; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg033365 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg033365
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionIsoleucine--tRNA ligase
Genome locationscaffold5:2383680..2386059
RNA-Seq ExpressionSpg033365
SyntenySpg033365
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7017332.1 hypothetical protein SDJN02_19196 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.1e-6284.08Show/hide
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XP_008442626.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486442 [Cucumis melo]3.5e-6284.71Show/hide
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XP_022145494.1 uncharacterized protein LOC111014931 [Momordica charantia]8.4e-6485.53Show/hide
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XP_038906326.1 uncharacterized protein LOC120092168 [Benincasa hispida]2.6e-6589.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAB4 Uncharacterized protein5.8e-6384.71Show/hide
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A0A1S3B6W3 uncharacterized protein LOC1034864421.7e-6284.71Show/hide
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A0A6J1CVE7 uncharacterized protein LOC1110149314.0e-6485.53Show/hide
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A0A6J1F162 uncharacterized protein LOC111441439 isoform X16.5e-6283.44Show/hide
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A0A6J1J3V4 uncharacterized protein LOC1114824281.7e-6282.8Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53470.1 unknown protein9.6e-3460Show/hide
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        SSSS F CS   P         PRK +E++             DK STDWDKAW  F+K+ KK++FS F+ DKYV+WNP RS++ LSEEVDPIKRTERSN
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AT3G53470.2 unknown protein1.3e-3360Show/hide
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        SSSS F CS   P         PRK +E++             DK STDWDKAW  F+K+ KK++FS F+ DKYV+WNP RS++ LSEEVDPIKRTERSN
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTCGAGAAACAAACAAAAATCATCTTCGTCCTCATCGTCTTCTTCTTCTGCGTTCAACTGCTCGCCGGTGATTCCTCTGTGCTCGGGGAGAAGGCCTAAAGATCCACGAA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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