| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0042035.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.6e-19 | 35.95 | Show/hide |
Query: DDVCWLHAVFRTKL-----AGVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
DDVCWLHAVFR K GVMPPRTSRR RQNQDGTQDPTQGQSE+GSSTPR Q GSE+FARSAQ
Subjt: DDVCWLHAVFRTKL-----AGVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
Query: ----------------------------------------KLVETALCVE-------------------------------------------------Q
K T C +
Subjt: ----------------------------------------KLVETALCVE-------------------------------------------------Q
Query: SIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
SIIEEKSA+E S+G ST SG RG+EQ FT G+NVSG QDFK
Subjt: SIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
|
|
| KAA0045180.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold30G001810 [Cucumis melo var. makuwa] | 2.7e-20 | 36.73 | Show/hide |
Query: DDVCWLHAVFRTKLA-----GVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
DDVC +HAVF+ K A GVMPPRTSRR RQNQDGTQDPTQGQSE GSSTPR Q G EQFARSAQ
Subjt: DDVCWLHAVFRTKLA-----GVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
Query: --------------------------------------------------------------------------------------------KLVETALC
+LVETAL
Subjt: --------------------------------------------------------------------------------------------KLVETALC
Query: VEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
VEQSI++EKSA+E SRG T SG RGREQ FTLG+NV G QDFK
Subjt: VEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
|
|
| KAA0047291.1 retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass [Cucumis melo var. makuwa] | 3.7e-22 | 46.95 | Show/hide |
Query: VMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQKL--------------------------------------------------
VMPPRTSRR RQNQDG Q PTQGQS SSTPRVQ G G+E+FAR+ Q++
Subjt: VMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQKL--------------------------------------------------
Query: ------------VETALCVEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFKS
VETALCVEQSI EEKSAVE SR S ASGFRG EQW FTLG+N+S RQDFK+
Subjt: ------------VETALCVEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFKS
|
|
| KAA0056353.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.0e-19 | 34.9 | Show/hide |
Query: DDVCWLHAVFRTKLAG---------VMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ---------------------------
DDVCWLH VFR K G VMPPRTS+R RQNQDGTQDPTQGQSE+GSSTPR Q GSE+F+RSAQ
Subjt: DDVCWLHAVFRTKLAG---------VMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ---------------------------
Query: ----------------------------------------------------------------------------------------------------
Subjt: ----------------------------------------------------------------------------------------------------
Query: --KLVETALCVEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
+LVETAL VEQSI+EEKS +E SRG ST SG RGREQ FT G+NVS QDFK
Subjt: --KLVETALCVEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
|
|
| TYK27372.1 uncharacterized protein E5676_scaffold325G00500 [Cucumis melo var. makuwa] | 2.7e-20 | 36.73 | Show/hide |
Query: DDVCWLHAVFRTKLA-----GVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
DDVC +HAVF+ K A GVMPPRTSRR RQNQDGTQDPTQGQSE GSSTPR Q G EQFARSAQ
Subjt: DDVCWLHAVFRTKLA-----GVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
Query: --------------------------------------------------------------------------------------------KLVETALC
+LVETAL
Subjt: --------------------------------------------------------------------------------------------KLVETALC
Query: VEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
VEQSI++EKSA+E SRG T SG RGREQ FTLG+NV G QDFK
Subjt: VEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TKT0 Reverse transcriptase | 3.2e-19 | 35.95 | Show/hide |
Query: DDVCWLHAVFRTKL-----AGVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
DDVCWLHAVFR K GVMPPRTSRR RQNQDGTQDPTQGQSE+GSSTPR Q GSE+FARSAQ
Subjt: DDVCWLHAVFRTKL-----AGVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
Query: ----------------------------------------KLVETALCVE-------------------------------------------------Q
K T C +
Subjt: ----------------------------------------KLVETALCVE-------------------------------------------------Q
Query: SIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
SIIEEKSA+E S+G ST SG RG+EQ FT G+NVSG QDFK
Subjt: SIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
|
|
| A0A5A7TPS6 Retrotrans_gag domain-containing protein | 1.3e-20 | 36.73 | Show/hide |
Query: DDVCWLHAVFRTKLA-----GVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
DDVC +HAVF+ K A GVMPPRTSRR RQNQDGTQDPTQGQSE GSSTPR Q G EQFARSAQ
Subjt: DDVCWLHAVFRTKLA-----GVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
Query: --------------------------------------------------------------------------------------------KLVETALC
+LVETAL
Subjt: --------------------------------------------------------------------------------------------KLVETALC
Query: VEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
VEQSI++EKSA+E SRG T SG RGREQ FTLG+NV G QDFK
Subjt: VEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
|
|
| A0A5A7U122 Retrotransposon protein, putative, Ty3-gypsy subclass | 1.8e-22 | 46.95 | Show/hide |
Query: VMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQKL--------------------------------------------------
VMPPRTSRR RQNQDG Q PTQGQS SSTPRVQ G G+E+FAR+ Q++
Subjt: VMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQKL--------------------------------------------------
Query: ------------VETALCVEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFKS
VETALCVEQSI EEKSAVE SR S ASGFRG EQW FTLG+N+S RQDFK+
Subjt: ------------VETALCVEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFKS
|
|
| A0A5A7UKD3 DNA/RNA polymerases superfamily protein | 4.9e-20 | 34.9 | Show/hide |
Query: DDVCWLHAVFRTKLAG---------VMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ---------------------------
DDVCWLH VFR K G VMPPRTS+R RQNQDGTQDPTQGQSE+GSSTPR Q GSE+F+RSAQ
Subjt: DDVCWLHAVFRTKLAG---------VMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ---------------------------
Query: ----------------------------------------------------------------------------------------------------
Subjt: ----------------------------------------------------------------------------------------------------
Query: --KLVETALCVEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
+LVETAL VEQSI+EEKS +E SRG ST SG RGREQ FT G+NVS QDFK
Subjt: --KLVETALCVEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
|
|
| A0A5D3DV36 Retrotrans_gag domain-containing protein | 1.3e-20 | 36.73 | Show/hide |
Query: DDVCWLHAVFRTKLA-----GVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
DDVC +HAVF+ K A GVMPPRTSRR RQNQDGTQDPTQGQSE GSSTPR Q G EQFARSAQ
Subjt: DDVCWLHAVFRTKLA-----GVMPPRTSRRPRQNQDGTQDPTQGQSEKGSSTPRVQTGVGSEQFARSAQ-------------------------------
Query: --------------------------------------------------------------------------------------------KLVETALC
+LVETAL
Subjt: --------------------------------------------------------------------------------------------KLVETALC
Query: VEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
VEQSI++EKSA+E SRG T SG RGREQ FTLG+NV G QDFK
Subjt: VEQSIIEEKSAVEPSRGASTASGFRGREQWSFTLGMNVSGRQDFK
|
|
