; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg036610 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg036610
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionGDSL esterase/lipase At5g45960-like
Genome locationscaffold5:41337254..41339528
RNA-Seq ExpressionSpg036610
SyntenySpg036610
Gene Ontology termsGO:0016788 - hydrolase activity, acting on ester bonds (molecular function)
InterPro domainsIPR001087 - GDSL lipase/esterase
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008442893.1 PREDICTED: GDSL esterase/lipase At5g45960-like [Cucumis melo]1.3e-9884.96Show/hide
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XP_038893714.1 GDSL esterase/lipase At5g45960 [Benincasa hispida]1.0e-9883.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LSF1 Uncharacterized protein2.0e-9782.3Show/hide
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A0A1S3B6S3 GDSL esterase/lipase At5g45960-like6.3e-9984.96Show/hide
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A0A6J1CFV3 GDSL esterase/lipase At5g45960-like3.3e-9585.38Show/hide
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        YLDPTLSI ELM+GVSFASAGSGFDPLTP+VGNVV I+ QVEYFKEYK+RLE+ IGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYF  PLRRKTFTLSAYQ F
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        IIQQI+QFFQ L
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A0A6J1GUQ2 GDSL esterase/lipase At5g45960-like1.7e-9984.72Show/hide
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        YQHFIIQQISQFFQ L
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A0A6J1K536 GDSL esterase/lipase At5g45960-like1.2e-9783.33Show/hide
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        YQHFIIQQISQFFQ L
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q67ZI9 GDSL esterase/lipase At2g429904.6e-4648.88Show/hide
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        + + A++VFGDS+VD GNNNFI T+ R+NF PYGRDFP    TGRF NGRLS+DF +  YG+K  VP YLDP+ +I +  +GV FASAG+G+D  T +V 
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         V+P+  +VEYFKEY+  L + +G +R    I+ +++ +S GTNDF+  Y+ LP RR  F++S YQ F+++    F +
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Q8VY93 GDSL esterase/lipase At4g267909.0e-4248.26Show/hide
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        AL+VFGDSTVD GNNN I T+ +SNF PYGRD+     TGRFSNGR++ DFI+   G+K+ VP YLDP  +I +  +GV FASAG+G D  T  V +V+P
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        +  +VEY+KEY+ RL S +G+++    I  +++ IS GTNDF+  Y+ LP + + ++++ YQ+F+I   + F
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Q9FJ40 GDSL esterase/lipase At5g459601.1e-6859.46Show/hide
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        M  H R     + F+L L LFF     S S    A+++     SVSA+LVFGDSTVDPGNNN+I T+F+ NFPPYG DF    PTGRF NGRL TDFIAS
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        Y GVK+ VPPYLDP L I EL+SGVSFASAGSG+DPLTP + NV+ I  Q+EYF+EYK +LE  +GKQ  + HI+  +F +SAGTNDFVI YF +P+RRK
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        TFT+ AYQ F+I  + QF Q L
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Q9LMJ3 GDSL esterase/lipase At1g069901.1e-4442.65Show/hide
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        +++F++   + FS +      N   +N S+  A+LVFGDST+D GNNN+I T  R+NFPPYG +FP H  TGRFSNG+L  DFIAS  G+KD VPP+LDP
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         LS  ++++GV FASAGSG+D LT    + + +  Q +  + Y ERL  ++G ++  + +   +  +S+GTNDF +  ++ P RR+   +  YQ FI+  
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Query:  ISQFFQVLLHI
        +  F Q L  I
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Q9SJB4 GDSL esterase/lipase At2g045701.3e-4342.79Show/hide
Query:  HLPLFFSKSGALRARNKAPINSSVSALLVFGDSTVDPGNNNFIPTIFRSNFPPYGRDFPFHIPTGRFSNGRLSTDFIASYYGVKDYVPPYLDPTLSIEEL
        HL   F+    +   +       + A++VFGDS+VD GNNN+IPT+ RSNF PYGRDF    PTGRF NG+++TDF++   G+K  +P YLDP+ +I + 
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Query:  MSGVSFASAGSGFDPLTPEVGNVVPIAAQVEYFKEYKERLESVIGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYFNLPLRRKTFTLSAYQHFIIQQISQFFQV
         +GV+FASA +G+D  T +V +V+P+  Q+EY+KEY+ +L++  GK R    I+++++ IS GTNDF+  YF  P R   +++S YQ F+     +F + 
Subjt:  MSGVSFASAGSGFDPLTPEVGNVVPIAAQVEYFKEYKERLESVIGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYFNLPLRRKTFTLSAYQHFIIQQISQFFQV

