; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg036333 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg036333
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionVQ motif containing protein
Genome locationscaffold5:41579085..41581988
RNA-Seq ExpressionSpg036333
SyntenySpg036333
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583990.1 VQ motif-containing protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.9e-10884.38Show/hide
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XP_022140263.1 VQ motif-containing protein 4-like isoform X2 [Momordica charantia]3.6e-11587.5Show/hide
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XP_023520333.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-10883.98Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]1.2e-11589.02Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B685 VQ motif-containing protein 4 isoform X14.8e-10582.03Show/hide
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A0A6J1CGC6 VQ motif-containing protein 4-like isoform X14.6e-11685.35Show/hide
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A0A6J1CHL5 VQ motif-containing protein 4-like isoform X21.7e-11587.5Show/hide
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A0A6J1EII3 VQ motif-containing protein 4-like7.8e-10883.59Show/hide
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like2.7e-10883.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 131.5e-3147.74Show/hide
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        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +P        S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         +S
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        G     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P  +PH
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Q5M750 VQ motif-containing protein 41.7e-5956.87Show/hide
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        ME S  + E    ++ +PSP    + NS   SSS+ +       PP TP   +         TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  
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Query:  SA-KPSSGGSNSD---SVSKSHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPD
        S+ KP+      D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINPL PVF +  NS FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPD
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Query:  PFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        PFDRSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 331.8e-3245.2Show/hide
Query:  SSSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQ-QLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-SPETAKQASAKPSSGGSNSDSVSKSHIPPIKSLP
        S+SS +S   Q+  PPP    P+ Q Q+ SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTG S +T      +  S  +N++  S   IPPIK   
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Query:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPLIPVFASTGNSG------FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC
          + + FKLYERR +           +N L++     +  + GNS       FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S     
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Query:  SYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 311.7e-1135Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPSSGGSNSDSVSKSHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLN-KLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILS
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG P     A+A P +      +V K+ I        +++   KL+ERR  +  KL+I      F  TG +  S      L 
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Query:  PSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
         S +  P+   S ++ +  +P               +   + E EEKAIKE+ FYLHPSP + P  +EP LL LFP+TSP
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 193.2e-3445.97Show/hide
Query:  TSRMTTNSSSSSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPSSGGSNSDSVSKSHIP
        T+  +++SSS SSS  NG                 LH    ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P +  S   +     IP
Subjt:  TSRMTTNSSSSSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPSSGGSNSDSVSKSHIP

Query:  PIKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLK
        PIK+   ++ SG KLYERR       N  N L IN L+      G+  FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+          
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Query:  NGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
                  EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein1.2e-6056.87Show/hide
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        ME S  + E    ++ +PSP    + NS   SSS+ +       PP TP   +         TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  
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Query:  SA-KPSSGGSNSD---SVSKSHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPD
        S+ KP+      D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINPL PVF +  NS FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPD
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        PFDRSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein1.1e-6156.98Show/hide
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        ME S  + E    ++ +PSP    + NS   SSS+ +       PP TP   +         TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  
Subjt:  METSSIHHENPCPSSFLPSPTSRMTTNSSSSSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQA

Query:  SA-KPSSGGSNSD---SVSKSHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPD
        S+ KP+      D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINPL PVF +  NS FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPD
Subjt:  SA-KPSSGGSNSD---SVSKSHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPD

Query:  PFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPVN
        PFDRSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV VN
Subjt:  PFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPVN

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein1.1e-3247.74Show/hide
Query:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPSSGGSNSDSVSKSHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPLIPVFASTGNS
        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +P        S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         +S
Subjt:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPSSGGSNSDSVSKSHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPLIPVFASTGNS

Query:  GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPVNTPH
        G     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P  +PH
Subjt:  GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPVNTPH

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein2.3e-3545.97Show/hide
Query:  TSRMTTNSSSSSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPSSGGSNSDSVSKSHIP
        T+  +++SSS SSS  NG                 LH    ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P +  S   +     IP
Subjt:  TSRMTTNSSSSSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPSSGGSNSDSVSKSHIP

Query:  PIKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLK
        PIK+   ++ SG KLYERR       N  N L IN L+      G+  FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+          
Subjt:  PIKSLPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLK

