; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg032605 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg032605
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description50S ribosomal protein L9, chloroplastic
Genome locationscaffold11:5798378..5798955
RNA-Seq ExpressionSpg032605
SyntenySpg032605
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000244 - Ribosomal protein L9
IPR009027 - Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal
IPR020070 - Ribosomal protein L9, N-terminal
IPR036935 - Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004147275.1 50S ribosomal protein L9, chloroplastic [Cucumis sativus]4.1e-3889.47Show/hide
Query:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MAS+TTALSWSSSL+DMGLP+V GN EETAK+SYGRTAMVVVAQKKA KSRKIILKEDV +LGKKGQLIDVK GYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
Subjt:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

XP_008463369.1 PREDICTED: 50S ribosomal protein L9, chloroplastic [Cucumis melo]6.4e-3990.53Show/hide
Query:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MAS+TTALSWSSSLVDMGLP+V GN EETAK+SYGRTAM VVAQKKA KSRKIILKEDVP+LGKKGQLIDVK GYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
Subjt:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

XP_022152873.1 50S ribosomal protein L9, chloroplastic [Momordica charantia]1.1e-3889.47Show/hide
Query:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MASLTTALSWSSS+VDMGLP++GGNFEETAK+SYGR+AMVVVAQKKA KSRKIILKEDV +LGKKGQLIDVK GYYRNYLFP+GKAQIVTPVLLK
Subjt:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

XP_022964816.1 50S ribosomal protein L9, chloroplastic [Cucurbita moschata]2.8e-3485.26Show/hide
Query:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MASLTTALSW SS   +GLP+ G NF+ETAK+S+GRTA+VVVAQKKA KSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVK GYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
Subjt:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

XP_038895317.1 50S ribosomal protein L9, chloroplastic [Benincasa hispida]1.9e-3889.47Show/hide
Query:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MAS+TTALSWSSS+VDMGLP+VGG+ EETAK+SYGRTAMVVVAQKKA KSRKIILKEDVP+LGKKGQLIDVK GY+RNYLFPMGKAQIVTPVLLK
Subjt:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LXN8 50S ribosomal protein L9, chloroplastic2.0e-3889.47Show/hide
Query:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MAS+TTALSWSSSL+DMGLP+V GN EETAK+SYGRTAMVVVAQKKA KSRKIILKEDV +LGKKGQLIDVK GYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
Subjt:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

A0A1S3CKN3 50S ribosomal protein L9, chloroplastic3.1e-3990.53Show/hide
Query:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MAS+TTALSWSSSLVDMGLP+V GN EETAK+SYGRTAM VVAQKKA KSRKIILKEDVP+LGKKGQLIDVK GYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
Subjt:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

A0A5A7U986 50S ribosomal protein L9, chloroplastic3.1e-3990.53Show/hide
Query:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MAS+TTALSWSSSLVDMGLP+V GN EETAK+SYGRTAM VVAQKKA KSRKIILKEDVP+LGKKGQLIDVK GYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
Subjt:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

A0A6J1DG22 50S ribosomal protein L9, chloroplastic5.3e-3989.47Show/hide
Query:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MASLTTALSWSSS+VDMGLP++GGNFEETAK+SYGR+AMVVVAQKKA KSRKIILKEDV +LGKKGQLIDVK GYYRNYLFP+GKAQIVTPVLLK
Subjt:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

A0A6J1I3V2 50S ribosomal protein L9, chloroplastic1.3e-3485.26Show/hide
Query:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MASLTT+LSW SS   +GLP+ G NFEETA +SYGRTA+VVVAQKKA KSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVK GYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
Subjt:  MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P11894 50S ribosomal protein L9, chloroplastic7.9e-1652Show/hide
Query:  SVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        S   N +  +++    +  +V AQKK KK+RKIILKED+  +GKKG+L+DV+ G++RN+LFP GKAQ+VTP +LK
Subjt:  SVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

P25864 50S ribosomal protein L9, chloroplastic2.0e-1958.33Show/hide
Query:  MASLTT-ALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MAS T  +LSWSSS       S  G   ET K S  R    VV+QKKAKK RK+ILKEDV +LGK+GQL+DVK G++RN+L P GKAQ++TP+LLK
Subjt:  MASLTT-ALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

P82180 50S ribosomal protein L9, chloroplastic2.2e-1854.08Show/hide
Query:  MASLTT--ALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYG-RTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MAS T+  +LSWS+S       S  G   E  K     R  + +VAQKK KK RKIILKED+P+LGKKGQL+DV+ G+ RN+L P+GKA++VTP+LLK
Subjt:  MASLTT--ALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYG-RTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

Q6JJ61 50S ribosomal protein L9, chloroplastic1.3e-1858.33Show/hide
Query:  ALSWSSSLVDMGLPSVGGNFE-------ETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        ALSWSSS       S+ GN++        TAK     +   +V QKK KK RKIILKEDV ELGKKGQL++V+ GYYRNYL PMG AQIVTP LLK
Subjt:  ALSWSSSLVDMGLPSVGGNFE-------ETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

Q8L803 50S ribosomal protein L9, chloroplastic2.2e-1043.18Show/hide
Query:  MGLPSVGGNFEET-AKYSYGR-------TAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPEL-GKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        M  PS       T A +SY R        ++V+VAQ + KK R++ILK+D+ E+ GKKG  + V+ G+YRN+L P GKA ++TP +LK
Subjt:  MGLPSVGGNFEET-AKYSYGR-------TAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPEL-GKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G44890.1 ribosomal protein L91.4e-2058.33Show/hide
Query:  MASLTT-ALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK
        MAS T  +LSWSSS       S  G   ET K S  R    VV+QKKAKK RK+ILKEDV +LGK+GQL+DVK G++RN+L P GKAQ++TP+LLK
Subjt:  MASLTT-ALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTCTAACAACCGCTTTGTCATGGAGTTCTTCCCTTGTAGATATGGGTCTGCCCAGTGTAGGTGGAAACTTCGAAGAAACTGCCAAGTACTCTTATGGAAGGAC
TGCCATGGTGGTTGTGGCCCAGAAGAAGGCTAAGAAGTCACGAAAGATAATTCTGAAGGAGGATGTGCCGGAGCTGGGAAAGAAAGGACAGCTTATTGACGTGAAGACTG
GGTATTACAGAAACTATCTGTTCCCCATGGGCAAGGCCCAGATTGTTACTCCAGTTTTGCTCAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCTCTAACAACCGCTTTGTCATGGAGTTCTTCCCTTGTAGATATGGGTCTGCCCAGTGTAGGTGGAAACTTCGAAGAAACTGCCAAGTACTCTTATGGAAGGAC
TGCCATGGTGGTTGTGGCCCAGAAGAAGGCTAAGAAGTCACGAAAGATAATTCTGAAGGAGGATGTGCCGGAGCTGGGAAAGAAAGGACAGCTTATTGACGTGAAGACTG
GGTATTACAGAAACTATCTGTTCCCCATGGGCAAGGCCCAGATTGTTACTCCAGTTTTGCTCAAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASLTTALSWSSSLVDMGLPSVGGNFEETAKYSYGRTAMVVVAQKKAKKSRKIILKEDVPELGKKGQLIDVKTGYYRNYLFPMGKAQIVTPVLLK