; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg038105 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg038105
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationscaffold12:42845074..42851313
RNA-Seq ExpressionSpg038105
SyntenySpg038105
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057418.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-13785.94Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------
        MD   NSSRL +FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR+VPMA+LTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK               
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------

Query:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
                    AAATRSLARGTNFSAIISMLKE VIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
Subjt:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKA
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS+KVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ+PEEGLKA
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKA

Query:  LENFTKTLKSALS
        LENFTK+LKSALS
Subjt:  LENFTKTLKSALS

XP_004145375.1 tryptophan synthase alpha chain isoform X1 [Cucumis sativus]4.7e-13886.17Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------
        MDI  NSSRL +FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR+VPMA+LTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK               
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------

Query:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
                    AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLLT
Subjt:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS+KVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ+PEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ENFTKTLKSAL
        ENFTK+L SAL
Subjt:  ENFTKTLKSAL

XP_008449352.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]9.5e-13986.22Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------
        MD   NSSRL +FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR+VPMA+LTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK               
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------

Query:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
                    AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS+KVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ+PEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ENFTKTLKSALS
        ENFTK+LKSALS
Subjt:  ENFTKTLKSALS

XP_022145935.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Momordica charantia]5.8e-13684.35Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTT-LIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK--------------
        MDIAFNSSRLLRFNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMAA+TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK              
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTT-LIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK--------------

Query:  -------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
                     AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  -------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKA
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVS++VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSA+VKLLGEA++PEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKA

Query:  LENFTKTLKSALS
        LENFTK+LKSALS
Subjt:  LENFTKTLKSALS

XP_038888258.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Benincasa hispida]7.8e-14187.82Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------
        MDI+FNSSRLLRFNKIPTTLIFP HPCKISVFQ+KR VPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK               
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------

Query:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
                    AAATRSLA GTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+ IKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGAR SV+DKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ+PEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ENFTKTLKSALS
        ENFTKTLKSALS
Subjt:  ENFTKTLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKV4 Tryptophan synthase2.3e-13886.17Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------
        MDI  NSSRL +FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR+VPMA+LTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK               
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------

Query:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
                    AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLLT
Subjt:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS+KVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ+PEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ENFTKTLKSAL
        ENFTK+L SAL
Subjt:  ENFTKTLKSAL

A0A1S3BMG6 Tryptophan synthase4.6e-13986.22Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------
        MD   NSSRL +FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR+VPMA+LTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK               
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------

Query:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
                    AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS+KVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ+PEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ENFTKTLKSALS
        ENFTK+LKSALS
Subjt:  ENFTKTLKSALS

A0A5A7UQL8 Tryptophan synthase1.1e-13785.94Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------
        MD   NSSRL +FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR+VPMA+LTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK               
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------

Query:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
                    AAATRSLARGTNFSAIISMLKE VIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
Subjt:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKA
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS+KVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ+PEEGLKA
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKA

Query:  LENFTKTLKSALS
        LENFTK+LKSALS
Subjt:  LENFTKTLKSALS

A0A5D3E1Z9 Tryptophan synthase4.6e-13986.22Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------
        MD   NSSRL +FNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKR+VPMA+LTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK               
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------

Query:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
                    AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  ------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVS+KVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQ+PEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKAL

Query:  ENFTKTLKSALS
        ENFTK+LKSALS
Subjt:  ENFTKTLKSALS

A0A6J1CVV7 Tryptophan synthase2.8e-13684.35Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTT-LIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK--------------
        MDIAFNSSRLLRFNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMAA+TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK              
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTT-LIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK--------------

Query:  -------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
                     AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  -------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKA
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVS++VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSA+VKLLGEA++PEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKA

Query:  LENFTKTLKSALS
        LENFTK+LKSALS
Subjt:  LENFTKTLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B7JUK2 Tryptophan synthase alpha chain5.2e-6349.81Show/hide
Query:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN
        +S+ F  L+++ + A IP+ITAGDPDL TTA+AL+                           AAATR+L RG     ++ ++KEV PE+  PI LF+YYN
Subjt:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN

Query:  PILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVT
        PI  RG+E F+  +K AGV+GLVVPD+PLEE E L K A +  I + LL  PT+P +R++AI   S+GF+YLVS  GVTG R+ V+ +V+ LL  ++  T
Subjt:  PILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVT

Query:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL
        +KP+ VGFGISKPEH  QV +WGAD +IVGSAMVK L E  TPEEGLKA+  F + LK AL
Subjt:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL

O22765 Tryptophan synthase alpha chain3.1e-10071.64Show/hide
Query:  TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S  VGLSETF++LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALK                           AAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLL
        ALF+YYNPIL+RG+EN+M  IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPK+RM AIVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV++KVQ+LL
Subjt:  ALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLL

Query:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVK+LGE+++PE+GLK LE FTK+LKSAL
Subjt:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic1.8e-7153.64Show/hide
Query:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN
        +S+T + L  +GK AFIPYITAGDPDL+TTAEAL+                           A+  R+LA GT   A++ ML+EV PELSCP+ L SYY 
Subjt:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN

Query:  PILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVT
        PI+ R +      +K+AGV GL+VPD+P      L  EA  +N+ELVLLTTP  P+DRMK I +ASEGFVYLVS  GVTG RA+V+ +V++L++E+K+VT
Subjt:  PILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIKEVT

Query:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL
         KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMV+ LGEA +P++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL

Q10W95 Tryptophan synthase alpha chain1.2e-6249.06Show/hide
Query:  VGLSETFSKLK-EQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEAL---------------------------KAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFS
        + +S+ F  L+    + A IP+ITAGDPDL TTA+AL                           +AAATRSL RGT   +++ +++ V P+L  PI LF+
Subjt:  VGLSETFSKLK-EQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEAL---------------------------KAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFS

Query:  YYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIK
        YYNPIL RG+ENF+  I D G RGLVVPD+PLEE +IL + A    IEL LL  PT+PK+R+KAI   S+GF+YLVS  GVTG RA +  +V+ LL +++
Subjt:  YYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIK

Query:  EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSALS
        EVT+KP+ VGFGIS+PE   QV  WG+D +IVGSA+VK L E  +P+EGLKA+  F + LK+A++
Subjt:  EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSALS

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic1.0e-9867.63Show/hide
Query:  KRLVPMAAL-TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLK
        KR  PMA+L T+SP +GL++TF++LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK                           AAATRSL RGTN  +I+ ML 
Subjt:  KRLVPMAAL-TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLK

Query:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARA
        +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+  FM +I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IELVLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS+GVTGAR+
Subjt:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARA

Query:  SVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL
        SVS KVQ+LL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IVGSAMVKLLG+A++P EGLK LE  TK+LKSAL
Subjt:  SVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain7.1e-10067.63Show/hide
Query:  KRLVPMAAL-TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLK
        KR  PMA+L T+SP +GL++TF++LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK                           AAATRSL RGTN  +I+ ML 
Subjt:  KRLVPMAAL-TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLK

Query:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARA
        +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+  FM +I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IELVLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS+GVTGAR+
Subjt:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARA

Query:  SVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL
        SVS KVQ+LL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IVGSAMVKLLG+A++P EGLK LE  TK+LKSAL
Subjt:  SVSDKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein2.2e-10171.64Show/hide
Query:  TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S  VGLSETF++LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALK                           AAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALK---------------------------AAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLL
        ALF+YYNPIL+RG+EN+M  IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPK+RM AIVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV++KVQ+LL
Subjt:  ALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLL

Query:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVK+LGE+++PE+GLK LE FTK+LKSAL
Subjt:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGCTTTCAATTCTTCGAGGTTACTTCGATTCAACAAGATACCCACTACCCTTATCTTTCCTCCTCACCCTTGTAAGATTTCAGTCTTCCAATCCAAGCGGCT
TGTTCCAATGGCTGCCCTTACAGCCTCCCCTGCTGTAGGACTGTCCGAAACATTCAGCAAGTTGAAGGAACAAGGCAAGGTTGCATTTATCCCCTACATCACTGCTGGGG
ATCCTGATCTTTCCACCACGGCTGAAGCATTGAAGGCTGCAGCTACTCGGTCCTTGGCTAGAGGGACAAATTTTAGCGCAATCATTTCTATGCTGAAGGAGGTGATTCCT
GAACTATCTTGCCCAATTGCCCTTTTTTCATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCATTGAGAACTTCATGATTACAATAAAAGATGCTGGTGTACGAGGGCTTGTTGT
TCCGGATGTTCCTCTCGAGGAGACCGAAATTTTGAGAAAAGAAGCTGTAAAGCACAATATTGAGCTGGTACTCTTGACTACACCAACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAG
CCATCGTTGAAGCTTCAGAGGGCTTTGTATATCTTGTGAGCTCTGTTGGAGTTACCGGTGCCCGTGCATCAGTGAGTGATAAAGTTCAAACTCTCCTAGAGGAAATTAAA
GAGGTAACCGAAAAACCAGTAGCAGTAGGTTTTGGTATATCGAAACCCGAGCACGTAAAACAGGTGGCTAGCTGGGGGGCTGATGGCATCATAGTTGGCAGTGCCATGGT
GAAGCTGTTGGGTGAAGCTCAGACTCCTGAAGAAGGATTGAAGGCACTTGAAAACTTCACCAAAACCTTAAAATCTGCACTCTCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACATTGCTTTCAATTCTTCGAGGTTACTTCGATTCAACAAGATACCCACTACCCTTATCTTTCCTCCTCACCCTTGTAAGATTTCAGTCTTCCAATCCAAGCGGCT
TGTTCCAATGGCTGCCCTTACAGCCTCCCCTGCTGTAGGACTGTCCGAAACATTCAGCAAGTTGAAGGAACAAGGCAAGGTTGCATTTATCCCCTACATCACTGCTGGGG
ATCCTGATCTTTCCACCACGGCTGAAGCATTGAAGGCTGCAGCTACTCGGTCCTTGGCTAGAGGGACAAATTTTAGCGCAATCATTTCTATGCTGAAGGAGGTGATTCCT
GAACTATCTTGCCCAATTGCCCTTTTTTCATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCATTGAGAACTTCATGATTACAATAAAAGATGCTGGTGTACGAGGGCTTGTTGT
TCCGGATGTTCCTCTCGAGGAGACCGAAATTTTGAGAAAAGAAGCTGTAAAGCACAATATTGAGCTGGTACTCTTGACTACACCAACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAG
CCATCGTTGAAGCTTCAGAGGGCTTTGTATATCTTGTGAGCTCTGTTGGAGTTACCGGTGCCCGTGCATCAGTGAGTGATAAAGTTCAAACTCTCCTAGAGGAAATTAAA
GAGGTAACCGAAAAACCAGTAGCAGTAGGTTTTGGTATATCGAAACCCGAGCACGTAAAACAGGTGGCTAGCTGGGGGGCTGATGGCATCATAGTTGGCAGTGCCATGGT
GAAGCTGTTGGGTGAAGCTCAGACTCCTGAAGAAGGATTGAAGGCACTTGAAAACTTCACCAAAACCTTAAAATCTGCACTCTCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFNSSRLLRFNKIPTTLIFPPHPCKISVFQSKRLVPMAALTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIP
ELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMITIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEEIK
EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQTPEEGLKALENFTKTLKSALS