; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg033299 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg033299
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionRibosome production factor 2 homolog
Genome locationscaffold5:3753289..3756064
RNA-Seq ExpressionSpg033299
SyntenySpg033299
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0000463 - maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0032774 - RNA biosynthetic process (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007109 - Brix domain
IPR039770 - Ribosome biogenesis protein Rpf2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580669.1 Ribosome production factor 2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.7e-16995.34Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDH IYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKD AKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+P+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE

KAG7028079.1 Ribosome production factor 2-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.7e-16995.96Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKH KEVLLD+FRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKD AKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+ALP+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE
        RDD PASKKPKEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE

XP_022934916.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita moschata]1.0e-16895.03Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDH IYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKD AKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+P+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE

XP_023005644.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita maxima]7.7e-16996.26Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKD AKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+ALP+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDS
        RDD PASKKPKEDSEKPKEDS
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDS

XP_023540188.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.6e-16996.27Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKD AKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+ALP+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE
        RDD PASKKPKEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAR1 Ribosome production factor 2 homolog3.6e-16492.55Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        ML++RTPKN KVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTE+YHLKKESAVKYSRKN+GIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSII+YGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        +NLVI RTY+ HIYD++EVGIENFKSMHSF YDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD FRGEVVEN+NL+GLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMV+RRHRLP+DGLRKEAMKTAKD AKKKEKNVS+D IQGKIGRIYIPDQKVGDMA+ +KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE
        RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1F357 Ribosome production factor 2 homolog4.8e-16995.03Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDH IYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKD AKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+P+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1FZZ6 Ribosome production factor 2 homolog4.1e-16895.34Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDHHIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKD AKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+ALP+KSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE
        RD+GPASKK KEDSEKPKEDSE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1J655 Ribosome production factor 2 homolog1.1e-16895.34Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDH IYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKD AKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+P+KSKGVKRERREAKMK+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE

A0A6J1KZU6 Ribosome production factor 2 homolog3.7e-16996.26Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKD AKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+ALP+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDS
        RDD PASKKPKEDSEKPKEDS
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEDS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2YDN6 Ribosome production factor 2 homolog8.2e-5743.41Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        +V  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   + Y +KN   +PFE     SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+H+ D+IE+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V NI LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L SD L K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+ K  D
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD

Query:  DGPASKKPKED
        +   SK+ K++
Subjt:  DGPASKKPKED

Q9AWM9 Ribosome production factor 2 homolog2.3e-12370.83Show/hide
Query:  VRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL
        +R P++ + KREL K APKLVETGKKTLILHGTKTS VLN VL +++HLK+++AVKYS+KN+ I+PFESGG+ SLEFFSLKTDCS+IVYGSHSKKRP+NL
Subjt:  VRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL

Query:  VIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA
        V+GRTYDHHIYDL+EVG+EN+KS+ S+ YDKKL+P++GSKPF  FIGE FE+VEELKHLKEVLLDLF+GEVVEN+NLAG+DRV+VCTAISP  V++ HCA
Subjt:  VIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA

Query:  LRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRDD
        LRLK+SG+ +PR+ELVEVGPSMD+VVRRHR P + L+KEAMKTA DHAKK  KNV++D + GK+G++YIPDQ++  M+L N  KG+KRERREAK KN+D 
Subjt:  LRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRDD

Query:  GPASKKPKEDSE
           SKK K + E
Subjt:  GPASKKPKEDSE

Q9H7B2 Ribosome production factor 2 homolog1.8e-5643.73Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        +V  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   V Y +KN   +PFE     SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+H+ D+IE+GIENF S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V NI LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L SD L K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+    D
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD

Query:  DGPASKKPKED
            SK+ K++
Subjt:  DGPASKKPKED

Q9JJ80 Ribosome production factor 2 homolog9.7e-5844.37Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        KV  PK  + KR LEKR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   V Y +KN   +PFE     SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+H+ D+IE+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V N+ LAGL+ V   TA++  KV+    
Subjt:  LVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L SD L K +MK  K    KK KN+SQD      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+    D
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD

