; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg035857 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg035857
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationscaffold5:40082418..40084588
RNA-Seq ExpressionSpg035857
SyntenySpg035857
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008444193.1 PREDICTED: chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucumis melo]7.4e-14797.36Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL GN RV+MRKSA+K VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_022139935.1 chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic-like [Momordica charantia]1.1e-14794.58Show/hide
Query:  VCSSDSKTIFSLAMAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSAD
        +C+ ++K+I  L MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRK  SK VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSAD
Subjt:  VCSSDSKTIFSLAMAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSAD

Query:  PETFAKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDP
        PETFAKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+EGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDP
Subjt:  PETFAKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDP

Query:  IYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG
        IYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG
Subjt:  IYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG

XP_022142169.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Momordica charantia]3.3e-14797.74Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRK  SK VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+EGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_038877609.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Benincasa hispida]3.3e-14798.12Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGN-GRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGN GRVSMRKSASK +SSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGN-GRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGL
        IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_038882052.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Benincasa hispida]2.8e-14696.6Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKL+P++PE+ GNGRVSMRK+ASK VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BAK6 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic3.6e-14797.36Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL GN RV+MRKSA+K VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A5D3DAQ5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic3.6e-14797.36Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL GN RV+MRKSA+K VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1CDN4 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic5.5e-14894.58Show/hide
Query:  VCSSDSKTIFSLAMAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSAD
        +C+ ++K+I  L MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRK  SK VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSAD
Subjt:  VCSSDSKTIFSLAMAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSAD

Query:  PETFAKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDP
        PETFAKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+EGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDP
Subjt:  PETFAKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDP

Query:  IYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG
        IYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG
Subjt:  IYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG

A0A6J1CKT5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.6e-14797.74Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRK  SK VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+EGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6M3WGX2 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic3.0e-14695.47Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKL+PS+PEL+GNGRVSMRK+ASK VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA
        H RWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07369 Chlorophyll a-b binding protein 3C, chloroplastic4.8e-14190.64Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSA--SKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MA STMALSS + AGKAVKL+PSS E+ GNGRV+MRK+A  +KP SSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+ PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSA--SKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLG
        VIH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+ DP+YPGGSFDPLG
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LADDPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P08221 Chlorophyll a-b binding protein of LHCII type I, chloroplastic (Fragment)2.8e-14193.33Show/hide
Query:  PSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGAL
        P+LAG+AVKL+P++PE+ GN + +MRK+ASK VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGAL
Subjt:  PSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGAL

Query:  GCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAELK
        GCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAELK
Subjt:  GCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAELK

Query:  VKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        VKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  VKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic3.9e-14393.94Show/hide
Query:  AASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH
        AAS+MALSSPSLAGKAVKL PS+PE+   GRVSMRK+ +K VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH
Subjt:  AASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH

Query:  SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLAD
        SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYRIAGGPLGE+TDPIYPGGSFDPLGLAD
Subjt:  SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLAD

Query:  DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLA PVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P27493 Chlorophyll a-b binding protein 21, chloroplastic3.9e-14390.57Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAA+TMALSSPS AG+AVKL+PS+PE+ GNGRVSMRK+ +KPV+S SPWYGPDRVKYLGPFSG+ PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA
        H RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AGGPLGE+ DP+YPGGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        +DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P27495 Chlorophyll a-b binding protein 40, chloroplastic3.3e-14291.39Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSAS--KPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MAASTMALSSPS AGKAVKL+PSS E+ GNG+V+MRK+AS  K VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSG+ PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSAS--KPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLG
        VIH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYR+AGGPLGE+ DP+YPGGSFDPLG
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA+DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29910.1 chlorophyll A/B binding protein 33.7e-13687.27Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSP+ AGKAV L+P++ E+LG+GRV+MRK+ +KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSG+ PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEITDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEITDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT1G29920.1 chlorophyll A/B-binding protein 23.7e-13687.27Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSP+ AGKAV L+P++ E+LG+GRV+MRK+ +KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSG+ PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEITDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEITDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 19.6e-13787.64Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSP+ AGKAVKL+P++ E+LG+GRV+MRK+ +KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSG+ PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEITDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEITDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B24.0e-13587.27Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MA+STMALSSP+ AGKAVK  P++ ++LG+GRV+MRK+ +KP   SGSPWYG DRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEITDPIYPGGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEITDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B19.6e-13787.22Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSP+L GKAVKL+P++ E+ G GR++MRK++     SGSPWYG DRVKYLGPFSG+PPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEITDPIYPGGSFDPLGL
        HSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLGL
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEITDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        A DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACTCCAGAGGCGAAACCGGCAAATGGGACGGGTCAAGACTGAAGGGGTCGGGCACTTTGTTCGACCCCCCTGCTCGGCCTCGGCCTTGGGCCGAGGCCGAGGCCCA
TGGTCGGCCTAGGCTCGCTTGCGCGGGCCGAGTCCCACCAACTCCGCTCGGTCCCTACAGCCTCCAGCCGCCCCGGTTCCGCCTGGGGACCCGAACTCTCTCTTCTCTAC
TCCATACTCTTGCTCTCCAGCCATTCCTTCCGTTTTCTGACTTAAGCATCGGAGGCGGTGTGGCTAGCACCACACCGGTGTGCAGCTCCGACAGTAAAACCATATTCTCG
CTTGCAATGGCGGCCTCAACAATGGCTCTCTCCTCTCCGTCACTCGCCGGAAAGGCAGTGAAACTCACGCCCTCCTCCCCCGAGCTTCTCGGCAACGGCAGAGTCAGCAT
GAGGAAATCCGCCTCCAAGCCCGTTTCTTCTGGAAGCCCCTGGTACGGACCCGACCGTGTCAAGTACTTGGGCCCATTCTCCGGCCAGCCTCCCTCCTACCTCACCGGAG
AGTTCCCCGGCGACTACGGCTGGGATACCGCCGGACTGTCCGCAGACCCCGAGACCTTCGCCAAGAACCGTGAGCTGGAAGTCATCCACTCGAGGTGGGCCATGCTGGGA
GCCCTTGGGTGCGTCTTCCCGGAGCTTCTGTCCCGCAACGGCGTGAAGTTCGGAGAAGCGGTGTGGTTCAAGGCCGGTTCCCAGATCTTCAGCGAAGGTGGGCTCGACTA
CTTGGGGAACCCGAGCTTGATCCACGCCCAGAGCATTCTCGCCATCTGGGCCTCACAGGTGGTTCTGATGGGGGCCGTCGAGGGATACCGCATCGCCGGAGGCCCACTAG
GCGAGATAACAGACCCGATTTACCCGGGTGGGAGCTTCGACCCGTTGGGGCTTGCAGATGACCCGGAAGCTTTTGCGGAGCTGAAGGTGAAGGAGCTGAAGAATGGGAGG
TTGGCCATGTTCTCCATGTTTGGATTCTTCGTTCAGGCCATCGTCACTGGAAAGGGCCCACTGGAGAATCTCGCTGACCACCTTGCTGACCCAGTCAACAATAATGCCTG
GGCTTATGCCACCAACTTTGTTCCTGGAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACTCCAGAGGCGAAACCGGCAAATGGGACGGGTCAAGACTGAAGGGGTCGGGCACTTTGTTCGACCCCCCTGCTCGGCCTCGGCCTTGGGCCGAGGCCGAGGCCCA
TGGTCGGCCTAGGCTCGCTTGCGCGGGCCGAGTCCCACCAACTCCGCTCGGTCCCTACAGCCTCCAGCCGCCCCGGTTCCGCCTGGGGACCCGAACTCTCTCTTCTCTAC
TCCATACTCTTGCTCTCCAGCCATTCCTTCCGTTTTCTGACTTAAGCATCGGAGGCGGTGTGGCTAGCACCACACCGGTGTGCAGCTCCGACAGTAAAACCATATTCTCG
CTTGCAATGGCGGCCTCAACAATGGCTCTCTCCTCTCCGTCACTCGCCGGAAAGGCAGTGAAACTCACGCCCTCCTCCCCCGAGCTTCTCGGCAACGGCAGAGTCAGCAT
GAGGAAATCCGCCTCCAAGCCCGTTTCTTCTGGAAGCCCCTGGTACGGACCCGACCGTGTCAAGTACTTGGGCCCATTCTCCGGCCAGCCTCCCTCCTACCTCACCGGAG
AGTTCCCCGGCGACTACGGCTGGGATACCGCCGGACTGTCCGCAGACCCCGAGACCTTCGCCAAGAACCGTGAGCTGGAAGTCATCCACTCGAGGTGGGCCATGCTGGGA
GCCCTTGGGTGCGTCTTCCCGGAGCTTCTGTCCCGCAACGGCGTGAAGTTCGGAGAAGCGGTGTGGTTCAAGGCCGGTTCCCAGATCTTCAGCGAAGGTGGGCTCGACTA
CTTGGGGAACCCGAGCTTGATCCACGCCCAGAGCATTCTCGCCATCTGGGCCTCACAGGTGGTTCTGATGGGGGCCGTCGAGGGATACCGCATCGCCGGAGGCCCACTAG
GCGAGATAACAGACCCGATTTACCCGGGTGGGAGCTTCGACCCGTTGGGGCTTGCAGATGACCCGGAAGCTTTTGCGGAGCTGAAGGTGAAGGAGCTGAAGAATGGGAGG
TTGGCCATGTTCTCCATGTTTGGATTCTTCGTTCAGGCCATCGTCACTGGAAAGGGCCCACTGGAGAATCTCGCTGACCACCTTGCTGACCCAGTCAACAATAATGCCTG
GGCTTATGCCACCAACTTTGTTCCTGGAAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDSRGETGKWDGSRLKGSGTLFDPPARPRPWAEAEAHGRPRLACAGRVPPTPLGPYSLQPPRFRLGTRTLSSLLHTLALQPFLPFSDLSIGGGVASTTPVCSSDSKTIFS
LAMAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKPVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGQPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLG
ALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEITDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGR
LAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK