CuGenDBv2

Gene ID	Spg036566
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Serine/threonine-protein kinase fray2
Genome location	scaffold5:45490436..45494447
RNA-Seq Expression	Spg036566
Synteny	Spg036566
Gene Ontology terms	GO:0000380 - alternative mRNA splicing, via spliceosome (biological process) GO:0016310 - phosphorylation (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR034604 - Serine/Arginine-related protein 53

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0055199.1 serine/threonine-protein kinase fray2 [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_011651355.1 RNA-binding protein 25 [Cucumis sativus]

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XP_038895539.1 serine/threonine-protein kinase fray2 isoform X1 [Benincasa hispida]

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XP_038895540.1 serine/threonine-protein kinase fray2 isoform X2 [Benincasa hispida]

1.4e-81

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LTD9 Uncharacterized protein

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A0A1S3AV81 serine/threonine-protein kinase fray2

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A0A5A7UP09 Serine/threonine-protein kinase fray2

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A0A5D3BJE5 Serine/threonine-protein kinase fray2

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A0A6J1E8B9 serine/threonine-protein kinase fray2

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT3G48120.1 unknown protein

1.3e-21

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        ER  R+SS RRR  S+ER+            +R++  RRRSRS +R    Y DR+   RRRSRSRS        RR+R   RE +R  +       R++ 
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        R  E  K +  DYSRLI+GYD+M
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGAGCAGCGAGTAAAGCGGGCGATTGGGCGTTCAAGGCCTTAACTGCCGGTCTCGGCGTCGCCACCATTTACCTCACCGCTACGTTCTCAGTCAACGTTTACAGAGG
ATTGTCTTGGCACAAAGCTCAATCCGTATTATTCCTCTCCTTCGCTTTATGTTCCATATTAATTTTGACGCTTCAGTTTATACCTCATCTTTCTTGGGAAGAGAATAGGA
ATACTCTCTGTTTGGACATAAATTTCTATGATTATGTTTATGAAGGGTGTTATTCATACAAGTTCGGCAATTTACTGCAGAACATTTCAGCTATTCTAATGGGAATTGCC
TTGGATACGTACGTATCTTGTTCAAAGGCCACAGAAACCAAATTTGGAGCCGGAATGGAGGAATCGAAAGCAGCTGCGTACTACGACGAGCTCACTCGTAAAGGAGAAGG
GGCGGCAAGGTTCAAACGAGGCCTCGGTTTCTCCGCCTCCGACTCCAGCAGCGATGTGGTCTCTGCATCCAAGGGCTCCGCTCTGCCTTCTTCGTCTTCCTTCCTCAGTT
CTTTTGTTAAAGCCTCAAGCCCTTCCAAGGCCTCCGAGTTCGAAAAGCAAGCGCAGCTCCAGTCCATTCAGAACAAGCTGAAGAAGAAGAAACCGAGCTCTCCTGACGAG
GAAGAGAGGCGCCCTAGGGTTTTGGAGAGAGAGCGTCGGAAATCGAGCCCTAGACGAAGATCTTTGAGTAAAGAGAGGGAGAGACATTCGCATTCGAGGAGGCGGAGTTC
GAGTAGAGATAGAGAGAGGCATTCGAGGCGGCGAAGTAGGAGCCGAGATAGATATGGGGATAAGTATAGGGATAGGGATAGGGAGAGGAGGAGGAGAAGTAGGTCTAGGA
GTGATTCAGACAGAGACAGGCGGCGTCGACGGAGTAGAAGCTCGTCACGGGAGAGGAAGAGGGCGGACGACAATGGAAGTGACGGAGGGGGAAGACAGAAAGTCCGTAAA
GTTGAAAGACGGAAGACTGAAAGTGTTGATTATTCAAGATTGATCGAAGGATATGACAAGATGGTACGCTTCGTACTTCGTAGGCTTGCTTATTTCATTTCTCGCAATTG
A

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGAASKAGDWAFKALTAGLGVATIYLTATFSVNVYRGLSWHKAQSVLFLSFALCSILILTLQFIPHLSWEENRNTLCLDINFYDYVYEGCYSYKFGNLLQNISAILMGIA
LDTYVSCSKATETKFGAGMEESKAAAYYDELTRKGEGAARFKRGLGFSASDSSSDVVSASKGSALPSSSSFLSSFVKASSPSKASEFEKQAQLQSIQNKLKKKKPSSPDE
EERRPRVLERERRKSSPRRRSLSKERERHSHSRRRSSSRDRERHSRRRSRSRDRYGDKYRDRDRERRRRSRSRSDSDRDRRRRRSRSSSRERKRADDNGSDGGGRQKVRK
VERRKTESVDYSRLIEGYDKMVRFVLRRLAYFISRN

Spg036566 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome