; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg035626 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg035626
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptioncytochrome b5
Genome locationscaffold3:1833861..1836573
RNA-Seq ExpressionSpg035626
SyntenySpg035626
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0035672 - oligopeptide transmembrane transport (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0043231 - intracellular membrane-bounded organelle (cellular component)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
GO:0035673 - oligopeptide transmembrane transporter activity (molecular function)
GO:0042973 - glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001199 - Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
IPR018506 - Cytochrome b5, heme-binding site
IPR036400 - Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042530.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-5095.24Show/hide
Query:  VYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQFLVPILILGLAFAVRH
        VYDVTPFM+DHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKY+IGEIDPSTVPLKKI+IPSQQTQ+NPDKTPEFVIKILQFLVP+LILGLAFAVRH
Subjt:  VYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQFLVPILILGLAFAVRH

Query:  YTKNE
        YTKNE
Subjt:  YTKNE

XP_008437642.1 PREDICTED: cytochrome b5 [Cucumis melo]5.6e-5186.67Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFM+DHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKY+IGEIDPSTVPLKKI+IPSQQTQ+NPDKTPEFVIKILQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVP+LILGLAFAVRHYTKNE
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE

XP_011654591.1 cytochrome b5 [Cucumis sativus]3.3e-5187.5Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFM+DHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKY+IGEIDPSTVPLKKIFIPSQQ+Q+NPDKTPEFVIKILQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVPILILGLAFAVRHYTKNE
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE

XP_022922141.1 cytochrome b5-like isoform X2 [Cucurbita moschata]4.0e-4984.17Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFM+DHPGGDEVLL+ATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKY+IGEIDPSTVPL+KI+IPSQQTQYNPDKT EFVIKILQ 
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVPI ILGLAFAVRHYTKNE
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE

XP_038875650.1 cytochrome b5 [Benincasa hispida]2.8e-5085.83Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFM+DHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSD+AREMMDKY+IGEIDPSTVP KKI+IPSQQTQ+NPDKTPEFVIKILQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVPILILGLAFAVRHYTKNE
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KN46 Cytochrome b5 heme-binding domain-containing protein1.6e-5187.5Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFM+DHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKY+IGEIDPSTVPLKKIFIPSQQ+Q+NPDKTPEFVIKILQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVPILILGLAFAVRHYTKNE
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE

A0A1S3AU68 cytochrome b52.7e-5186.67Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFM+DHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKY+IGEIDPSTVPLKKI+IPSQQTQ+NPDKTPEFVIKILQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVP+LILGLAFAVRHYTKNE
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE

A0A5A7TGS6 (1->3)-beta-glucan endohydrolase6.0e-5195.24Show/hide
Query:  VYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQFLVPILILGLAFAVRH
        VYDVTPFM+DHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKY+IGEIDPSTVPLKKI+IPSQQTQ+NPDKTPEFVIKILQFLVP+LILGLAFAVRH
Subjt:  VYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQFLVPILILGLAFAVRH

Query:  YTKNE
        YTKNE
Subjt:  YTKNE

A0A6J1CBE4 cytochrome b54.3e-4983.33Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFM+DHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKY+IGEIDPSTVPLK+++IP+QQTQYN DKTPEFVIKILQ 
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVPI ILGLAFAVRHYTKNE
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE

A0A6J1E3B3 cytochrome b5-like isoform X21.9e-4984.17Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFM+DHPGGDEVLL+ATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKY+IGEIDPSTVPL+KI+IPSQQTQYNPDKT EFVIKILQ 
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVPI ILGLAFAVRHYTKNE
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O48845 Cytochrome b5 isoform B2.1e-3761.34Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  +GK        VY+VT F++DHPGGD+VLLS+TGKDAT+DFEDVGHS+SAREMM++Y++GEIDP+T+P K  + P +Q  YN DKT EF+IK+LQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKN
        LVP+ ILGLA  +R YTK+
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKN

P40934 Cytochrome b51.0e-4271.67Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFMDDHPGGDEVLLS+TGKDATNDFEDVGHSD+AR+MM+KY+IGEID STVP  + ++   Q  YN DKTPEF+IKILQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVPILILGLA  VR YTK E
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE

P49098 Cytochrome b53.3e-3863.56Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVT F+DDHPGGDEVLLSATGKDAT+DFEDVGHS SAR M+D+Y++G+ID +T+P K  + P  Q  YN DKT EFV+K+LQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTK
        LVP++ILG+AF +R YTK
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTK

P49100 Cytochrome b51.6e-3766.67Show/hide
Query:  VYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQFLVPILILGLAFAVRH
        VY+V+ F++DHPGGD+VLLS+TGKDAT+DFEDVGHS +AR MMD+Y++G+ID ST+P +  ++P +Q  YN DKTPEF+IKILQFLVP+ ILGLA A+R 
Subjt:  VYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQFLVPILILGLAFAVRH

