; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg036170 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg036170
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionAWPM-19-like family protein
Genome locationscaffold5:40520054..40521655
RNA-Seq ExpressionSpg036170
SyntenySpg036170
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008390 - AWPM-19-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008443837.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487332 [Cucumis melo]2.3e-7393.08Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA +QMKSIATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESLGAA
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYIMAIHG +STR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_022140126.1 uncharacterized protein LOC111010860 [Momordica charantia]2.1e-7191.82Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA++QMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEI LDFR+TRLITMEAFFIILS TQL+YIMAIHGA S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_023001482.1 uncharacterized protein LOC111495604 [Cucurbita maxima]3.6e-7194.16Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAVSTR
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_023519488.1 membrane protein PM19L-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-7093.51Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK IATLLLLLNFCM+AVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAAS+ISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
         AW+LTILAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAVSTR
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

XP_038895378.1 membrane protein PM19L-like [Benincasa hispida]1.3e-7393.71Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA +QMKS+ATLLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        S+AAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYI+AIHGAVSTR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV01 AWPM19-like protein2.5e-7090.57Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA +QMKS ATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESL AA
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLTILAMGFA KEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYIMAIHG +STR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A0A6J1CEV9 uncharacterized protein LOC1110108601.0e-7191.82Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA++QMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEI LDFR+TRLITMEAFFIILS TQL+YIMAIHGA S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A0A6J1K0L0 uncharacterized protein LOC1114904951.3e-6989.31Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA+SQMK IATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGL+LPAHFSPIYFP+GNAATGFFV FALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAES GAA
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLT+LAMGFA KEI LD RN+RL+TMEAFF+ILSATQLVYIMAIHGAV+TR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A0A6J1KGN7 uncharacterized protein LOC1114956041.8e-7194.16Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGF+IGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        FAW+LTILAMGFACKEIALD+RNTRLITMEAFFIILSATQL+YI AIHGAVSTR
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

A5Y734 AWPM19-like protein1.1e-7393.08Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA +QMKSIATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA VFGAASAISGLNHIRSWS ESLGAA
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRN RL+TMEAFFIILSATQLVYIMAIHG +STR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6L4D2 Membrane protein PM19L4.2e-2243.45Show/hide
Query:  LLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWTLTI
        LL+LN  MY +++G   W +N  I +G    PG+             GN AT +F+ FA+LA V GAAS ++G++H+RSW A SL A +++A+ AW +T 
Subjt:  LLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWTLTI

Query:  LAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV
        LA G ACKEI +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+  +HG +
Subjt:  LAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein7.2e-2544.1Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA +  ++IA  LL LN  MY ++LG   W +N  I+       G      F       GN AT FF+TF++LAAV G AS ++G NHIR W  +SL AA
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIH-GAVSTR
         ++++ AW +T LAMG ACK+I +  +R  RL  +EAF IIL+ TQL+Y+M IH G++S++
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIAL-DFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIH-GAVSTR

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein1.2e-5672.73Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA  Q+K +A+ LL+LNFCMY ++LGIGGWAMN AIDHGF +GP L LPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA V GAAS ISGL+HIRSW+  SL AA
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG
        ++AA  AWTLT+LAMGFA KEI L  RN +L TMEAF IILS TQL+YI A+HG
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein3.1e-2844.87Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        MA    KS A +LL+LN  +Y VI  I  WA+N  I+        L LPA   PIYFP+GN ATGFFV F L+A V G A++++G+ ++  W + +L +A
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV
        +++++ +W+LT+LAMG ACKEI + +    L T+E   II+SATQL+   AIH  V
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAV

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein9.6e-5468.18Show/hide
Query:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA
        M + QMK +A+ LL+LNFCMYA++LGIG W+MN AI+HGF+IG    LPAHFSPI+FPMGNAATGFF+ FAL+A V GAAS ISG++H++SW+  SL AA
Subjt:  MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG
         SAA  AW+LT+LAMGF CKEI L  RN RL TMEAF IILSATQL+YI AI+G
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGATTCACAGATGAAATCCATTGCCACTTTGCTTCTGTTGCTTAACTTCTGCATGTATGCAGTTATTTTGGGCATTGGTGGCTGGGCCATGAACACTGCAATTGA
TCATGGCTTCATCATTGGTCCCGGGCTTCGACTACCGGCGCATTTTTCACCGATTTACTTCCCCATGGGGAATGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACATTTGCTTTGTTGG
CTGCTGTGTTTGGAGCTGCCTCAGCAATCTCAGGACTGAACCATATTCGCTCATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGTGCTGCTTCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTC
ACTATCCTTGCCATGGGTTTTGCTTGCAAAGAGATTGCACTGGATTTCAGAAACACAAGACTGATAACAATGGAGGCTTTCTTCATTATTCTCTCTGCTACACAGCTTGT
TTACATCATGGCCATCCATGGTGCTGTTTCCACAAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGATTCACAGATGAAATCCATTGCCACTTTGCTTCTGTTGCTTAACTTCTGCATGTATGCAGTTATTTTGGGCATTGGTGGCTGGGCCATGAACACTGCAATTGA
TCATGGCTTCATCATTGGTCCCGGGCTTCGACTACCGGCGCATTTTTCACCGATTTACTTCCCCATGGGGAATGCAGCCACTGGTTTCTTTGTGACATTTGCTTTGTTGG
CTGCTGTGTTTGGAGCTGCCTCAGCAATCTCAGGACTGAACCATATTCGCTCATGGAGTGCTGAAAGCTTAGGTGCTGCTTCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTC
ACTATCCTTGCCATGGGTTTTGCTTGCAAAGAGATTGCACTGGATTTCAGAAACACAAGACTGATAACAATGGAGGCTTTCTTCATTATTCTCTCTGCTACACAGCTTGT
TTACATCATGGCCATCCATGGTGCTGTTTCCACAAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADSQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFIIGPGLRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSAESLGAASSAAVFAWTL
TILAMGFACKEIALDFRNTRLITMEAFFIILSATQLVYIMAIHGAVSTR