; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg032125 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg032125
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description10 kDa chaperonin, mitochondrial-like
Genome locationscaffold11:36739421..36742236
RNA-Seq ExpressionSpg032125
SyntenySpg032125
Gene Ontology termsGO:0051085 - chaperone cofactor-dependent protein refolding (biological process)
GO:0005759 - mitochondrial matrix (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
GO:0051087 - chaperone binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011032 - GroES-like superfamily
IPR020818 - GroES chaperonin family
IPR037124 - GroES chaperonin superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008455733.1 PREDICTED: 10 kDa chaperonin-like [Cucumis melo]4.5e-3075.79Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK L+PLLN VLI KIVPP KTNSG LLP+KSSKLNS KVI+VGPG RDREGK I +++KEGD +LLPEYGG +VKLGE QFYLF +EDLL TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

XP_022154455.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Momordica charantia]1.8e-3178.95Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK LVPLLN VLI KIVPPAKTN+G LLP+KSSKLNS KV+SVGPGTRDREG  I VT+KEGDT+LLPEYGGT+VKLG+ Q YLF +EDLL TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

XP_022931931.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Cucurbita moschata]2.4e-3178.95Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK LVPLLN VLI KIVPPAKTNSG LLP+KSSKLNS KVISVGPGTRDR+G  I V +KEG+T+LLPEYGGT+VKLGE QFYL+ +EDLL TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

XP_022966634.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Cucurbita maxima]1.4e-3180Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK LVPLLN VLI KIVPPAKTNSG LLP+KSSKLNS KVISVGPGTRDR+G  I V +KEG+T+LLPEYGGT+VKLGE QFYLF +EDLL TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

XP_038881343.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Benincasa hispida]5.7e-3382.11Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK LVPLLN VLI KIVPPAKTNSG LLP+KSSKLNS KVIS+GPG RDREGK I VT+KEGDT+LLPEYGGT+VKLGE QFYLF +EDLL TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KYT6 Uncharacterized protein4.9e-3074.74Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK L+PLLN VLI KIVPP KTNSG LLP+KS+KLNS KVI+VGPG RDREGK I +++KEGD +LLPEYGG +VKLGE QFYLF +EDLL TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

A0A1S3C2U3 10 kDa chaperonin-like2.2e-3075.79Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK L+PLLN VLI KIVPP KTNSG LLP+KSSKLNS KVI+VGPG RDREGK I +++KEGD +LLPEYGG +VKLGE QFYLF +EDLL TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

A0A6J1DJN1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like8.9e-3278.95Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK LVPLLN VLI KIVPPAKTN+G LLP+KSSKLNS KV+SVGPGTRDREG  I VT+KEGDT+LLPEYGGT+VKLG+ Q YLF +EDLL TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

A0A6J1EUZ7 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like1.2e-3178.95Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK LVPLLN VLI KIVPPAKTNSG LLP+KSSKLNS KVISVGPGTRDR+G  I V +KEG+T+LLPEYGGT+VKLGE QFYL+ +EDLL TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

A0A6J1HUD0 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like6.8e-3280Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK LVPLLN VLI KIVPPAKTNSG LLP+KSSKLNS KVISVGPGTRDR+G  I V +KEG+T+LLPEYGGT+VKLGE QFYLF +EDLL TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O59804 10 kDa heat shock protein, mitochondrial4.7e-1442.71Show/hide
Query:  AKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKS-SKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTLR
        AK +VPLL+ +L+ +I    KT SG  LP+KS  KL+  +VISVG G  ++EGK    ++  GD +LLP YGG+ +K+GE ++ L+ + +LL  ++
Subjt:  AKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKS-SKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTLR

P34893 10 kDa chaperonin, mitochondrial1.8e-2964.21Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        M K L+P  N +L+ +++ PAKT SG LLP+KSSKLNS KVI+VGPG+RD++GK I V++KEGDT+LLPEYGGT+VKLGEN+++LF +ED+L TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

P38910 10 kDa heat shock protein, mitochondrial8.9e-1341.94Show/hide
Query:  AKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKS-SKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLG-ENQFYLFHNEDLL
        AK +VPL++ VL+ +I   AKT SG  LP+K+  KLN  +V++VGPG  D  G  +   +K GD +L+P++GG+ +KLG +++  LF + ++L
Subjt:  AKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKS-SKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLG-ENQFYLFHNEDLL

Q96539 10 kDa chaperonin5.7e-2862.11Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        M K L+P  N +L+  ++ PAKT SG LLP+K+SKLNS KVI+VGPG+RD++GK I V++KEGDT+LLPEYGGT+VKLGE +++LF +ED+L TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