Query:  DGPASKKPKED
         G  SK+ K++
Subjt:  DGPASKKPKED

Q9LUG5 Ribosome production factor 2 homolog6.2e-12972.38Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M+++RTPK GK KR LE RAPKLVETGKKTLILHGTKTS  L+ V+TE+Y LKK  A++YSR+NE I+PFESGG+ SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+GR YDH +YDLIEVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKHLKEVL DLFRGEVV+N+NL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCAL+LKKSGS+VPRMELVEVGPSMD+V+RR+RLP+D L KEAM+T+KD  KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ +M L +KSKG KRER++AK+K+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSE
        +++   +KK K  SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23620.1 Ribosomal RNA processing Brix domain protein4.4e-13072.38Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M+++RTPK GK KR LE RAPKLVETGKKTLILHGTKTS  L+ V+TE+Y LKK  A++YSR+NE I+PFESGG+ SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+GR YDH +YDLIEVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKHLKEVL DLFRGEVV+N+NL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCAL+LKKSGS+VPRMELVEVGPSMD+V+RR+RLP+D L KEAM+T+KD  KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ +M L +KSKG KRER++AK+K+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSE
        +++   +KK K  SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAAGTCAGAACTCCCAAGAATGGGAAAGTTAAACGGGAGCTCGAGAAACGCGCTCCCAAACTTGTAGAAACGGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACAAA
AACGAGCGGCGTGTTGAATGAAGTATTGACGGAAATTTATCACCTGAAGAAAGAAAGTGCCGTGAAGTATTCTCGTAAGAATGAAGGAATTAAACCATTTGAAAGTGGCG
GCGATGCGTCTTTGGAATTTTTCTCTCTTAAAACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCAGATAACCTTGTCATAGGGAGAACCTATGAT
CACCACATCTATGACTTAATTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTATCTCCACGTGTGGGGTCAAAGCCTTTCATTAC
TTTCATTGGCGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGAGCTAAAGCATTTAAAGGAAGTTTTGCTTGATTTATTCCGGGGAGAGGTCGTTGAGAATATAAATCTTGCTGGGTTGG
ACCGTGTATATGTATGTACAGCCATCTCACCAAATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCATTGCGATTGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTTCCAAGAATGGAACTAGTTGAA
GTTGGTCCTTCAATGGATATGGTGGTTCGCCGGCACCGACTTCCTAGTGATGGCCTAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGCCAAGGATCATGCTAAGAAGAAGGAGAAAAA
CGTTAGCCAGGATGCAATTCAAGGCAAGATCGGAAGGATATATATTCCTGATCAAAAGGTTGGAGATATGGCTCTACCCAACAAATCAAAGGGAGTGAAGAGAGAACGAC
GTGAAGCGAAAATGAAAAATAGAGATGATGGGCCAGCCTCAAAAAAACCAAAAGAAGATTCAGAAAAACCAAAAGAAGATTCGGAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTGAAAGTCAGAACTCCCAAGAATGGGAAAGTTAAACGGGAGCTCGAGAAACGCGCTCCCAAACTTGTAGAAACGGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACAAA
AACGAGCGGCGTGTTGAATGAAGTATTGACGGAAATTTATCACCTGAAGAAAGAAAGTGCCGTGAAGTATTCTCGTAAGAATGAAGGAATTAAACCATTTGAAAGTGGCG
GCGATGCGTCTTTGGAATTTTTCTCTCTTAAAACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCAGATAACCTTGTCATAGGGAGAACCTATGAT
CACCACATCTATGACTTAATTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTATCTCCACGTGTGGGGTCAAAGCCTTTCATTAC
TTTCATTGGCGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGAGCTAAAGCATTTAAAGGAAGTTTTGCTTGATTTATTCCGGGGAGAGGTCGTTGAGAATATAAATCTTGCTGGGTTGG
ACCGTGTATATGTATGTACAGCCATCTCACCAAATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCATTGCGATTGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTTCCAAGAATGGAACTAGTTGAA
GTTGGTCCTTCAATGGATATGGTGGTTCGCCGGCACCGACTTCCTAGTGATGGCCTAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGCCAAGGATCATGCTAAGAAGAAGGAGAAAAA
CGTTAGCCAGGATGCAATTCAAGGCAAGATCGGAAGGATATATATTCCTGATCAAAAGGTTGGAGATATGGCTCTACCCAACAAATCAAAGGGAGTGAAGAGAGAACGAC
GTGAAGCGAAAATGAAAAATAGAGATGATGGGCCAGCCTCAAAAAAACCAAAAGAAGATTCAGAAAAACCAAAAGAAGATTCGGAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKVRTPKNGKVKRELEKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESAVKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNLVIGRTYD
HHIYDLIEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCALRLKKSGSVVPRMELVE
VGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDHAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRDDGPASKKPKEDSEKPKEDSE