CuGenDBv2

Gene ID	Spg038180
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	protein SAMBA isoform X2
Genome location	scaffold12:41008868..41010926
RNA-Seq Expression	Spg038180
Synteny	Spg038180
Gene Ontology terms	GO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process) GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domains	IPR037547 - Protein SAMBA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022131247.1 protein SAMBA isoform X1 [Momordica charantia]

7.9e-27

53.16

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMS                                                   
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS

Query:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                             ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+W+FEGPRSRINLMSRQ
Subjt:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

XP_022131248.1 protein SAMBA isoform X2 [Momordica charantia]

7.9e-27

53.16

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMS                                                   
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS

Query:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                             ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+W+FEGPRSRINLMSRQ
Subjt:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

XP_022149249.1 protein SAMBA-like isoform X1 [Momordica charantia]

3.0e-26

52.53

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MS                                                   
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS

Query:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                             ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRS INLMSRQ
Subjt:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

XP_022149251.1 protein SAMBA-like isoform X2 [Momordica charantia]

3.0e-26

52.53

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MS                                                   
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS

Query:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                             ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRS INLMSRQ
Subjt:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

XP_038888367.1 protein SAMBA isoform X1 [Benincasa hispida]

8.7e-26

50.63

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS
        MN+SSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDEAM+                                                   
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS

Query:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                             ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRSRINLMS+Q
Subjt:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LK11 Uncharacterized protein

3.6e-25

48.73

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+                                                   
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS

Query:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                             ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRSRINLMSRQ
Subjt:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

A0A6J1BQF8 protein SAMBA isoform X1

3.8e-27

53.16

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMS                                                   
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS

Query:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                             ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+W+FEGPRSRINLMSRQ
Subjt:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X2

3.8e-27

53.16

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMS                                                   
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS

Query:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                             ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+W+FEGPRSRINLMSRQ
Subjt:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

A0A6J1D582 protein SAMBA-like isoform X1

1.5e-26

52.53

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MS                                                   
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS

Query:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                             ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRS INLMSRQ
Subjt:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

A0A6J1D7T9 protein SAMBA-like isoform X2

1.5e-26

52.53

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MS                                                   
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDAS

Query:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                             ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRS INLMSRQ
Subjt:  SFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9C613 Protein SAMBA

2.2e-11

33.33

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDA
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM V                                                 
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDA

Query:  SSFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                               LK+++M  L+KEVKSL++D+W+FEGPRSRI+L+SR+
Subjt:  SSFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G32310.1 unknown protein

1.5e-12

33.33

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDA
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM V                                                 
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDA

Query:  SSFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ
                               LK+++M  L+KEVKSL++D+W+FEGPRSRI+L+SR+
Subjt:  SSFFYECMLKFHREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQ

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAATAGCTCGTCACCAGCTAATTCTTCGATTTCTACCACAGCGGTTGCTGGAAGATGTAGCACCAATGCCGCAATGTCAGTTGACGATTTTCGCTTCCCCGCCAATTT
AATATCTATACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGAGCGTGCTATGTGCTCCCACCAATATACAATGTGAAACATACGAGCATTTGGCTAACTCTGCAATGAATGATGCGG
TCTATTACGTAGAGAAGGGAACGAAAATTTTGCCTTTTCTAGAGACAAACCTTGAGTTGTTAGGAGGAGATGATGCATCCTCATTTTTTTACGAATGTATGTTAAAATTT
CACAGAGAAGGTTTGAGTTTTCTGTGGGTTGCAGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCACTGAACAAGGAGGTCAAGTCCCTGGATGATGATAACTGGATTTTTGAAGG
TCCTCGCTCCCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGAATGGAAGGACCAGCAAAGCTTTGCTGACAACTACTTGAATGCAGCAATTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSVLCAPTNIQCETYEHLANSAMNDAVYYVEKGTKILPFLETNLELLGGDDASSFFYECMLKF
HREGLSFLWVAALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQEWKDQQSFADNYLNAAI

Spg038180 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome