; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg036798 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg036798
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionDUF4228 domain-containing protein
Genome locationscaffold5:43222257..43222610
RNA-Seq ExpressionSpg036798
SyntenySpg036798
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056859.1 DUF4228 domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-4176.72Show/hide
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XP_023001321.1 uncharacterized protein LOC111495485 [Cucurbita maxima]6.0e-3976.52Show/hide
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XP_038895954.1 uncharacterized protein LOC120084128 [Benincasa hispida]2.0e-4281.2Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LRL1 Uncharacterized protein1.1e-3877.12Show/hide
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A0A5A7UTK3 DUF4228 domain-containing protein2.4e-4176.72Show/hide
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A0A6J1CEB2 uncharacterized protein LOC1110108808.2e-4277.97Show/hide
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A0A6J1EYG4 uncharacterized protein LOC1114400572.2e-3975.65Show/hide
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A0A6J1KIA5 uncharacterized protein LOC1114954852.9e-3976.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G20340.1 Expression of the gene is downregulated in the presence of paraquat, an inducer of photoxidative stress.3.1e-0934.19Show/hide
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        MGNC R +S    WAGEDW  F ++       +  SS    +   ++  + + SS  + E+KI++TK++L DL+ K+ +  L+ +Q      ++N     
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        E    R WRP LQSIPE
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AT4G21920.1 unknown protein1.2e-1337.21Show/hide
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        MGNC C ++ +T  W+G+D GS+  +  R R+        D EK  LLG      + +++SSS   E+KI++TK+ELEDL++ + L+ L+ E++L +++ 
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         G D+          HH+ W+P LQSIPE
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAACTGTTGCAGAAGCCAATCTTCTACACGGGTCTGGGCCGGAGAAGATTGGGGCTCCTTCACTTCCAAGCACGGCCGTGGCCGCGCCGGAAATGCCACCTCCTC
CGGCGGCGATTCAGAGAAACATAGGCTACTTGGGGCGAAGACAGCAGCGTCGTCTTCGGCGACGGGGGAAGTGAAAATCAAGATGACGAAGAGAGAGCTGGAGGATCTGG
TGAAGAAGCTGGAGTTGCAAGGCTTGAGTCTGGAACAAGTTCTTGGCCAGATGATGAACGGTGAAGATGAGTTTGAAGTTGAGCATCATCGCTCGTGGAGGCCTTCTCTT
CAGAGCATTCCAGAGGATTGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGAACTGTTGCAGAAGCCAATCTTCTACACGGGTCTGGGCCGGAGAAGATTGGGGCTCCTTCACTTCCAAGCACGGCCGTGGCCGCGCCGGAAATGCCACCTCCTC
CGGCGGCGATTCAGAGAAACATAGGCTACTTGGGGCGAAGACAGCAGCGTCGTCTTCGGCGACGGGGGAAGTGAAAATCAAGATGACGAAGAGAGAGCTGGAGGATCTGG
TGAAGAAGCTGGAGTTGCAAGGCTTGAGTCTGGAACAAGTTCTTGGCCAGATGATGAACGGTGAAGATGAGTTTGAAGTTGAGCATCATCGCTCGTGGAGGCCTTCTCTT
CAGAGCATTCCAGAGGATTGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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