Query:  NGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
                  EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  NGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein1.3e-3345.2Show/hide
Query:  SSSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQ-QLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-SPETAKQASAKPSSGGSNSDSVSKSHIPPIKSLP
        S+SS +S   Q+  PPP    P+ Q Q+ SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTG S +T      +  S  +N++  S   IPPIK   
Subjt:  SSSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQ-QLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-SPETAKQASAKPSSGGSNSDSVSKSHIPPIKSLP

Query:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPLIPVFASTGNSG------FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC
          + + FKLYERR +           +N L++     +  + GNS       FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S     
Subjt:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLKINPLIPVFASTGNSG------FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC

Query:  SYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
Subjt:  SYLKNGNAKMDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACCTCTTCGATTCACCATGAAAACCCATGTCCTTCTTCTTTCCTTCCTTCTCCAACCAGCCGCATGACCACCAACAGCAGTAGCAGTAGCAGCAGCACCAGCAA
TGGAGTCCAACTCATGCCTCCACCGCCCCCGACTCCGCCGCCTCAATTGCAGCAATTGCACTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCCGTCAACCCTTACCCCACTA
CCTTCGTCCAAGCCGATACCTCCTCTTTCAAACAAGTAGTTCAAATGCTCACCGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCCGCCAAGCCTTCTTCCGGTGGTTCCAAC
TCTGATTCCGTCTCCAAATCGCACATTCCGCCGATTAAATCCTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAGCTTAAAAT
TAACCCGTTGATTCCGGTTTTTGCTTCGACTGGTAATTCGGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAGATTCTTTCTCCGAGCATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTCTCAGTC
CGGTCACGCCGCTAATTCCCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTAAAGAATGGGAATGCGAAGATGGATGCTGAGGCGGAAGAGAAAGCGATT
AAAGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCGCCGACCACCACTCCTCGGGACTCCGAGCCTCGGCTGTTGCCTCTGTTCCCAATGACATCGCCTAGAGTTCCAGTCAACAC
TCCCCACTCAATAAATGTAATATCAATGCGAAGACTAATTCAGCTTTGGGTCCTTTTTGGCATTGGCAAGCCAATTAGTGTAGTGCAGGGGAATGGAATACGCAATGGAT
GGGCAATTGATGATATAAAGGCATTCTCCGCTCTCAAAGCTTTGGCCTTCGCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACCTCTTCGATTCACCATGAAAACCCATGTCCTTCTTCTTTCCTTCCTTCTCCAACCAGCCGCATGACCACCAACAGCAGTAGCAGTAGCAGCAGCACCAGCAA
TGGAGTCCAACTCATGCCTCCACCGCCCCCGACTCCGCCGCCTCAATTGCAGCAATTGCACTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCCGTCAACCCTTACCCCACTA
CCTTCGTCCAAGCCGATACCTCCTCTTTCAAACAAGTAGTTCAAATGCTCACCGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCCGCCAAGCCTTCTTCCGGTGGTTCCAAC
TCTGATTCCGTCTCCAAATCGCACATTCCGCCGATTAAATCCTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAGCTTAAAAT
TAACCCGTTGATTCCGGTTTTTGCTTCGACTGGTAATTCGGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAGATTCTTTCTCCGAGCATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTCTCAGTC
CGGTCACGCCGCTAATTCCCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTAAAGAATGGGAATGCGAAGATGGATGCTGAGGCGGAAGAGAAAGCGATT
AAAGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCGCCGACCACCACTCCTCGGGACTCCGAGCCTCGGCTGTTGCCTCTGTTCCCAATGACATCGCCTAGAGTTCCAGTCAACAC
TCCCCACTCAATAAATGTAATATCAATGCGAAGACTAATTCAGCTTTGGGTCCTTTTTGGCATTGGCAAGCCAATTAGTGTAGTGCAGGGGAATGGAATACGCAATGGAT
GGGCAATTGATGATATAAAGGCATTCTCCGCTCTCAAAGCTTTGGCCTTCGCATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METSSIHHENPCPSSFLPSPTSRMTTNSSSSSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPQLQQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPSSGGSN
SDSVSKSHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFASTGNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKMDAEAEEKAI
KEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPVNTPHSINVISMRRLIQLWVLFGIGKPISVVQGNGIRNGWAIDDIKAFSALKALAFA