; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg033254 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg033254
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionRAB6-interacting golgin
Genome locationscaffold5:3923128..3925497
RNA-Seq ExpressionSpg033254
SyntenySpg033254
Gene Ontology termsGO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domainsIPR007033 - RAB6-interacting golgin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137876.1 GRB10-interacting GYF protein 2 [Cucumis sativus]2.0e-7390.71Show/hide
Query:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL
        MQPEQA QQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRE                ELEAL
Subjt:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL

Query:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_008442808.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486581 [Cucumis melo]4.5e-7390.16Show/hide
Query:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL
        MQPEQA QQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRE                ELEAL
Subjt:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL

Query:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        ADPMRKEVAQVRK+IDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_022144720.1 uncharacterized protein LOC111014340 [Momordica charantia]1.3e-6786.34Show/hide
Query:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL
        MQ EQ   QQQLMVQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQ QLGRVEEETKRLACIRE                ELEAL
Subjt:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL

Query:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYK+AL+AFN+KNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_022945279.1 uncharacterized protein LOC111449572 [Cucurbita moschata]4.2e-7187.98Show/hide
Query:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL
        MQPEQA QQQQL+VQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQ QLGRVEEETKRLACIRE                ELEAL
Subjt:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL

Query:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        ADPMRKEVAQVRK+IDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEAL+AFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_038903091.1 GRB10-interacting GYF protein 2-like [Benincasa hispida]1.7e-7290.16Show/hide
Query:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL
        MQ EQA QQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRE                ELEAL
Subjt:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL

Query:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGI7 RAB6-interacting golgin9.7e-7490.71Show/hide
Query:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL
        MQPEQA QQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRE                ELEAL
Subjt:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL

Query:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A1S3B6L6 RAB6-interacting golgin2.2e-7390.16Show/hide
Query:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL
        MQPEQA QQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRE                ELEAL
Subjt:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL

Query:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        ADPMRKEVAQVRK+IDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A5D3DPH8 RAB6-interacting golgin2.2e-7390.16Show/hide
Query:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL
        MQPEQA QQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRE                ELEAL
Subjt:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL

Query:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        ADPMRKEVAQVRK+IDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A6J1G0J9 RAB6-interacting golgin2.0e-7187.98Show/hide
Query:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL
        MQPEQA QQQQL+VQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQ QLGRVEEETKRLACIRE                ELEAL
Subjt:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL

Query:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        ADPMRKEVAQVRK+IDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEAL+AFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A6J1KYK3 RAB6-interacting golgin2.0e-7187.98Show/hide
Query:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL
        MQPEQA QQQQL+VQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQ QLGRVEEETKRLACIRE                ELEAL
Subjt:  MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEAL

Query:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        ADPMRKEVAQVRK+IDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEAL+AFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  ADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36410.1 Family of unknown function (DUF662)3.8e-5466.3Show/hide
Query:  QPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALA
        QP+  PQQQ   +  +TGSLSFSSH+S+EDEE++RSALS FRAKE+EIE+++MEVRE++QAQLGRVE+ETKRL+ IRE                ELE++A
Subjt:  QPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALA

Query:  DPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLME---LVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        DPMRKEV+ VRKKID+VNKELKPLG T QKKE+EYKEAL+ FN+KN+EKVQLITKLME   LV ESE+LR+ KLEELSK+I+T+
Subjt:  DPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLME---LVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT2G36410.2 Family of unknown function (DUF662)9.0e-5667.4Show/hide
Query:  QPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALA
        QP+  PQQQ   +  +TGSLSFSSH+S+EDEE++RSALS FRAKE+EIE+++MEVRE++QAQLGRVE+ETKRL+ IRE                ELE++A
Subjt:  QPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALA

Query:  DPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        DPMRKEV+ VRKKID+VNKELKPLG T QKKE+EYKEAL+ FN+KN+EKVQLITKLMELV ESE+LR+ KLEELSK+I+T+
Subjt:  DPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT2G36410.3 Family of unknown function (DUF662)1.3e-5466.85Show/hide
Query:  QPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALA
        QP+  PQQQ   +  +TGSLSFSSH+S+EDEE++RSALS FRAKE+EIE+++MEVRE++QAQLGRVE+ETKRL+ IRE                ELE++A
Subjt:  QPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALA

Query:  DPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        DPMRKEV+ VRKKID+VNKELKPLG T QKK  EYKEAL+ FN+KN+EKVQLITKLMELV ESE+LR+ KLEELSK+I+T+
Subjt:  DPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT3G09980.1 Family of unknown function (DUF662)7.4e-5875.76Show/hide
Query:  TGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALADPMRKEVAQVRKKIDA
        +GS+SFSS +SKEDEE+SR+ALS FRAKEEEIE+KKME+RE+VQAQLGRVEEETKRLA IRE                ELE LADPMRKEVA VRKKID+
Subjt:  TGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALADPMRKEVAQVRKKIDA

Query:  VNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        VNKELKPLGHT QKKE+EYKEALEAFN+KN+EKVQLIT+LMELV ESE++R+KKLEELSKNID+I
Subjt:  VNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT3G52920.2 Family of unknown function (DUF662)6.1e-5268.36Show/hide
Query:  QAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALADPM
        Q PQQ          SLSFSS +SKEDEE++RSALS FRAKE+EIE++KMEVRE+V+AQLGRVEEET+RLA IRE                ELE +ADPM
Subjt:  QAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALADPM

Query:  RKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDT
        RKEV  VRKKID+VNKELKPLG T QKKE+EYKEAL+ FN+KN+EKVQLITKLMELV ESE+LRLKKL+ELS++IDT
Subjt:  RKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGCCAGAACAAGCTCCGCAGCAGCAGCAATTAATGGTGCAGAACAACACAGGAAGCTTAAGCTTCAGCAGCCATTTGTCTAAGGAAGATGAAGAGATTTCGAGGTC
AGCTCTCTCCACTTTCAGAGCCAAAGAAGAGGAGATCGAGAGGAAGAAGATGGAGGTCAGAGAGAAGGTTCAAGCACAGTTAGGCCGAGTTGAAGAAGAAACCAAACGCC
TCGCTTGCATCCGTGAGCTGTTCTTGTTGTTTTGGTTCATGAAACGAAATTTCGTTAAACACCAGGAACTCGAAGCGCTTGCAGATCCGATGAGGAAGGAAGTGGCACAG
GTTCGTAAAAAGATCGATGCGGTAAACAAGGAATTAAAGCCTCTGGGACATACCTGTCAAAAGAAGGAAAAAGAGTACAAGGAAGCCCTCGAAGCCTTTAACGACAAGAA
CAAGGAAAAAGTTCAGCTCATCACGAAATTAATGGAGCTGGTGAGTGAAAGTGAGAGGTTGAGGCTGAAGAAGCTGGAGGAGCTGAGTAAGAACATAGATACGATTCGGT
AA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAGCCAGAACAAGCTCCGCAGCAGCAGCAATTAATGGTGCAGAACAACACAGGAAGCTTAAGCTTCAGCAGCCATTTGTCTAAGGAAGATGAAGAGATTTCGAGGTC
AGCTCTCTCCACTTTCAGAGCCAAAGAAGAGGAGATCGAGAGGAAGAAGATGGAGGTCAGAGAGAAGGTTCAAGCACAGTTAGGCCGAGTTGAAGAAGAAACCAAACGCC
TCGCTTGCATCCGTGAGCTGTTCTTGTTGTTTTGGTTCATGAAACGAAATTTCGTTAAACACCAGGAACTCGAAGCGCTTGCAGATCCGATGAGGAAGGAAGTGGCACAG
GTTCGTAAAAAGATCGATGCGGTAAACAAGGAATTAAAGCCTCTGGGACATACCTGTCAAAAGAAGGAAAAAGAGTACAAGGAAGCCCTCGAAGCCTTTAACGACAAGAA
CAAGGAAAAAGTTCAGCTCATCACGAAATTAATGGAGCTGGTGAGTGAAAGTGAGAGGTTGAGGCTGAAGAAGCTGGAGGAGCTGAGTAAGAACATAGATACGATTCGGT
AA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQPEQAPQQQQLMVQNNTGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQAQLGRVEEETKRLACIRELFLLFWFMKRNFVKHQELEALADPMRKEVAQ
VRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEKEYKEALEAFNDKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR