPSPPSSG    Y  PPP+Q       PPP  G   G+Y PPPYS NYP PPPPNPIVPYFP
Subjt:  IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPP----VNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGFYQPPPYS-NYPAPPPPNPIVPYFP

Query:  FYYHTPPPGSSAAAGRLTSSVLTVALFTFLLALV
        FYYHTPPPGS +     + S++  ALF   L LV
Subjt:  FYYHTPPPGSSAAAGRLTSSVLTVALFTFLLALV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACTGCCATTTCTCTGAAATTTTTCATCTCTCTCACGGCGGTTCTCCTCCTTTTCCCGGCCGCATTTTCGTCCATTCCGGTCGCCCACCGCCGCACCTCCGCCGG
CGCCAAGTACCAAATCGAATGCACAATGTGCTCTGCTTGCGACAATCCCTGCGGCCAGTATCTCTCTCCGCCGCCGCCTCCGCCATCCCCTCCTCCGCCCGTCAACTGCC
CGCCGCCGCCTTCTCCGCCCAGCTCCGGTAACTACTACTACTACTCTCCTCCACCGCCTGCTCAACCCACCTACACATACTCCTCCCCGCCGCCGCCGCGTGGTATCATC
GGCGGATTCTACCAGCCGCCGCCGTACAGTAATTACCCAGCACCGCCGCCGCCGAACCCGATTGTGCCGTATTTCCCGTTTTACTACCACACCCCACCGCCGGGCTCCTC
CGCCGCCGCCGGCCGCCTCACGAGCTCTGTTCTTACCGTTGCTCTGTTTACCTTTTTACTTGCTTTGGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACTGCCATTTCTCTGAAATTTTTCATCTCTCTCACGGCGGTTCTCCTCCTTTTCCCGGCCGCATTTTCGTCCATTCCGGTCGCCCACCGCCGCACCTCCGCCGG
CGCCAAGTACCAAATCGAATGCACAATGTGCTCTGCTTGCGACAATCCCTGCGGCCAGTATCTCTCTCCGCCGCCGCCTCCGCCATCCCCTCCTCCGCCCGTCAACTGCC
CGCCGCCGCCTTCTCCGCCCAGCTCCGGTAACTACTACTACTACTCTCCTCCACCGCCTGCTCAACCCACCTACACATACTCCTCCCCGCCGCCGCCGCGTGGTATCATC
GGCGGATTCTACCAGCCGCCGCCGTACAGTAATTACCCAGCACCGCCGCCGCCGAACCCGATTGTGCCGTATTTCCCGTTTTACTACCACACCCCACCGCCGGGCTCCTC
CGCCGCCGCCGGCCGCCTCACGAGCTCTGTTCTTACCGTTGCTCTGTTTACCTTTTTACTTGCTTTGGTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METAISLKFFISLTAVLLLFPAAFSSIPVAHRRTSAGAKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGNYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGII
GGFYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAGRLTSSVLTVALFTFLLALV