; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg034304 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg034304
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionATP citrate synthase
Genome locationscaffold2:50005907..50010898
RNA-Seq ExpressionSpg034304
SyntenySpg034304
Gene Ontology termsGO:0000166 - nucleotide binding (molecular function)
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InterPro domainsIPR013650 - ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type
IPR016102 - Succinyl-CoA synthetase-like
IPR032263 - ATP-citrate synthase, citrate-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050962.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]5.4e-23998.11Show/hide
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O22718 ATP-citrate synthase alpha chain protein 21.8e-20581.09Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+NQ TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTITLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFTVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVS+RLGC+ISFSECGGI+IEENWDKVKTIT+PT    T E CAPL+ATLPLEI+G++ DFI  +FT+F+DLDF+FLEMN
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        PFTLV+G+PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFP+PFGRV++ TESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMR+LG+E+GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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O80526 ATP-citrate synthase alpha chain protein 37.4e-22390Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDF ELTN E WLSSTKLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVK RLG +VEM GCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTI LP EK  TLE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG F VFQDLDFSF+EMN
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        PFTLV+GEP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG+IEFPLPFGRVL+ TE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIM
        V+GPEATMTGICK+AI+CIM
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Q2QNG7 ATP-citrate synthase alpha chain protein 35.6e-22389.6Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLL+EHLKRLA IDL I SAQV +STDF EL N EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQV +FVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKT+ LPTEK  T +ACAPLIATLPLE+R KIGDFI GV++VFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNI+FPLPFGRVL+P+ESF+H LDEKTS+SLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATF+GIIRALREKESKLKAARM+IYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICKQAI+CIM+ A
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Q2QZ86 ATP-citrate synthase alpha chain protein 21.9e-22691.25Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDF EL N +PWLS+ KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKTI LPTEKP T +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVF VFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVL+ TE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
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Q53JY8 ATP-citrate synthase subunit alpha chain protein 12.3e-20885.85Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDF EL N +PWLS+ KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK RLGV+VEMGGCKA
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTITLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFTVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKTI L TEKP T +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVF VFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFK  + KWGNIEFPLPFGRVL+ TE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGG                 EL 
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Query:  NYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPL
        NYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+
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Query:  EVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        EV+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09430.1 ATP-citrate lyase A-35.2e-22490Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDF ELTN E WLSSTKLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVK RLG +VEM GCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTI LP EK  TLE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG F VFQDLDFSF+EMN
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        PFTLV+GEP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG+IEFPLPFGRVL+ TE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE
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        V+GPEATMTGICK+AI+CIM
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AT1G10670.1 ATP-citrate lyase A-18.4e-20681.32Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTI LPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +FT+FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G10670.2 ATP-citrate lyase A-18.4e-20681.32Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTITLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFTVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTI LPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +FT+FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G10670.4 ATP-citrate lyase A-18.4e-20681.32Show/hide
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTITLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFTVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTI LPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +FT+FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G60810.1 ATP-citrate lyase A-21.3e-20681.09Show/hide
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTITLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFTVFQDLDFSFLEMN
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        PFTLV+G+PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFP+PFGRV++ TESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMR+LG+E+GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTAGGAAGAAGATTAGAGAGTATGACTCTAAGAGGCTTCTGAAGGAGCATCTCAAACGCCTCGCTAATATCGACCTCCAGATCTGCTCCGCCCAGGTAAATCAATC
GACCGACTTTGCTGAGCTGACAAATAATGAACCATGGCTGTCATCCACCAAGTTAGTAGTGAAACCAGACATGTTATTTGGGAAACGTGGAAAGAGTGGCTTGGTAGCTT
TGAATTTGGATCTAGCTCAAGTTGCTGAGTTTGTGAAGACACGCCTTGGTGTGCAGGTTGAGATGGGTGGTTGCAAGGCTCCAATTACAACATTCATCGTTGAGCCATTT
GTTCCCCATGATCAAGAGTATTACCTATCTATTGTCTCTGAAAGGCTTGGCTGCACAATAAGTTTTTCAGAGTGTGGGGGTATCGAAATTGAAGAGAACTGGGATAAAGT
CAAAACTATTACCCTTCCAACTGAAAAACCTTTTACACTTGAGGCATGCGCTCCTTTAATAGCTACACTTCCTTTGGAGATTCGAGGAAAGATTGGTGACTTCATAATGG
GTGTATTTACTGTATTTCAAGATCTGGACTTCAGTTTCTTGGAGATGAATCCATTTACCCTGGTCAATGGGGAGCCGTATCCACTGGATATGAGGGGGGAATTGGATGAC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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