Query:  L
        L
Subjt:  L

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06990.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein8.0e-4642.65Show/hide
Query:  LLVFLLHLPLFFSKSGALRARNKAPINSSV-SALLVFGDSTVDPGNNNFIPTIFRSNFPPYGRDFPFHIPTGRFSNGRLSTDFIASYYGVKDYVPPYLDP
        +++F++   + FS +      N   +N S+  A+LVFGDST+D GNNN+I T  R+NFPPYG +FP H  TGRFSNG+L  DFIAS  G+KD VPP+LDP
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Query:  TLSIEELMSGVSFASAGSGFDPLTPEVGNVVPIAAQVEYFKEYKERLESVIGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYFNLPLRRKTFTLSAYQHFIIQQ
         LS  ++++GV FASAGSG+D LT    + + +  Q +  + Y ERL  ++G ++  + +   +  +S+GTNDF +  ++ P RR+   +  YQ FI+  
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Query:  ISQFFQVLLHI
        +  F Q L  I
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AT2G04570.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein8.9e-4542.79Show/hide
Query:  HLPLFFSKSGALRARNKAPINSSVSALLVFGDSTVDPGNNNFIPTIFRSNFPPYGRDFPFHIPTGRFSNGRLSTDFIASYYGVKDYVPPYLDPTLSIEEL
        HL   F+    +   +       + A++VFGDS+VD GNNN+IPT+ RSNF PYGRDF    PTGRF NG+++TDF++   G+K  +P YLDP+ +I + 
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         +GV+FASA +G+D  T +V +V+P+  Q+EY+KEY+ +L++  GK R    I+++++ IS GTNDF+  YF  P R   +++S YQ F+     +F + 
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Query:  L
        L
Subjt:  L

AT2G42990.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein3.3e-4748.88Show/hide
Query:  SSVSALLVFGDSTVDPGNNNFIPTIFRSNFPPYGRDFPFHIPTGRFSNGRLSTDFIASYYGVKDYVPPYLDPTLSIEELMSGVSFASAGSGFDPLTPEVG
        + + A++VFGDS+VD GNNNFI T+ R+NF PYGRDFP    TGRF NGRLS+DF +  YG+K  VP YLDP+ +I +  +GV FASAG+G+D  T +V 
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Query:  NVVPIAAQVEYFKEYKERLESVIGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYFNLPLRRKTFTLSAYQHFIIQQISQFFQ
         V+P+  +VEYFKEY+  L + +G +R    I+ +++ +S GTNDF+  Y+ LP RR  F++S YQ F+++    F +
Subjt:  NVVPIAAQVEYFKEYKERLESVIGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYFNLPLRRKTFTLSAYQHFIIQQISQFFQ

AT4G26790.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein6.4e-4348.26Show/hide
Query:  ALLVFGDSTVDPGNNNFIPTIFRSNFPPYGRDFPFHIPTGRFSNGRLSTDFIASYYGVKDYVPPYLDPTLSIEELMSGVSFASAGSGFDPLTPEVGNVVP
        AL+VFGDSTVD GNNN I T+ +SNF PYGRD+     TGRFSNGR++ DFI+   G+K+ VP YLDP  +I +  +GV FASAG+G D  T  V +V+P
Subjt:  ALLVFGDSTVDPGNNNFIPTIFRSNFPPYGRDFPFHIPTGRFSNGRLSTDFIASYYGVKDYVPPYLDPTLSIEELMSGVSFASAGSGFDPLTPEVGNVVP

Query:  IAAQVEYFKEYKERLESVIGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYFNLPLRRKTFTLSAYQHFIIQQISQF
        +  +VEY+KEY+ RL S +G+++    I  +++ IS GTNDF+  Y+ LP + + ++++ YQ+F+I   + F
Subjt:  IAAQVEYFKEYKERLESVIGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYFNLPLRRKTFTLSAYQHFIIQQISQF

AT5G45960.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein8.0e-7059.46Show/hide
Query:  MNQHPRFSRFLLVFLLHLPLFF-----SKSGALRARNKAPINSSVSALLVFGDSTVDPGNNNFIPTIFRSNFPPYGRDFPFHIPTGRFSNGRLSTDFIAS
        M  H R     + F+L L LFF     S S    A+++     SVSA+LVFGDSTVDPGNNN+I T+F+ NFPPYG DF    PTGRF NGRL TDFIAS
Subjt:  MNQHPRFSRFLLVFLLHLPLFF-----SKSGALRARNKAPINSSVSALLVFGDSTVDPGNNNFIPTIFRSNFPPYGRDFPFHIPTGRFSNGRLSTDFIAS

Query:  YYGVKDYVPPYLDPTLSIEELMSGVSFASAGSGFDPLTPEVGNVVPIAAQVEYFKEYKERLESVIGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYFNLPLRRK
        Y GVK+ VPPYLDP L I EL+SGVSFASAGSG+DPLTP + NV+ I  Q+EYF+EYK +LE  +GKQ  + HI+  +F +SAGTNDFVI YF +P+RRK
Subjt:  YYGVKDYVPPYLDPTLSIEELMSGVSFASAGSGFDPLTPEVGNVVPIAAQVEYFKEYKERLESVIGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYFNLPLRRK

Query:  TFTLSAYQHFIIQQISQFFQVL
        TFT+ AYQ F+I  + QF Q L
Subjt:  TFTLSAYQHFIIQQISQFFQVL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATCAGCACCCTCGTTTTTCCCGTTTTCTCCTCGTCTTCCTTCTCCATCTCCCTCTCTTCTTCTCCAAATCCGGAGCGCTGCGAGCCCGGAATAAGGCTCCGATCAA
CTCGTCGGTCTCGGCGCTTTTGGTGTTCGGCGACTCCACCGTCGATCCCGGTAACAATAACTTCATCCCTACCATTTTCAGAAGCAATTTCCCTCCCTATGGCAGAGATT
TCCCCTTCCATATCCCCACCGGAAGATTCTCCAATGGCCGCCTTAGCACCGATTTTATAGCTTCTTACTACGGCGTGAAGGATTATGTTCCGCCGTATTTGGACCCGACG
CTTAGCATTGAGGAGTTGATGAGCGGCGTCAGTTTTGCCTCCGCCGGCTCCGGCTTCGACCCGCTCACTCCCGAAGTTGGGAACGTTGTGCCGATTGCAGCACAAGTGGA
GTATTTCAAAGAATACAAAGAAAGATTGGAGTCTGTAATCGGAAAGCAAAGAACCAAAAATCACATAAAAAATACAGTCTTCTTTATCAGTGCAGGAACCAACGATTTCG
TCATCACTTACTTCAACTTACCTCTTCGAAGAAAGACTTTCACTCTCTCAGCTTACCAGCACTTCATCATTCAACAAATCTCCCAATTTTTCCAGGTTCTACTTCACATC
AATCCTTCTTCTGCATTGGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATCAGCACCCTCGTTTTTCCCGTTTTCTCCTCGTCTTCCTTCTCCATCTCCCTCTCTTCTTCTCCAAATCCGGAGCGCTGCGAGCCCGGAATAAGGCTCCGATCAA
CTCGTCGGTCTCGGCGCTTTTGGTGTTCGGCGACTCCACCGTCGATCCCGGTAACAATAACTTCATCCCTACCATTTTCAGAAGCAATTTCCCTCCCTATGGCAGAGATT
TCCCCTTCCATATCCCCACCGGAAGATTCTCCAATGGCCGCCTTAGCACCGATTTTATAGCTTCTTACTACGGCGTGAAGGATTATGTTCCGCCGTATTTGGACCCGACG
CTTAGCATTGAGGAGTTGATGAGCGGCGTCAGTTTTGCCTCCGCCGGCTCCGGCTTCGACCCGCTCACTCCCGAAGTTGGGAACGTTGTGCCGATTGCAGCACAAGTGGA
GTATTTCAAAGAATACAAAGAAAGATTGGAGTCTGTAATCGGAAAGCAAAGAACCAAAAATCACATAAAAAATACAGTCTTCTTTATCAGTGCAGGAACCAACGATTTCG
TCATCACTTACTTCAACTTACCTCTTCGAAGAAAGACTTTCACTCTCTCAGCTTACCAGCACTTCATCATTCAACAAATCTCCCAATTTTTCCAGGTTCTACTTCACATC
AATCCTTCTTCTGCATTGGCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LSIEELMSGVSFASAGSGFDPLTPEVGNVVPIAAQVEYFKEYKERLESVIGKQRTKNHIKNTVFFISAGTNDFVITYFNLPLRRKTFTLSAYQHFIIQQISQFFQVLLHI
NPSSALA