Query:  YTKNE
        YTK+E
Subjt:  YTKNE

Q42342 Cytochrome b5 isoform E1.1e-4473.33Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFMDDHPGGDEVLLS+TGKDATNDFEDVGHSD+AR+MMDKYFIGEID S+VP  + ++  QQ  YN DKTPEF+IKILQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVPILILGLA  VRHYTK +
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26340.1 cytochrome B5 isoform A2.4e-2045.76Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQ-
        WV   GK        VYDV+ +MD+HPGGD+VLL+  GKDAT+DFED GHS  ARE+M+KYFIGE+D S++P     IP  +  Y  D+  + V K+   
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQ-

Query:  ----FLVPILILGLAFAV
            ++VP+ I+ ++ AV
Subjt:  ----FLVPILILGLAFAV

AT2G32720.1 cytochrome B5 isoform B1.5e-3861.34Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  +GK        VY+VT F++DHPGGD+VLLS+TGKDAT+DFEDVGHS+SAREMM++Y++GEIDP+T+P K  + P +Q  YN DKT EF+IK+LQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKN
        LVP+ ILGLA  +R YTK+
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKN

AT2G46650.1 cytochrome B5 isoform C3.3e-2553.4Show/hide
Query:  VYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKT--PEFVIKILQFLVPILILGLAFAV
        VYD++ FMD+HPGGD VLL+ TGKDA+ DFEDV HS  A+E+M KY IG++D STVP+ + +IP  + +    +T   E   K+L +L+P+LILG+AFA+
Subjt:  VYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKT--PEFVIKILQFLVPILILGLAFAV

Query:  RHY
        R Y
Subjt:  RHY

AT5G48810.1 cytochrome B5 isoform D3.2e-3659.5Show/hide
Query:  NQSGKDIEYVI-LMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQ--YNPDKTPEFVIKILQ
        + S KD   VI   VYDVT F+DDHPGGDEV+L++TGKDAT+DFEDVGHS +A+ M+D+Y++G+ID +TVP+K  F+P   T+     DK+ +FVIK+LQ
Subjt:  NQSGKDIEYVI-LMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQ--YNPDKTPEFVIKILQ

Query:  FLVPILILGLAFAVRHYTKNE
        FLVP+LILGLAF +R+YTK +
Subjt:  FLVPILILGLAFAVRHYTKNE

AT5G53560.1 cytochrome B5 isoform E7.6e-4673.33Show/hide
Query:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF
        W+  SGK        VYDVTPFMDDHPGGDEVLLS+TGKDATNDFEDVGHSD+AR+MMDKYFIGEID S+VP  + ++  QQ  YN DKTPEF+IKILQF
Subjt:  WVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQF

Query:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE
        LVPILILGLA  VRHYTK +
Subjt:  LVPILILGLAFAVRHYTKNE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTGTGAAGACATGGGTCAACCAGAGTGGTAAAGATATTGAATATGTTATACTCATGGTTTATGATGTAACTCCTTTCATGGACGATCATCCTGGAGGTGATGAAGT
ACTATTGTCTGCAACTGGGAAAGATGCCACGAACGATTTCGAAGATGTTGGGCACAGCGATTCGGCAAGAGAAATGATGGACAAGTATTTCATCGGAGAAATTGATCCTT
CGACGGTTCCTTTGAAGAAGATTTTCATTCCATCACAACAAACCCAGTACAACCCAGATAAGACACCTGAGTTTGTGATTAAGATCTTGCAGTTTCTGGTTCCCATATTG
ATTTTGGGTTTGGCATTTGCTGTTCGACACTACACCAAGAATGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTTGTGAAGACATGGGTCAACCAGAGTGGTAAAGATATTGAATATGTTATACTCATGGTTTATGATGTAACTCCTTTCATGGACGATCATCCTGGAGGTGATGAAGT
ACTATTGTCTGCAACTGGGAAAGATGCCACGAACGATTTCGAAGATGTTGGGCACAGCGATTCGGCAAGAGAAATGATGGACAAGTATTTCATCGGAGAAATTGATCCTT
CGACGGTTCCTTTGAAGAAGATTTTCATTCCATCACAACAAACCCAGTACAACCCAGATAAGACACCTGAGTTTGTGATTAAGATCTTGCAGTTTCTGGTTCCCATATTG
ATTTTGGGTTTGGCATTTGCTGTTCGACACTACACCAAGAATGAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVVKTWVNQSGKDIEYVILMVYDVTPFMDDHPGGDEVLLSATGKDATNDFEDVGHSDSAREMMDKYFIGEIDPSTVPLKKIFIPSQQTQYNPDKTPEFVIKILQFLVPIL
ILGLAFAVRHYTKNE