; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg036489 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg036489
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like
Genome locationscaffold5:44945527..44949227
RNA-Seq ExpressionSpg036489
SyntenySpg036489
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001857 - Ribosomal protein L19
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR038657 - Ribosomal protein L19 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573088.1 50S ribosomal protein L19, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-12183.39Show/hide
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XP_022137703.1 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like [Momordica charantia]1.4e-12184.86Show/hide
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XP_022955269.1 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.8e-12183.39Show/hide
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XP_022955270.1 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X2 [Cucurbita moschata]8.9e-12183.04Show/hide
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XP_031743848.1 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]3.4e-12082.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CB38 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like6.7e-12284.86Show/hide
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A0A6J1GUP7 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X24.3e-12183.04Show/hide
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A0A6J1GVN3 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X18.7e-12283.39Show/hide
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A0A6J1K1Y5 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like isoform X22.4e-11983.04Show/hide
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        S C AFQSPR HLFQLAEIAAPFSSRGIATTSSMESAPQGSPAIDSDITPRIKFKRLDKTSKHIMQILDKEAIEEVKA+REIPDIKPGYIVQLKV     
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A0A6J1K3G4 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like isoform X14.8e-12083.39Show/hide
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        S C AFQSPR HLFQLAEIAAPFSSRGIATTSSMESAPQGSPAIDSDITPRIKFKRLDKTSKHIMQILDKEAIEEVKA+REIPDIKPGYIVQLKV     
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B9MQX0 50S ribosomal protein L197.3e-1742.34Show/hide
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P82413 50S ribosomal protein L19, chloroplastic1.1e-2844.32Show/hide
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        S+  S F  P  + F +   AE ++   +  +A  +  E  P  S A   +  PR +  +L      IM IL+K+A+   +  R +P I+ G IVQ+++ 
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Q2VZV5 50S ribosomal protein L193.9e-1843.48Show/hide
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        +I++ L+KE IE++ A R +P   PG  +++ V           +  N+ RV   +G+ IAR+N GLN++F +R++  G GVE +FPLYSPNI  I+V+ 
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        +  VRRAKLYYLRD+
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Q8RXX5 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic1.1e-2855.08Show/hide
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        IM +L+K+AIE  +  R +P ++ G IV++K+          EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG++TT R+RR++AG+GVE +FP+YSPNIKEIKV+  
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        +KVRRA+LYYLRDK+  L
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Q8W463 50S ribosomal protein L19-1, chloroplastic8.3e-2955.08Show/hide
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        +KVRRA+LYYLRDK+  L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24240.1 Ribosomal protein L19 family protein5.3e-5571.43Show/hide
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        FSSR  +TT     + QGSP  D  +  RIKFKRLDKT+KHIMQI+DKEA+EEV+  REIP+IKPGYIVQLKV          EVPENKRRVS +KG+VI
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AT4G11630.1 Ribosomal protein L19 family protein1.7e-5672.05Show/hide
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AT4G17560.1 Ribosomal protein L19 family protein5.9e-3055.08Show/hide
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AT5G11750.1 Ribosomal protein L19 family protein2.0e-5772.84Show/hide
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        IARRNAGLN+TFR+RRLVAGVGVES+FPLYSPN++EIKV+DKKKVRRAKLYYLRDK+NALKK
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AT5G47190.1 Ribosomal protein L19 family protein7.7e-3055.08Show/hide
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        IM +L+K+AIE  +  R +P ++ G IV++K+          EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG++TT R+RR++AG+GVE +FP+YSPNIKEIKV+  
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        +KVRRA+LYYLRDK+  L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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