Q9W6X3 10 kDa heat shock protein, mitochondrial4.9e-1136.26Show/hide
Query:  KHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKS-SKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLL
        +  +PL + VL+ +++    T  G +LP+KS  K+    V++VGPG+ +++G+   +++K G+ +LLP+YGGTKV L +  ++LF + D+L
Subjt:  KHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKS-SKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14980.1 chaperonin 101.3e-3064.21Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        M K L+P  N +L+ +++ PAKT SG LLP+KSSKLNS KVI+VGPG+RD++GK I V++KEGDT+LLPEYGGT+VKLGEN+++LF +ED+L TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL

AT1G23100.1 GroES-like family protein1.2e-2863.16Show/hide
Query:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL
        MAK L+P LN VL+ KI+PP+KT SG LLP+KSS+LNS +VI+VGPG RDR G  I V++KEGD +LLPE+GGT+VKLGE +F L+ +ED++ TL
Subjt:  MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAAGCATTTGGTTCCTTTGTTGAATTGCGTTTTGATTGGGAAGATTGTGCCCCCTGCCAAAACGAATTCCGGCACTTTGCTTCCTAAGAAGTCTAGTAAGCTGAA
CTCAAAAAAAGTTATCTCTGTTGGTCCTGGGACTCGTGACAGAGAGGGAAAGAGTATTTCTGTTACTATAAAGGAAGGTGACACCATGCTCCTACCAGAATATGGAGGAA
CTAAAGTCAAGCTTGGAGAAAATCAGTTCTATCTATTCCACAATGAAGATCTATTAAGAACGCTACGTTGCTGCTTGGAAAACCATGAAGCTTTTGCGACTTTTGAGACA
AAAAAAGAAAAGGTTTTGGAAAATTCAGAATTAATTGAGTCTTTACCTTGCGCATACAAGATCTTTGCTCATGTATTGTCTGATCAGTTAAAGAGTGTTCTTCCAGTTAC
AATAGCTGAAAATCAGATGGCCTTTGTTGCTAATCAACAAATTATAGATGCTTCTTTGATGGCAAATAAGTTGATTGATGATTGGCATAGCTCTCATAAGCAAGGTGTGG
TTGTCAAGTTGAATCTGGAAAAGGCTTTGCTTTTGATAAGGTTGATTATTTGGGATTTTTTAGATGCAATTGTCAGAGTGAAAGGTTTTGGGGCTTTATGGCGTAAATGG
ATCTTTGGATGTATCTCTAGTGCTAAGTGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAAGCATTTGGTTCCTTTGTTGAATTGCGTTTTGATTGGGAAGATTGTGCCCCCTGCCAAAACGAATTCCGGCACTTTGCTTCCTAAGAAGTCTAGTAAGCTGAA
CTCAAAAAAAGTTATCTCTGTTGGTCCTGGGACTCGTGACAGAGAGGGAAAGAGTATTTCTGTTACTATAAAGGAAGGTGACACCATGCTCCTACCAGAATATGGAGGAA
CTAAAGTCAAGCTTGGAGAAAATCAGTTCTATCTATTCCACAATGAAGATCTATTAAGAACGCTACGTTGCTGCTTGGAAAACCATGAAGCTTTTGCGACTTTTGAGACA
AAAAAAGAAAAGGTTTTGGAAAATTCAGAATTAATTGAGTCTTTACCTTGCGCATACAAGATCTTTGCTCATGTATTGTCTGATCAGTTAAAGAGTGTTCTTCCAGTTAC
AATAGCTGAAAATCAGATGGCCTTTGTTGCTAATCAACAAATTATAGATGCTTCTTTGATGGCAAATAAGTTGATTGATGATTGGCATAGCTCTCATAAGCAAGGTGTGG
TTGTCAAGTTGAATCTGGAAAAGGCTTTGCTTTTGATAAGGTTGATTATTTGGGATTTTTTAGATGCAATTGTCAGAGTGAAAGGTTTTGGGGCTTTATGGCGTAAATGG
ATCTTTGGATGTATCTCTAGTGCTAAGTGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKHLVPLLNCVLIGKIVPPAKTNSGTLLPKKSSKLNSKKVISVGPGTRDREGKSISVTIKEGDTMLLPEYGGTKVKLGENQFYLFHNEDLLRTLRCCLENHEAFATFET
KKEKVLENSELIESLPCAYKIFAHVLSDQLKSVLPVTIAENQMAFVANQQIIDASLMANKLIDDWHSSHKQGVVVKLNLEKALLLIRLIIWDFLDAIVRVKGFGALWRKW
IFGCISSAKC