; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg034331 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg034331
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionHydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]
Genome locationscaffold12:21155910..21156452
RNA-Seq ExpressionSpg034331
SyntenySpg034331
Gene Ontology termsGO:0006782 - protoporphyrinogen IX biosynthetic process (biological process)
GO:0004852 - uroporphyrinogen-III synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR036108 - Tetrapyrrole biosynthesis, uroporphyrinogen III synthase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587847.1 hypothetical protein SDJN03_16412, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-1869.44Show/hide
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TYK03635.1 Tetrapyrrole biosynthesis, uroporphyrinogen III synthase [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-1869.44Show/hide
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XP_008444040.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487492 [Cucumis melo]5.2e-1970.83Show/hide
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XP_022926996.1 uncharacterized protein LOC111433956 [Cucurbita moschata]1.5e-1869.44Show/hide
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XP_023530963.1 uncharacterized protein LOC111793350 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-1869.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZ08 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]1.3e-1868.06Show/hide
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A0A1S3BA78 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]2.5e-1970.83Show/hide
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A0A5A7U8V3 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]2.5e-1970.83Show/hide
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        +CARKLVER +D KLDAIVFTST E+EGL+KSL  LGLEW+MM+KRW E VVA HG +T  GAE L +KVDL
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A0A5D3BX13 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]7.4e-1969.44Show/hide
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A0A6J1EGG3 Hydroxymethylbilane hydrolyase [cyclizing]7.4e-1969.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCCGGACAAGGGAGTGTGCGAGGAAGCTTGTGGAGAGAAGGGAGGATGGAAAATTGGATGCCATTGTGTTTACAAGTACTCGGGAACTGGAGGGGCTGGTTAAAAG
CTTGAGTGATTTGGGATTAGAGTGGGAGATGATGAGAAAGAGATGGTCGGAAACGGTGGTGGCCACGCATGGGTTGATAACGGTGGTGGGAGCAGAGAGTCTCAGAATCA
AGGTTGACTTGTGCATGAACATTCTTAAATATGCCATTGTGTTTACAAGTACTCGGGAACTGGAGGGGCTGGTTAAAAGCTTGAGTGATTTGGGATTAGAGTGGGAGATG
ATGAGAAAGAGATGGTCGGAAACGGTGGTGGCCACGCATGGGTTGATAACGGTGGTGGGAGCAGAGAGTCTCAGAATCAAGGTTGACTTGGTGAGTTCTCTAAATTTGAT
AGTTTCAATGGTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGCCGGACAAGGGAGTGTGCGAGGAAGCTTGTGGAGAGAAGGGAGGATGGAAAATTGGATGCCATTGTGTTTACAAGTACTCGGGAACTGGAGGGGCTGGTTAAAAG
CTTGAGTGATTTGGGATTAGAGTGGGAGATGATGAGAAAGAGATGGTCGGAAACGGTGGTGGCCACGCATGGGTTGATAACGGTGGTGGGAGCAGAGAGTCTCAGAATCA
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ATGAGAAAGAGATGGTCGGAAACGGTGGTGGCCACGCATGGGTTGATAACGGTGGTGGGAGCAGAGAGTCTCAGAATCAAGGTTGACTTGGTGAGTTCTCTAAATTTGAT
AGTTTCAATGGTGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRTRECARKLVERREDGKLDAIVFTSTRELEGLVKSLSDLGLEWEMMRKRWSETVVATHGLITVVGAESLRIKVDLCMNILKYAIVFTSTRELEGLVKSLSDLGLEWEM
MRKRWSETVVATHGLITVVGAESLRIKVDLVSSLNLIVSMV